| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,353,474 | G→A | Q193* (CAG→TAG) | yhcC ← | radical SAM family oxidoreductase YhcC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,353,474 | 0 | G | A | 98.7% | 244.7 / ‑4.3 | 74 | Q193* (CAG→TAG) | yhcC | radical SAM family oxidoreductase YhcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (41/32); total (41/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
CAGTTCAATACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTGCCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGTTTTGTCGTGGGC > NC_000913/3353337‑3353606 | cAGTTCAATACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTGcc > 2:1115807/1‑140 (MQ=255)cAGTTCAATACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTAcc < 1:213071/140‑1 (MQ=255) gTTCAATACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCt > 1:776671/1‑140 (MQ=255) tACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACCCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCca < 1:747298/140‑1 (MQ=255) ttCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCcaggcag > 2:422116/1‑140 (MQ=255) ttCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCcaggcag > 2:53394/1‑140 (MQ=255) ttCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCcaggcag > 2:369109/1‑140 (MQ=255) ttCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCcaggcag > 2:979687/1‑140 (MQ=255) ttCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCcaggcag > 1:97137/1‑140 (MQ=255) cAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCaggcaggc < 2:776671/140‑1 (MQ=255) cAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCaggcaggc < 1:422116/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCAGCGCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCaggcaggc < 1:327121/140‑1 (MQ=255) cGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGAc < 2:818280/140‑1 (MQ=255) cGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGAc < 1:477946/140‑1 (MQ=255) ccccGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACaa > 1:563064/1‑140 (MQ=255) cccGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTGCCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAAt < 1:1115807/140‑1 (MQ=255) cGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTa < 2:97137/140‑1 (MQ=255) cTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAg < 2:1014635/140‑1 (MQ=255) ttCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGt < 1:53394/140‑1 (MQ=255) gCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAaca < 2:468241/140‑1 (MQ=255) tCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACAcc > 2:1220474/1‑140 (MQ=255) cGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCt > 2:413888/1‑140 (MQ=255) cGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCt > 1:882384/1‑140 (MQ=255) aaTGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCGACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTGCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAaca > 2:1144357/1‑129 (MQ=255) aaTGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAaca < 1:1144357/129‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCCTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCCCTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTGCCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACGCACCTTCAGcc < 2:990919/140‑1 (MQ=255) tgcCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCgcgc > 2:383487/1‑140 (MQ=255) tgcCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCgcgc > 2:15637/1‑140 (MQ=255) gcCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCt < 2:563064/140‑1 (MQ=255) ccTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTg > 2:412314/1‑140 (MQ=255) ccTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTg > 2:1135872/1‑140 (MQ=255) ccTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTg > 1:936220/1‑140 (MQ=255) tttCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGAc < 2:823412/140‑1 (MQ=255) cacaATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCGAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTg > 2:1112909/1‑140 (MQ=255) cacaATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTg > 2:614423/1‑140 (MQ=255) acaATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGc < 1:1135872/140‑1 (MQ=255) acaATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGc < 2:372973/140‑1 (MQ=255) tatGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGc > 2:210413/1‑140 (MQ=255) tatGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGc > 1:1113858/1‑140 (MQ=255) aGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGt > 2:994906/1‑140 (MQ=255) aGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGt > 2:535187/1‑140 (MQ=255) aGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGt > 2:953083/1‑140 (MQ=255) aGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGt > 2:794438/1‑140 (MQ=255) aGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGt > 1:226882/1‑140 (MQ=255) cGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTg > 2:647539/1‑140 (MQ=255) cGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTg < 1:1220474/140‑1 (MQ=255) ggATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGt < 2:882384/140‑1 (MQ=255) ggATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGt > 2:566216/1‑140 (MQ=255) ggATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGt < 1:535187/140‑1 (MQ=255) ggATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGt < 1:210413/140‑1 (MQ=255) ggATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGt < 1:994906/140‑1 (MQ=255) gCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGc > 2:931003/1‑140 (MQ=255) gCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGc > 2:540574/1‑140 (MQ=255) tttATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCAGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATa > 1:121278/1‑140 (MQ=255) tCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCaaa > 1:1006938/1‑140 (MQ=255) aCGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATc < 1:979687/140‑1 (MQ=255) ggTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGc < 2:936220/140‑1 (MQ=255) gTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGcc < 1:369109/140‑1 (MQ=255) tttCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCcg > 2:435394/1‑140 (MQ=255) tttCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCcg > 2:72016/1‑140 (MQ=255) cTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatg > 2:743698/1‑140 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatgc > 2:568561/1‑140 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatgc > 1:936062/1‑140 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatg < 2:909943/139‑1 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatg > 1:909943/1‑139 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAAGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatg > 1:432967/1‑139 (MQ=255) tCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAAGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatg < 2:432967/139‑1 (MQ=255) cTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatgcg > 2:622423/1‑138 (MQ=255) cTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatgcg < 1:622423/138‑1 (MQ=255) tCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTgatgcgatg < 1:239759/140‑1 (MQ=255) cA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCa < 1:743698/140‑1 (MQ=255) cA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCa < 1:794438/140‑1 (MQ=255) tttGCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGtt < 1:566216/140‑1 (MQ=255) gCAAACATTCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGTTTTg > 2:424002/1‑140 (MQ=255) tCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGTTTTGTCGTGGGc > 2:518148/1‑140 (MQ=255) tCAGCCTACCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGTTTTGTCGTGGGc < 1:412314/140‑1 (MQ=255) | CAGTTCAATACCGTTCAAACGCCCCGCTTCCCAGGCTTTCGCCATAATGCTGCCTTTCACAATATGCAGCGGATGCAGCTTTATGCCGTCCACGCCGGTTTCAACCACTCGCTCCA‑‑GCGTTTGCAAACATTCAGCCTGCCCTTCGCCAGGCAGGCCGACAATTAAGTGGGAACACACCTTCAGCCCGCGCTGACGTGCCAGCTGGGTTGTACGCTGATAACAGGCAAAATCATGGCCGCGGTTGATGCGATGCAGTGTTTTGTCGTGGGC > NC_000913/3353337‑3353606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |