Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,990,462 | T→C | intergenic (‑102/‑92) | yqeK ← / → ygeF | protein YqeK/protein YgeF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,990,462 | 0 | T | C | 98.7% | 283.8 / ‑4.8 | 78 | intergenic (‑102/‑92) | yqeK/ygeF | protein YqeK/protein YgeF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (41/36); total (42/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACCATTTCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGTCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTGCAACCATT > NC_000913/2990326‑2990597 | aCCATTTCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCAt > 1:335014/1‑140 (MQ=255) cATTTCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTc > 1:494654/1‑140 (MQ=255) tttCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTa > 1:663100/1‑140 (MQ=255) ttCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATTCTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTAc > 1:640928/1‑140 (MQ=255) ttCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTAc > 2:1098613/1‑140 (MQ=255) ttCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTAc > 1:254840/1‑140 (MQ=255) ttCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTAc > 1:696968/1‑140 (MQ=255) cATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGt > 2:427396/1‑140 (MQ=255) cATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGt < 2:848870/140‑1 (MQ=255) cATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGt < 1:393202/140‑1 (MQ=255) tGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATGATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGtctc > 2:795696/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGtctc > 1:466523/1‑140 (MQ=255) cGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACg > 1:893805/1‑134 (MQ=255) cGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACg < 2:893805/134‑1 (MQ=255) cGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCa > 2:848333/1‑140 (MQ=255) aTTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATTGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAgg < 1:110267/140‑1 (MQ=255) aTTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAgg < 2:24867/140‑1 (MQ=255) ttCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGt < 2:335014/140‑1 (MQ=255) ttCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGt < 1:795696/140‑1 (MQ=255) tGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGatat < 2:696968/140‑1 (MQ=255) tCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATAttt < 2:363436/140‑1 (MQ=255) cTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGa > 1:1104657/1‑140 (MQ=255) cTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGa > 1:731586/1‑140 (MQ=255) cacaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAg > 2:214449/1‑140 (MQ=255) cacaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAg > 1:1074358/1‑140 (MQ=255) cacaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAg > 1:211543/1‑140 (MQ=255) cacaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAg > 2:128346/1‑140 (MQ=255) cacaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAg > 1:521117/1‑140 (MQ=255) acaTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGc > 1:1121850/1‑140 (MQ=255) aTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATTCTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTg < 2:640928/140‑1 (MQ=255) aTTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTg < 2:211543/140‑1 (MQ=255) tACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAAt > 2:1074970/1‑140 (MQ=255) ccGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTc < 2:141263/140‑1 (MQ=255) aCTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGTCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGAtt > 2:16071/1‑140 (MQ=255) aCTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGAtt < 1:322778/140‑1 (MQ=255) aCTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGAtt > 2:334333/1‑140 (MQ=255) aCTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGAtt < 2:1121850/140‑1 (MQ=255) aCTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGAtt > 1:45147/1‑140 (MQ=255) cGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTg < 1:62561/140‑1 (MQ=255) gATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGc > 2:524987/1‑140 (MQ=255) aTGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGct < 2:731586/140‑1 (MQ=255) cTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATc > 1:373977/1‑140 (MQ=255) tCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAAt < 2:254840/140‑1 (MQ=255) aataatCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATga < 2:521117/140‑1 (MQ=255) taatCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATgaga > 2:340337/1‑140 (MQ=255) tCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGaa > 1:247159/1‑140 (MQ=255) aCCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAAt > 1:1147328/1‑140 (MQ=255) aCCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAAt > 2:635591/1‑140 (MQ=255) aCCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAAt > 2:332290/1‑140 (MQ=255) aCCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAAt > 2:690653/1‑140 (MQ=255) cTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCa < 2:636462/140‑1 (MQ=255) cTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCa < 2:663100/140‑1 (MQ=255) aaaaTTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACg > 2:946599/1‑140 (MQ=255) aaaaTTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACg < 1:427396/140‑1 (MQ=255) aaaaTTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACg < 1:332290/140‑1 (MQ=255) ttAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAat < 2:373977/140‑1 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACg > 1:375451/1‑134 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACg < 2:375451/134‑1 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAatat < 2:210625/140‑1 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAatat > 1:362956/1‑140 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAatat < 2:222924/140‑1 (MQ=255) aaTACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAatat < 1:946599/140‑1 (MQ=255) ccTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa < 1:690653/140‑1 (MQ=255) ccTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa < 1:334333/140‑1 (MQ=255) ccTAATGTGCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa < 2:1147328/140‑1 (MQ=255) tgtgCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGcc > 1:1700/1‑140 (MQ=255) tgCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTa < 2:42865/140‑1 (MQ=255) gCCGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTAc < 1:1074970/140‑1 (MQ=255) ccGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa < 1:1077602/131‑1 (MQ=255) ccGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa > 2:1077602/1‑131 (MQ=255) ccGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTAcc > 2:611773/1‑140 (MQ=255) ccGATAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTAcc > 1:437019/1‑140 (MQ=255) aTAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa > 2:1045075/1‑128 (MQ=255) aTAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATtaataa < 1:1045075/128‑1 (MQ=255) tAACAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTg < 1:431477/140‑1 (MQ=255) aaCAAATATAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTGc > 1:899143/1‑140 (MQ=255) atatAGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTGCAACCa > 1:227064/1‑140 (MQ=255) ataGCCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTGCAACCAtt < 1:524987/140‑1 (MQ=255) | ACCATTTCATGAATCTGCGAAAATTCAATGTCCATTGTATACCTCACATTTTTACCGTGACTCGATGTTACTGTTCAATAATCACCTTCCATCAATACTAAAATTAATACCCCTAATGTGCCGATAACAAATATAGTCATTCTACGTAACGTCTCCATAAGGTGATATTTGACATTATCAGAAGCTGCGAATTCGGATTTTGCTCTAATCAAATGAGAGAAATGTAAAATGAAGCCACGAAATATTAATAATAGCCTACCACTGCAACCATT > NC_000913/2990326‑2990597 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |