Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,134,136 | G→A | A506V (GCG→GTG) | wzc ← | protein‑tyrosine kinase Wzc |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,134,136 | 0 | G | A | 95.7% | 143.0 / NA | 47 | A506V (GCG→GTG) | wzc | protein‑tyrosine kinase Wzc |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (28/17); minor base C (0/2); total (28/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CACCGCCGCCAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCGCCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATACCGTGT > NC_000913/2134003‑2134270 | cACCGCCGCCAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGAt > 2:310756/1‑140 (MQ=255) cACCGCCGCCAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGAt < 2:1126532/140‑1 (MQ=255) gccgccAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGt > 1:721772/1‑140 (MQ=255) cAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGAt < 2:601054/140‑1 (MQ=255) cAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTACCCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCCCCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGc < 2:325898/140‑1 (MQ=255) gTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTg < 1:310756/140‑1 (MQ=255) ttACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGct < 1:347656/140‑1 (MQ=255) tACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTg < 2:896701/136‑1 (MQ=255) tACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTg > 1:896701/1‑136 (MQ=255) ttGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTta > 2:794330/1‑140 (MQ=255) ttGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTta > 2:658863/1‑140 (MQ=255) gACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTtata < 1:1123686/140‑1 (MQ=255) gggCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCg > 2:736260/1‑140 (MQ=255) gTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCttt > 1:1084106/1‑140 (MQ=255) gTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCttt > 1:667788/1‑140 (MQ=255) gTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCttt > 1:416709/1‑140 (MQ=255) tcatcaACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATg > 1:599147/1‑140 (MQ=255) catcaACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAAt > 2:889294/1‑129 (MQ=255) catcaACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAAt < 1:889294/129‑1 (MQ=255) atcaACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAAt > 1:1025227/1‑128 (MQ=255) atcaACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAAt < 2:1025227/128‑1 (MQ=255) acacATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAAt > 2:428070/1‑124 (MQ=255) 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atcGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCa > 2:249574/1‑140 (MQ=255) atcGCGAAGCGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCa > 1:255848/1‑140 (MQ=255) cgcgAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCAtt > 2:170607/1‑140 (MQ=255) gTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGa > 2:931587/1‑138 (MQ=255) gTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGa < 1:931587/138‑1 (MQ=255) tGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAg > 2:517597/1‑140 (MQ=255) aaaCTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCgg < 1:449179/140‑1 (MQ=255) tACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGa < 2:900948/127‑1 (MQ=255) tACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGa > 1:900948/1‑127 (MQ=255) tACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTg > 1:1109245/1‑140 (MQ=255) aGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATa < 1:153368/140‑1 (MQ=255) aGACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATa < 1:170607/140‑1 (MQ=255) aGACTACGGATGGCTTAAATCCCCAGATCGGTTGGATCCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATa < 2:290676/140‑1 (MQ=255) gACTAGGGATGGTTTCAATCACCAGATCGGTTGGATCCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAg < 2:1110162/140‑1 (MQ=255) gACTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAg < 1:794330/140‑1 (MQ=255) aCTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGa > 1:290676/1‑140 (MQ=255) aCTACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCAGGATGCTGGCATAGa > 2:886276/1‑140 (MQ=255) tACGGATGGCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACg > 2:198861/1‑140 (MQ=255) tggttcaaaTCTCCAGATCGTTTGTTTCCCCCCCCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATa < 2:667788/133‑1 (MQ=255) gCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATa > 1:77606/1‑128 (MQ=255) gCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATa < 2:77606/128‑1 (MQ=255) gCTTCAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATAcc > 2:870617/1‑140 (MQ=255) ttaaaTCCCCATATCGGTTGGATCCCCGACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATACCgt < 2:1084106/137‑1 (MQ=255) tCAATCCCCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATACCgtg < 1:414018/140‑1 (MQ=255) cAATCACCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAAtctgtctc > 1:150344/1‑133 (MQ=255) | CACCGCCGCCAGGTTGGCGCAGACAAAGGTTTTACCAATTGACGGGCTAACCCCGGTCATCATCAACACATTGTTCTGTGCCTGCATCATCGCGAAGTGCAAACTGGTACGCAGACTACGGATGGCTTCAATCGCCAGATCGGTTGGATTCCCCACCGCCAGTAGCTGGCTCTGTTTATAGCGTTTAATCCCTTTGATGGTTTTGACGCTATCACGCGCTTTCTGCCATTCCGACAGCGGGATGCTGGCATAGACGCTAATACCGTGT > NC_000913/2134003‑2134270 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |