| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 561,696 | (G)6→7 | coding (2000/2604 nt) | sfmD → | putative fimbrial usher protein SfmD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 561,690 | 1 | . | G | 96.7% | 212.5 / ‑0.1 | 61 | coding (1994/2604 nt) | sfmD | putative fimbrial usher protein SfmD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (28/31); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
AGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGT > NC_000913/561557‑561807 | aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gg < 1:741740/140‑1 (MQ=255)aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gg < 1:34825/140‑1 (MQ=255)aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gg < 1:772707/140‑1 (MQ=255) gctggctgGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑ggg < 2:306297/140‑2 (MQ=255) gctggctgGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑ggg < 1:678518/140‑2 (MQ=255) ctggctggCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gggc > 1:560378/1‑138 (MQ=255) gctggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gggcggg > 2:32879/1‑135 (MQ=255) ctggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGt < 2:259988/140‑1 (MQ=255) tggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGta > 1:346969/1‑140 (MQ=255) aGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGAc < 2:186849/140‑1 (MQ=255) gTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGAccc > 1:766965/1‑139 (MQ=255) gACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGAt > 2:663687/1‑140 (MQ=255) gACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gggcgggg > 1:183104/1‑117 (MQ=255) gACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg‑gggcgggg < 2:183104/123‑7 (MQ=255) aCCTCACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGGATAACTACGACCGCGATc > 2:219694/1‑140 (MQ=255) cTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCaa > 1:355068/1‑140 (MQ=255) ttACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAAc < 2:150196/140‑1 (MQ=255) aCTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACAt > 1:952945/1‑140 (MQ=255) aGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGtt > 1:1196319/1‑140 (MQ=255) ggCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTa > 1:253759/1‑140 (MQ=255) ccACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAAc > 1:848079/1‑140 (MQ=255) cacaACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACt > 1:1018847/1‑140 (MQ=255) caACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTgg < 1:511832/140‑1 (MQ=255) ccTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAg < 1:696526/140‑1 (MQ=255) ccTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAg < 2:511374/140‑1 (MQ=255) ccTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAg < 2:848079/140‑1 (MQ=255) ccTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAg < 2:1173884/140‑1 (MQ=255) gAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTg < 2:346969/140‑1 (MQ=255) aTCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTgg > 1:960057/1‑140 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCg > 1:230384/1‑140 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCg > 1:1192995/1‑140 (MQ=255) cGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgt < 1:32879/140‑1 (MQ=255) tAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtgt > 2:873329/1‑140 (MQ=255) tAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtgt > 1:785536/1‑140 (MQ=255) aGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTgg > 2:710397/1‑140 (MQ=255) gCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGt < 2:253759/140‑1 (MQ=255) gCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGt < 2:230384/140‑1 (MQ=255) aGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCgg < 1:663687/140‑1 (MQ=255) ggTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGc > 1:543777/1‑140 (MQ=255) gTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCa > 2:1020129/1‑140 (MQ=255) tGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCAt < 2:46832/140‑1 (MQ=255) aTACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGa > 2:1167150/1‑140 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCg > 2:417975/1‑123 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCg < 1:417975/123‑1 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGaa > 2:835010/1‑140 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGaa > 2:1103705/1‑140 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGGTGGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGaa > 2:420413/1‑140 (MQ=255) cGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATgg > 2:581045/1‑140 (MQ=255) aataatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCa < 2:365154/140‑1 (MQ=255) ataatGGGTACCCGGGCAGGGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCAt < 1:1085019/140‑1 (MQ=255) gggTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGc > 1:1127572/1‑140 (MQ=255) ggTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCGGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTAAAACAACGACGGCGAGCAACATGCCGTTAACTGGCGGCGGCTTGGCGGCGGGGTCGGGCATTAAAAGGGCATAACCCt > 2:1085019/1‑140 (MQ=255) tACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGa > 1:704910/1‑140 (MQ=255) acacGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGag > 2:115566/1‑140 (MQ=255) cacGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagc < 2:1192995/140‑1 (MQ=255) cacGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagc < 1:873329/140‑1 (MQ=255) acGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagcc < 1:1020129/140‑1 (MQ=255) acGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagcc < 1:1167150/140‑1 (MQ=255) acGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGGTGGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATG‑AAATGGCATAACGCTGagcca < 1:420413/140‑1 (MQ=255) cGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagcca < 2:960057/140‑1 (MQ=255) gggCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagccag > 2:1154250/1‑140 (MQ=255) ggCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagcca > 2:1170262/1‑138 (MQ=255) ggCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagcca < 1:1170262/138‑1 (MQ=255) gCAGTGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagccagcc < 2:1127572/140‑1 (MQ=255) cgcCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTa < 2:195850/140‑1 (MQ=255) ccACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAgg < 1:710397/140‑1 (MQ=255) ccACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAgg < 2:543777/140‑1 (MQ=255) cACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAggg < 1:1103705/140‑1 (MQ=255) aaCTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCa < 1:1154250/140‑1 (MQ=255) ggCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGt < 2:785536/140‑1 (MQ=255) ggCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGt < 1:115566/140‑1 (MQ=255) | AGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGG‑GGCGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGT > NC_000913/561557‑561807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |