Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,086,523 | A→G | T170A (ACT→GCT) | fdhD → | sulfurtransferase for molybdenum cofactor sulfuration |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,086,523 | 0 | A | G | 98.2% | 196.5 / ‑4.3 | 57 | T170A (ACT→GCT) | fdhD | sulfurtransferase for molybdenum cofactor sulfuration |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (28/28); total (29/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 |
CGTGGAGCAACTTAATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTAC > NC_000913/4086390‑4086658 | cgTGGAGCAACTTAATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAAGTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCAcg > 2:675588/1‑140 (MQ=255) aCTTAATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCt < 2:698870/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCa > 2:791911/1‑140 (MQ=255) cGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCAt > 1:487289/1‑140 (MQ=255) cGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGaa > 2:165285/1‑140 (MQ=255) gTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACt > 1:940497/1‑140 (MQ=255) gTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACt > 1:668696/1‑140 (MQ=255) gTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACt > 1:358645/1‑140 (MQ=255) aGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTc < 2:668696/140‑1 (MQ=255) ccGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTcgg > 2:866318/1‑140 (MQ=255) cGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTcggc < 2:667771/140‑1 (MQ=255) aCCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGc > 1:170992/1‑140 (MQ=255) aCCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGc < 1:628274/140‑1 (MQ=255) cGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCAt < 1:675588/140‑1 (MQ=255) gTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATg < 1:869864/140‑1 (MQ=255) aCCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGa < 1:620062/140‑1 (MQ=255) ccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACg > 1:500876/1‑140 (MQ=255) ccAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACg > 1:208751/1‑140 (MQ=255) aGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTg < 1:309227/140‑1 (MQ=255) gACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTgg > 2:1091937/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTggg > 1:514783/1‑140 (MQ=255) aCGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTggg > 1:174565/1‑140 (MQ=255) tttGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCg > 2:535258/1‑140 (MQ=255) tttGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCg < 1:1091937/140‑1 (MQ=255) gATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCa > 2:334623/1‑140 (MQ=255) gATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCa > 1:946286/1‑140 (MQ=255) tctcAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCAtg < 1:165285/140‑1 (MQ=255) tcAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCAtgtg > 2:545451/1‑140 (MQ=255) aCTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTgg > 2:899132/1‑140 (MQ=255) cTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGa < 1:791911/140‑1 (MQ=255) ggATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACa < 1:535258/140‑1 (MQ=255) cGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGgccg < 1:866318/140‑1 (MQ=255) cATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGccgccg > 1:404203/1‑140 (MQ=255) tctcAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGt < 1:899132/140‑1 (MQ=255) tctcAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGt > 2:559204/1‑140 (MQ=255) tctcAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGt < 1:559204/140‑1 (MQ=255) ctcAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTc > 1:715607/1‑140 (MQ=255) cAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTcac > 2:738486/1‑140 (MQ=255) aCGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGt < 1:800397/135‑1 (MQ=255) aCGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGt > 2:800397/1‑135 (MQ=255) aCGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACaa > 2:912756/1‑140 (MQ=255) aCGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACaa > 2:267663/1‑140 (MQ=255) cAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGa < 1:334623/140‑1 (MQ=255) cAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGc < 2:715607/140‑1 (MQ=255) tGGGGCAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTgg > 2:950777/1‑140 (MQ=255) cAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgcagca < 1:545451/140‑1 (MQ=255) cAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgcagca < 1:738486/140‑1 (MQ=255) cAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgcagca < 1:912756/140‑1 (MQ=255) cAACTGACTGGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGgcagca < 2:946286/140‑1 (MQ=255) gactgGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTg < 1:651704/140‑1 (MQ=255) gactgGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTg < 1:754259/140‑1 (MQ=255) gactgGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTg < 2:824284/140‑1 (MQ=255) gactgGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTg > 1:824284/1‑140 (MQ=255) ctgGTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCg > 2:319451/1‑140 (MQ=255) gTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTa < 2:174565/140‑1 (MQ=255) gTTGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTa < 1:267663/140‑1 (MQ=255) ttGTGCTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTAc < 1:950777/140‑1 (MQ=255) | CGTGGAGCAACTTAATGACATCGGAAAACCGGTGCAGCCGCTACCGTTCACCCAGACGTTTGATCTCAACAAACTGGATGATGCATTACGTCATCTCAACGATTTTCAGCCAGTGGGGCAACTGACTGGTTGTACTCACGCCGCTGCCTGGATGTTGCCATCTGGCGAACTGGTCGGCGGGCATGAAGACGTGGGTCGCCATGTGGCGCTGGACAAACTGTTAGGCCGCCGGTCACAAGAAGGGGAAAGCTGGCAGCAAGGTGCGGTAC > NC_000913/4086390‑4086658 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |