| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,665,903 | A→G | S197G (AGC→GGC) | clcB → | putative chloride:H(+) antiporter ClcB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,665,903 | 0 | A | G | 96.0% | 248.0 / 0.2 | 74 | S197G (AGC→GGC) | clcB | putative chloride:H(+) antiporter ClcB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (33/38); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.47e-01 | |||||||||||
GGCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTAGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGT > NC_000913/1665767‑1666035 | ggCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGTAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCa < 2:621555/140‑1 (MQ=255)ggCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCa < 2:849007/140‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAAt > 1:715369/1‑140 (MQ=255) cgcgGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATc > 1:1020243/1‑140 (MQ=255) gcggcgGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCt > 1:104452/1‑140 (MQ=255) gcggcgGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCt > 2:1083117/1‑140 (MQ=255) ggcggGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGa < 2:230774/140‑1 (MQ=255) aaTGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATc < 1:696415/140‑1 (MQ=255) ggCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGAcg < 2:1020243/140‑1 (MQ=255) cccGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCTGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACa > 1:739572/1‑140 (MQ=255) cccGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACa > 1:706252/1‑140 (MQ=255) cccGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACa < 1:128715/140‑1 (MQ=255) cGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAAc > 1:337356/1‑140 (MQ=255) atttatAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGa < 2:104452/140‑1 (MQ=255) taGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGtt > 1:142575/1‑140 (MQ=255) gCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGa < 1:578286/133‑1 (MQ=255) gCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGa > 2:578286/1‑133 (MQ=255) ccGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAg > 2:1115184/1‑140 (MQ=255) cGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAgg > 1:622306/1‑140 (MQ=255) cGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAgg < 2:715369/140‑1 (MQ=255) cGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAgg < 2:680020/140‑1 (MQ=255) aaGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCt > 2:375050/1‑140 (MQ=255) aGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTc > 2:267361/1‑140 (MQ=255) cTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGtt < 1:807342/129‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGtt > 2:807342/1‑129 (MQ=255) gTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACt > 2:1003235/1‑140 (MQ=255) gTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACt > 1:967583/1‑140 (MQ=255) tGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATg < 2:967583/140‑1 (MQ=255) gCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcg < 2:142575/140‑1 (MQ=255) cACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcgc > 2:677750/1‑140 (MQ=255) cTATGATGTTGGCCTCTCTCTGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTg < 2:739572/140‑1 (MQ=255) cTATGATGTTCGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTg < 1:1083117/140‑1 (MQ=255) tgatgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGAtt < 1:801641/140‑1 (MQ=255) tgatgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGAtt > 2:746153/1‑140 (MQ=255) tgatgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGAtt > 2:794038/1‑140 (MQ=255) atgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt < 2:706252/140‑1 (MQ=255) atgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt < 2:337356/140‑1 (MQ=255) tgTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATc < 1:1115184/140‑1 (MQ=255) ttGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAg < 1:267361/140‑1 (MQ=255) tGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGt < 1:10842/140‑1 (MQ=255) ggCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTa < 1:794038/140‑1 (MQ=255) ggCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTa < 1:746153/140‑1 (MQ=255) gCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcg > 2:6983/1‑126 (MQ=255) gCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcg < 1:6983/126‑1 (MQ=255) gCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTAc > 1:366939/1‑140 (MQ=255) gCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTAc > 1:797061/1‑140 (MQ=255) gCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTAGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTAc > 1:426903/1‑140 (MQ=255) ccTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACa < 2:622306/140‑1 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcg > 2:134695/1‑124 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATgcg < 1:134695/124‑1 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt < 2:69001/132‑1 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt > 1:69001/1‑132 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAg > 2:552067/1‑140 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAg < 2:797061/140‑1 (MQ=255) ctctctCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACATACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAg > 2:637011/1‑140 (MQ=255) ctctcGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt > 2:551046/1‑130 (MQ=255) ctctcGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTAt < 1:551046/130‑1 (MQ=255) ctctcGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGgt > 2:404330/1‑140 (MQ=255) tcGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGgt > 2:94189/1‑137 (MQ=255) tcGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGgt < 1:94189/137‑1 (MQ=255) ggTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACATACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAg < 1:637011/140‑1 (MQ=255) gTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAgg > 1:547241/1‑140 (MQ=255) gTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTAGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAgg > 1:277055/1‑140 (MQ=255) ttattTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCtg > 1:642902/1‑140 (MQ=255) attTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCtgtg < 2:547241/140‑1 (MQ=255) cgccgTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGAc > 1:483796/1‑140 (MQ=255) cgccgTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGAc < 1:375050/140‑1 (MQ=255) cgccgTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGAc < 2:483796/140‑1 (MQ=255) ccgTCGTGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCa < 1:677750/140‑1 (MQ=255) cgtGGCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGCGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACtgt > 2:848750/1‑140 (MQ=255) gCATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTgttgtt < 1:552067/140‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTa < 1:495863/140‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTTAGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTa < 2:277055/140‑1 (MQ=255) gCTGGTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGCACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGt > 2:769695/1‑140 (MQ=255) gTTGGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACg < 2:1000233/135‑1 (MQ=255) | GGCCGCGGCGGGAATGGCTGCGGCCTATCGTGCCCCGCTTGCTGGCAGTTTATTTATAGCCGAAGTGCTGTTTGGCACTATGATGTTGGCCTCTCTCGGCCCGGTGATTATTTCCGCCGTCGTGGCATTGCTGGTTAGCAATCTGATTAATCATAGCGACGCGTTACTCTACAACGTACAACTCTCAGTGACGGTTCAGGCTCGTGACTATGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGT > NC_000913/1665767‑1666035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |