| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 872,925 | A→G | intergenic (+124/‑54) | gsiD → / → pdeI | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiD/putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 872,925 | 0 | A | G | 100.0% | 90.4 / NA | 25 | intergenic (+124/‑54) | gsiD/pdeI | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiD/putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/13); total (12/13) | |||||||||||
TAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTT > NC_000913/872792‑873060 | tAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAAttt > 1:248952/1‑140 (MQ=255) tACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGca < 1:25982/140‑1 (MQ=255) aCGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGcac < 2:127948/140‑1 (MQ=255) tttGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGc > 1:386210/1‑140 (MQ=255) ttGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGAt < 2:248952/140‑1 (MQ=255) cTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGt > 1:129243/1‑140 (MQ=255) cTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGt > 2:7618/1‑140 (MQ=255) cTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGt > 1:180425/1‑140 (MQ=255) aaTCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTaa < 2:105142/140‑1 (MQ=255) gAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATg < 1:7618/140‑1 (MQ=255) tattGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAg < 2:386210/140‑1 (MQ=255) cccTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTtat > 1:277775/1‑140 (MQ=255) aGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTGGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAATCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCt < 2:292291/127‑1 (MQ=255) aGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTGGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCt > 1:292291/1‑127 (MQ=255) aGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGaa < 2:180425/140‑1 (MQ=255) tgttgtAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAaaagata > 1:75306/1‑140 (MQ=255) tAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAaaagataaagat > 1:124826/1‑140 (MQ=255) aaCTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAaagataaagata > 1:235392/1‑140 (MQ=255) ctgctgATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAaaagat < 1:75849/127‑1 (MQ=255) ctgctgATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAaaagat > 2:75849/1‑127 (MQ=255) gggTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTgg < 2:75306/140‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATtttatttttatt < 2:265750/130‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATtttatttttatt > 1:265750/1‑130 (MQ=255) gcagcaAGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTc < 2:129243/140‑1 (MQ=255) aGGGGCAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCtttttt < 2:235392/140‑1 (MQ=255) | TAAAGGATAGTTACGTTTGAATATTGCTTGAAAGGGTAATCACCTCACAGGAAATTATTGCCCTAAGCAAGTGTTGTAACTTTCTGCTGATTTTGTAGAATCGGGTAATTTGGTTAAAAAGCCGCAGCAAGGGACAATTTTTGCAGCGGCACAGCGTTCAGATAGTTATTTTGTTAAATGTATTAACATGCTGAGTTTATACGAAAAGATAAAGATAAGGCTGATAATTTTATTTTTATTGGCAGCACTGTCATTTATTGGTCTTTTTT > NC_000913/872792‑873060 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |