| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→8 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4 component B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,602,010 | 1 | . | C | 97.0% | 219.2 / ‑2.6 | 68 | A65P (GCC→CCC) | hyfB | hydrogenase 4 component B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); major base C (33/31); minor base T (1/1); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
GCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGG > NC_000913/2601875‑2602140 | gCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCAACATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑ccc‑c > 1:886884/1‑140 (MQ=255) cttggttGTTTTTCCTCGGTCTGGACGGCTGGGCTATTAAGCTTTCCGGCACCCCACCGCTGGTGGGGGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTCCGCAATTCCAGCCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑ccc‑cc < 2:151206/134‑1 (MQ=255) tCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGc < 1:159005/140‑1 (MQ=255) gTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGa > 2:466762/1‑140 (MQ=255) gTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGa > 1:29926/1‑140 (MQ=255) gTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGa > 1:283629/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGT‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:1045796/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGc > 1:685415/1‑127 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGc < 2:685415/127‑1 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGAt > 2:4879/1‑131 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGAt < 1:4879/131‑1 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:277465/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:692405/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:44867/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:59604/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:992665/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:919973/1‑140 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:394158/1‑139 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTg < 1:394158/139‑1 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 1:995771/1‑140 (MQ=255) tGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:29926/140‑1 (MQ=255) tGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:958158/140‑1 (MQ=255) ggCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa < 1:289572/140‑1 (MQ=255) ggCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa < 1:59604/140‑1 (MQ=255) ccGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 1:466762/140‑1 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg > 1:1052774/1‑140 (MQ=255) tCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGGATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAtt > 2:357332/1‑140 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 2:274507/140‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 2:990667/140‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 1:207119/140‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 2:919973/140‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGc > 1:23208/1‑140 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTa > 2:516657/1‑131 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTa < 1:516657/131‑1 (MQ=255) tggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt < 2:822390/140‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGtt < 1:692405/140‑1 (MQ=255) ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 2:277465/140‑1 (MQ=255) gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAt < 2:1091120/140‑1 (MQ=255) aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 2:1052774/140‑1 (MQ=255) aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc > 1:148581/1‑140 (MQ=255) tcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt < 2:275316/140‑1 (MQ=255) caGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 2:702072/1‑140 (MQ=255) caGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑CCCTCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 2:579324/1‑140 (MQ=255) cGGGATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 1:357332/140‑1 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 2:367220/140‑1 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:23208/140‑1 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct > 1:145582/1‑140 (MQ=255) aCGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑CCCTCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 1:579324/140‑1 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt > 1:616128/1‑131 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:616128/131‑1 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGT‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTc < 1:1045796/140‑1 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCa < 2:53177/140‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 2:93341/140‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 2:148581/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACt > 1:688792/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:1024324/1‑132 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt < 2:1024324/132‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 2:455845/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 1:586017/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 1:200374/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 2:988758/1‑140 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCa > 2:499544/1‑128 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCa < 1:499544/128‑1 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATg > 1:453956/1‑140 (MQ=255) aaCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATgcgc > 2:699835/1‑140 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTTGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGcgcg > 1:334778/1‑140 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGcgcg < 1:988758/140‑1 (MQ=255) aGTCGCCCGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc > 1:618931/1‑140 (MQ=255) cccGTTTTGCCCCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTATCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAg < 2:1014531/139‑1 (MQ=255) cccGTTTTGCCCCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTATCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAg > 1:1014531/1‑139 (MQ=255) cccGTTTTGC‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGACTACGAggg < 2:992665/140‑1 (MQ=255) | GCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑CCC‑CCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGG > NC_000913/2601875‑2602140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |