| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 56,684 | C→T | M142I (ATG→ATA) | lptD ← | lipopolysaccharide assembly protein LptD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 56,684 | 0 | C | T | 98.6% | 251.4 / ‑4.3 | 72 | M142I (ATG→ATA) | lptD | lipopolysaccharide assembly protein LptD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (29/42); total (29/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
TAATTTCGCTACCTACCACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACCATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGT > NC_000913/56548‑56819 | taatTTCGCTACCTACCACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATc < 2:1079266/140‑1 (MQ=255) tttCGCTACCTACCACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTgg > 1:524672/1‑140 (MQ=255) tacctaccACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCa < 2:455397/140‑1 (MQ=255) acctaccACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACCATCTGGTAATCAc < 1:459096/140‑1 (MQ=255) tCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACg > 1:1101792/1‑140 (MQ=255) tCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACg > 2:231375/1‑140 (MQ=255) tCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACg > 2:1072158/1‑140 (MQ=255) ccAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCa > 2:975423/1‑135 (MQ=255) ccAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCa < 1:975423/135‑1 (MQ=255) cAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGtt > 1:211403/1‑140 (MQ=255) cAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCt > 1:80829/1‑140 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGAc < 1:457882/129‑1 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGAc < 1:643267/129‑1 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGAc > 2:457882/1‑129 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGAc > 2:643267/1‑129 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCtt < 1:215692/140‑1 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCtt < 2:1101792/140‑1 (MQ=255) aGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCtt > 1:892316/1‑140 (MQ=255) aaCCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTg < 2:211403/140‑1 (MQ=255) cccGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGgt > 1:1129947/1‑140 (MQ=255) ccGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGgtg > 2:215925/1‑140 (MQ=255) cAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTg > 1:434687/1‑133 (MQ=255) cAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTg < 2:434687/133‑1 (MQ=255) aGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAg > 1:397922/1‑140 (MQ=255) gACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGa < 1:33803/140‑1 (MQ=255) ggTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGccc > 2:1147519/1‑140 (MQ=255) tAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAg < 2:114108/140‑1 (MQ=255) tAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAg < 1:523266/140‑1 (MQ=255) aCCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCa > 1:1018969/1‑132 (MQ=255) aCCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCg < 2:439349/140‑1 (MQ=255) aCCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTACGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCa < 2:1018969/132‑1 (MQ=255) ccGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCgg < 1:1072158/140‑1 (MQ=255) ccGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCgg < 2:397922/140‑1 (MQ=255) ccGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCgg < 2:1010686/140‑1 (MQ=255) ccGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCgg < 1:1159248/140‑1 (MQ=255) ccGTTACCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCgg < 1:392947/140‑1 (MQ=255) cGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGc > 2:555430/1‑140 (MQ=255) cGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGc < 2:886053/140‑1 (MQ=255) cGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGc < 1:515024/140‑1 (MQ=255) gTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTTGGcc > 2:109330/1‑140 (MQ=255) tATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCt > 2:1092076/1‑140 (MQ=255) aTCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCtt > 1:871511/1‑140 (MQ=255) aTCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCtt < 1:405402/140‑1 (MQ=255) aGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAg < 2:871511/140‑1 (MQ=255) gAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAgg < 1:231375/140‑1 (MQ=255) gAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAgg < 1:568812/140‑1 (MQ=255) gAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAgg < 1:1147519/140‑1 (MQ=255) aaTGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGa > 1:651532/1‑140 (MQ=255) gTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCAc < 2:524672/140‑1 (MQ=255) tataGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCAcc > 2:846890/1‑140 (MQ=255) tataGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCAcc > 1:645712/1‑140 (MQ=255) taGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTg > 1:502264/1‑140 (MQ=255) tttCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTAtcg < 2:1100730/140‑1 (MQ=255) tttCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTAtcg < 1:215925/140‑1 (MQ=255) ttCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTAtcgt > 2:901720/1‑140 (MQ=255) ccACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTa < 2:645712/140‑1 (MQ=255) cACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCTACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTaa < 2:150937/140‑1 (MQ=255) ttgttTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGa < 2:651532/140‑1 (MQ=255) atcaGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTAcc < 2:404898/140‑1 (MQ=255) atcaGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTAcc < 2:502264/140‑1 (MQ=255) aGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTa > 2:566843/1‑125 (MQ=255) aGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTa < 1:566843/125‑1 (MQ=255) aGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAg < 1:1072734/140‑1 (MQ=255) tCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAgcgc < 1:555430/140‑1 (MQ=255) tCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAg < 1:872832/137‑1 (MQ=255) tCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAg > 2:872832/1‑137 (MQ=255) cGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCAt > 1:646975/1‑140 (MQ=255) gCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATc < 2:559025/140‑1 (MQ=255) tttACCGCGACCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCaa < 1:176869/140‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGgtacgta < 1:901720/140‑1 (MQ=255) cTGGCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCg > 2:505822/1‑140 (MQ=255) ggCGACCCACTATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGc < 1:505822/140‑1 (MQ=255) ccactaTCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGt > 1:325394/1‑140 (MQ=255) ccactaTCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGt > 2:126485/1‑140 (MQ=255) ccactaTCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGt > 1:963877/1‑140 (MQ=255) ccactaTCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGCCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGt > 1:41940/1‑140 (MQ=255) | TAATTTCGCTACCTACCACGCTCCAGGTGTCAGAACCCGGCAGACAGGAGGTAAAGCTACCGTTATCCAGAATGGTATAGCGGTTTTCGCCACGTTGTTTCATCAGGTCCGCTTTACCGCGACCCTGGCGACCCACCATCTGGTAATCACCTTCCCAGACGTTGGTATCTTTGGTGTTCAGATTCGCCCAGCCTTTCGGCCCTTTGAGGATCACCTGGTTATCGTCGTAATGGACATTACCGAGCGCATCAACGGTACGTACCGGCTCCGGT > NC_000913/56548‑56819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |