| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 956,966 | +T | coding (205/693 nt) | ycaP → | DUF421 domain‑containing protein YcaP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 956,962 | 1 | . | T | 94.4% | 214.0 / 4.9 | 71 | coding (201/693 nt) | ycaP | DUF421 domain‑containing protein YcaP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/0); new base T (28/39); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
AAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑G‑TTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTC > NC_000913/956823‑957094 | aaGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑g < 1:49888/140‑1 (MQ=255) cACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGACCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑G‑ttttta < 1:1107152/140‑3 (MQ=255) cTACGTAGCCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑G‑tttttatg < 2:305518/140‑5 (MQ=255) cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTatgatg > 1:758991/1‑140 (MQ=255) gTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTatgatga < 1:610310/140‑1 (MQ=255) tCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGAtgtg > 2:817771/1‑140 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTatgat > 2:845768/1‑129 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTatgat < 1:845768/129‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGAt > 2:479037/1‑140 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGAt < 2:395681/140‑1 (MQ=255) ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGAt > 2:925781/1‑140 (MQ=255) ccTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGt < 1:925781/140‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCg < 2:770774/133‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCg > 1:770774/1‑133 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTcc > 1:1120364/1‑140 (MQ=255) tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTcc > 2:1135308/1‑140 (MQ=255) ttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTccc < 1:479037/140‑1 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGG‑TTTTATGATGATGTGCCg > 1:737493/1‑131 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCg < 2:737493/131‑1 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCg > 2:1197802/1‑140 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCg > 1:870695/1‑140 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCg > 2:836685/1‑140 (MQ=255) tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTAACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCg > 2:228491/1‑140 (MQ=255) gTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGGGATGTGGC‑GTTTTTTTGATGATGTGCCGATGGTTCCgg > 2:720865/1‑140 (MQ=255) gTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCgg < 2:283918/140‑1 (MQ=255) gTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCgg < 2:1120364/140‑1 (MQ=255) gTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCgg < 1:1135308/140‑1 (MQ=255) tACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGGGATGTGGC‑GTTTTTATTATGATGTGCCGGTGGGCCCggg > 2:39646/1‑139 (MQ=255) ggTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACtt < 1:817771/140‑1 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGGGGGGTGGA‑GCTTTTTTTATTTTTTGCCCCTGGGCCCGGTACttt > 2:309386/1‑139 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGGGATGTGGCGG‑TTTTTTGATGATGTGCCGATGGGCCCGGTACTTa > 2:93999/1‑140 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGGGATGTGGC‑GTTTTTATTATGATGTGCCGGTGGTCCCGGTACttt > 2:984094/1‑139 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACttt > 1:1054542/1‑139 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTa > 2:32469/1‑140 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTa > 1:213712/1‑140 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTa > 1:440906/1‑140 (MQ=255) gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTa > 1:722508/1‑140 (MQ=255) cTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATc < 1:309386/140‑1 (MQ=255) ccTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTttatt > 1:148474/1‑140 (MQ=255) cAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTAct > 1:634358/1‑140 (MQ=255) cAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTAct < 1:377525/140‑1 (MQ=255) cAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTAct < 1:457572/140‑1 (MQ=255) aTGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:870695/140‑1 (MQ=255) aTGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 1:39646/140‑1 (MQ=255) aTGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 1:1197802/140‑1 (MQ=255) tGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGc > 2:375996/1‑140 (MQ=255) gACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCg < 2:213712/140‑1 (MQ=255) gAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCg < 1:864835/135‑1 (MQ=255) gAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCg > 2:864835/1‑135 (MQ=255) gACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 2:547133/140‑1 (MQ=255) gACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 1:204661/140‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATAcc > 2:468193/1‑140 (MQ=255) cgcgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATAcc < 2:440906/140‑1 (MQ=255) gcgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCg < 1:93999/140‑1 (MQ=255) gcgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCg < 2:758991/140‑1 (MQ=255) cgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGc < 1:984094/140‑1 (MQ=255) gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg > 1:468397/1‑122 (MQ=255) gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:468397/122‑1 (MQ=255) gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGcc > 2:284276/1‑137 (MQ=255) gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGcc < 1:284276/137‑1 (MQ=255) gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTgg < 2:148474/140‑1 (MQ=255) cGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGG‑TTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTaa > 2:318083/1‑140 (MQ=255) aTGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGt > 2:747745/1‑140 (MQ=255) gcttGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg < 2:1132744/138‑1 (MQ=255) gTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg < 2:882348/140‑1 (MQ=255) ttGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGca < 1:747745/140‑1 (MQ=255) ttGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGca < 1:836685/140‑1 (MQ=255) gTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTg < 2:636537/140‑1 (MQ=255) tAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTTTTATGATGTGCCGCTGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTTTTTCTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGaaaa > 2:433191/1‑140 (MQ=255) tAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGaaaa > 2:150638/1‑140 (MQ=255) ttCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGa < 2:81328/140‑1 (MQ=255) cTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAg < 1:468193/140‑1 (MQ=255) cTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAg < 1:150638/140‑1 (MQ=255) cTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAg < 1:720865/140‑1 (MQ=255) tGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTTTGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGGAATGTGGTTGATGGCGCCCAGTGAAAAACTGGAAGa > 2:1118278/1‑140 (MQ=255) ggATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTgg > 1:287805/1‑140 (MQ=255) aTCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGaa > 1:598845/1‑140 (MQ=255) cAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg < 1:375996/140‑1 (MQ=255) cAGCGGCGGGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg < 1:483375/140‑1 (MQ=255) cggGAGATGTGGCGG‑TTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCCGGGAATGTGGTTGATTGCGCACAGGGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGcc > 2:483375/1‑140 (MQ=255) cggGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGcc > 1:738194/1‑140 (MQ=255) cggGAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGGAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGcc > 1:83577/1‑140 (MQ=255) ggAGATGTGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAg > 2:1097780/1‑140 (MQ=255) ggAGATGGGGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAg > 2:145733/1‑140 (MQ=255) tgtgGC‑GTTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTc > 1:384415/1‑140 (MQ=255) | AAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGC‑G‑TTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTC > NC_000913/956823‑957094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |