| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,288,561 | (C)7→8 | pseudogene (354/2525 nt) | yejO ← | adhesin‑like autotransporter YejO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,288,554 | 1 | . | C | 98.8% | 297.3 / ‑3.5 | 82 | pseudogene (361/2525 nt) | yejO | adhesin‑like autotransporter YejO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (45/36); total (45/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
CCGAGACGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCG > NC_000913/2288416‑2288688 | ccGAGACGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑c < 1:375326/140‑1 (MQ=255)ccGAGACGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑c > 2:980375/1‑140 (MQ=255) cGAGACGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑cc > 1:671001/1‑140 (MQ=255) aCGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑ccccc‑c > 2:859042/1‑140 (MQ=255) gTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑ccccc‑ccca < 2:692804/140‑3 (MQ=255) tttGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑ccccc‑cccat > 2:410694/1‑137 (MQ=255) gAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCa < 1:575361/140‑1 (MQ=255) cTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGAtt > 2:385266/1‑140 (MQ=255) cTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGAtt > 2:270656/1‑140 (MQ=255) ccATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTaa > 2:629675/1‑140 (MQ=255) ccATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTaa > 1:451948/1‑140 (MQ=255) tGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAgcg > 1:190857/1‑140 (MQ=255) tGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCG‑CTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAgcgc > 1:32623/1‑140 (MQ=255) ggCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAgcgc < 2:671001/140‑1 (MQ=255) cgcgTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGcgcccgc > 1:480128/1‑140 (MQ=255) cgTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGCC‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGcgcccgcc > 2:139963/1‑140 (MQ=255) cgTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCt > 2:597185/1‑140 (MQ=255) gTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCtt > 1:1015757/1‑140 (MQ=255) ttgttTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAAt > 2:884021/1‑140 (MQ=255) ttttaAATAGCCCCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCg < 2:293799/139‑1 (MQ=255) gttTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCg < 2:480128/140‑1 (MQ=255) aTAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTAt > 1:899346/1‑140 (MQ=255) aGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCa > 2:1107508/1‑140 (MQ=255) aGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCa > 2:456359/1‑140 (MQ=255) cACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGATGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCAtt > 1:318798/1‑140 (MQ=255) cACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCAtt > 2:330391/1‑140 (MQ=255) cACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCAtt < 1:859042/140‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTg > 1:306131/1‑131 (MQ=255) aCCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTg < 2:306131/131‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTc > 2:24528/1‑140 (MQ=255) aCCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTAAACGTTTAGGCGCCCGCTTTTAATCTGGGTATCAtcc > 2:841299/1‑138 (MQ=255) ccGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCg > 1:561355/1‑140 (MQ=255) gCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCt < 1:410694/140‑1 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGCCCCCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGc > 1:884448/1‑140 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg < 1:672685/140‑1 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg < 2:899346/140‑1 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg < 1:330391/140‑1 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg > 1:671485/1‑140 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg > 1:468030/1‑140 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg < 1:270656/140‑1 (MQ=255) ccTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTg > 2:956386/1‑140 (MQ=255) ttCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCAt < 1:385266/140‑1 (MQ=255) cTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATaa > 2:858483/1‑140 (MQ=255) cTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATaa < 1:311630/140‑1 (MQ=255) cTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTg < 1:956386/140‑1 (MQ=255) cTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTg < 1:238805/140‑1 (MQ=255) tACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGt > 1:160185/1‑140 (MQ=255) tACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGt > 1:156195/1‑140 (MQ=255) tACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGt > 2:857846/1‑140 (MQ=255) ccGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAg < 1:570137/140‑1 (MQ=255) ccGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAg < 2:74810/140‑1 (MQ=255) ccGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑CCCCCTCCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAg < 2:942714/140‑1 (MQ=255) cGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGc > 2:444204/1‑140 (MQ=255) gcaaatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGca < 1:858483/140‑1 (MQ=255) gcaaatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGca < 2:451948/140‑1 (MQ=255) caaatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGcac > 1:580231/1‑140 (MQ=255) aatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGca < 2:603627/137‑1 (MQ=255) aatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGca > 1:603627/1‑137 (MQ=255) aatgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCacac > 1:782413/1‑140 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCa > 2:543123/1‑122 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCa < 1:543123/122‑1 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCa < 2:190857/140‑1 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCa < 2:32623/140‑1 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCa < 2:156195/140‑1 (MQ=255) tgcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCa < 1:456359/140‑1 (MQ=255) gcaaatCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGCC‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCa < 1:139963/140‑1 (MQ=255) ccTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGt > 2:1500/1‑140 (MQ=255) ctctTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTa > 1:140961/1‑140 (MQ=255) ctTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGt > 2:1104541/1‑140 (MQ=255) cAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGcc > 2:482109/1‑140 (MQ=255) cAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGcc > 2:712887/1‑140 (MQ=255) agtagtCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCcg > 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ctccCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCAcc < 2:645096/140‑1 (MQ=255) ctccCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCAcc > 1:62504/1‑140 (MQ=255) ctccCTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCAcc > 1:1144621/1‑140 (MQ=255) ccTTTTCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCAt < 2:1064219/140‑1 (MQ=255) tttCGATAGCGACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTg < 2:1015757/140‑1 (MQ=255) gACAAAGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGa < 2:203572/140‑1 (MQ=255) aaGACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAAc > 2:598940/1‑140 (MQ=255) gACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCg < 2:828245/140‑1 (MQ=255) gACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCg < 1:927980/140‑1 (MQ=255) gACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCg < 1:406407/140‑1 (MQ=255) gACGGC‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCg < 1:24528/140‑1 (MQ=255) | CCGAGACGGTTTGTTCCGAATACCTCCATGGCCCGCGTGGTTGTTTTAATAGCACCGCCTGCTTTCTGATCTACCGCAAATGCAAATCCCCCCTCTTTAACCTCCAGTAGTCCTCCCTTTTCGATAGCGACAAAGACGG‑‑‑CCCCC‑CCATCTTTTTCAACGATTAAGCGCCCGCCTTTAATCGTGGTATCATTCGCTGCGCCATAAACCTGTAGCACACCATTATTGAGCGTAGTCTGGTTTGCCGCGCCACCCATTTGAACAATTTGATAACCG > NC_000913/2288416‑2288688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |