| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,481,669 | A→G | Y254C (TAC→TGC) | ynbD → | putative phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,481,669 | 0 | A | G | 100.0% | 27.9 / NA | 9 | Y254C (TAC→TGC) | ynbD | putative phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (4/5); total (4/5) | |||||||||||
AATCAAAATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTCTATGCGTTGGTTTTGTCGTCGCC > NC_000913/1481532‑1481794 | aaTCAAAATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCg > 1:159271/1‑140 (MQ=255) tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa < 1:246901/140‑1 (MQ=255) tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa < 1:285544/140‑1 (MQ=255) tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAggg > 1:360276/1‑140 (MQ=255) cgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt < 2:360276/140‑1 (MQ=255) atgatgatgATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTa < 2:159271/140‑1 (MQ=255) ccAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACA‑GGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTCTATg > 1:401989/1‑140 (MQ=255) aCTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTCTATGCGTTGGTTTTgtc > 2:147844/1‑140 (MQ=255) tAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACA‑GGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTCTATGCGTTGGTTTTGTCGTCGcc < 2:401989/140‑1 (MQ=255) | AATCAAAATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGCCCGCCGTTTACTGGCTGACATTGCCCTGCCGCATCGGGATGTGGCTGTCTATGCGTTGGTTTTGTCGTCGCC > NC_000913/1481532‑1481794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |