Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 343,869 | A→G | E329G (GAG→GGG) | yahK → | aldehyde reductase, NADPH‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 343,869 | 0 | A | G | 98.4% | 224.1 / ‑4.4 | 63 | E329G (GAG→GGG) | yahK | aldehyde reductase, NADPH‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (33/29); total (34/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.23e-01 |
GCCGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAA > NC_000913/343740‑344008 | gCCGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAAtgctg > 2:620159/1‑140 (MQ=255) gCCGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAAtgctg > 1:914405/1‑140 (MQ=255) cGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTgcg > 1:246311/1‑140 (MQ=255) cGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTgcg < 1:42889/140‑1 (MQ=255) tGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGcgcg > 2:851261/1‑140 (MQ=255) tGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGcgcg < 2:532838/140‑1 (MQ=255) tGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGcgcg < 1:432148/140‑1 (MQ=255) tGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGcgcg < 1:620159/140‑1 (MQ=255) gCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGAtgt > 1:956511/1‑140 (MQ=255) ttCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAat > 1:306878/1‑140 (MQ=255) tGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGt < 2:246311/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGtt < 1:668451/140‑1 (MQ=255) tGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTg < 2:306878/140‑1 (MQ=255) tGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTg < 1:757301/140‑1 (MQ=255) ggcggcATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGt > 2:978242/1‑140 (MQ=255) ggcggcATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGt > 2:111423/1‑140 (MQ=255) ggcggcATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGt > 1:1016121/1‑140 (MQ=255) ttCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTg > 2:513812/1‑132 (MQ=255) ttCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTg < 1:513812/132‑1 (MQ=255) ttCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGAt > 1:814207/1‑140 (MQ=255) ttCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATACCGTTTTGTTATCGAt > 2:131331/1‑140 (MQ=255) ccAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATaa < 1:634216/140‑1 (MQ=255) cAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAAt < 2:29176/140‑1 (MQ=255) aGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTa > 2:1209780/1‑140 (MQ=255) aTGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAGTGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGa > 2:966478/1‑140 (MQ=255) aTGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGca < 1:759191/130‑1 (MQ=255) aTGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGca > 2:759191/1‑130 (MQ=255) aTGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGa > 2:567268/1‑140 (MQ=255) aTTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGaaaa > 2:1148237/1‑140 (MQ=255) aTGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc < 1:610789/140‑1 (MQ=255) ggCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg > 1:18306/1‑140 (MQ=255) ggCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg < 1:1003220/140‑1 (MQ=255) ggCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg < 1:224892/140‑1 (MQ=255) ggCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg < 1:851261/140‑1 (MQ=255) cGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGTGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc > 1:647164/1‑133 (MQ=255) cGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGTGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc < 2:647164/133‑1 (MQ=255) cGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc > 2:796785/1‑133 (MQ=255) cGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc < 1:796785/133‑1 (MQ=255) gTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGttt < 1:111423/140‑1 (MQ=255) gTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGttt < 2:153573/140‑1 (MQ=255) gTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGttt < 1:965683/140‑1 (MQ=255) ggCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTaa < 1:452806/140‑1 (MQ=255) agaTGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACtt > 2:737612/1‑140 (MQ=255) atgatTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCg < 1:1119208/140‑1 (MQ=255) gatTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGct > 1:151641/1‑140 (MQ=255) atTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctc > 2:664392/1‑140 (MQ=255) atTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctc > 2:503465/1‑140 (MQ=255) ggCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATTGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGct < 2:52889/134‑1 (MQ=255) ggCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATTGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGct > 1:52889/1‑134 (MQ=255) ggCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACt > 1:852270/1‑129 (MQ=255) ggCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACt < 2:852270/129‑1 (MQ=255) gATCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTaa > 1:1132879/1‑140 (MQ=255) aTCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAAc > 1:525253/1‑140 (MQ=255) tCAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACt > 1:121247/1‑140 (MQ=255) cAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACtt < 2:525253/140‑1 (MQ=255) cAAATTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACtt < 1:978242/140‑1 (MQ=255) aaTTAATGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACtttt < 2:1016121/140‑1 (MQ=255) tGAAGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTa > 1:1213729/1‑140 (MQ=255) aGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAgg > 2:1214020/1‑140 (MQ=255) aGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAgg > 2:737518/1‑140 (MQ=255) aGCCTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAgg > 1:877136/1‑140 (MQ=255) ccTATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGgag > 1:608745/1‑140 (MQ=255) tATGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATTCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGagag < 2:143458/140‑1 (MQ=255) aTGGGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGc < 2:956511/140‑1 (MQ=255) aGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGaa < 1:737612/140‑1 (MQ=255) | GCCGTGCGATAGCCGGTTCTATGATTGGCGGCATTCCAGAAACTCAGGAGATGCTCGATTTTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAA > NC_000913/343740‑344008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |