| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,603,074 | T→C | R419R (CGT→CGC) | hyfB → | hydrogenase 4 component B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,603,074 | 0 | T | C | 98.7% | 281.9 / NA | 78 | R419R (CGT→CGC) | hyfB | hydrogenase 4 component B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (37/40); minor base A (0/1); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGGGCACTAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGTGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCT > NC_000913/2602939‑2603209 | gggggCACTAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTgg < 1:506505/140‑1 (MQ=255) aCTAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCg < 1:916840/140‑1 (MQ=255) aCTAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCg < 2:200036/140‑1 (MQ=255) tAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGTAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTa < 2:299897/140‑1 (MQ=255) tAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGTAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGAGTGGAAGCCGTa < 2:1060090/140‑1 (MQ=255) cGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAgcg > 1:1030916/1‑140 (MQ=255) aaaCGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCt < 1:491564/140‑1 (MQ=255) tGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACtt > 1:946856/1‑140 (MQ=255) tGGACAGCCGCAGCATGCCTGATAGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCggg < 1:803239/140‑1 (MQ=255) ggACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGt > 2:553318/1‑140 (MQ=255) gACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTc > 2:545170/1‑140 (MQ=255) cAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCt < 1:614549/140‑1 (MQ=255) aGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTa < 1:494005/140‑1 (MQ=255) cGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTg < 2:1030916/140‑1 (MQ=255) gcagcaTGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGc < 1:553318/140‑1 (MQ=255) gcagcaTGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGc > 2:1037242/1‑140 (MQ=255) gcagcaTGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGc < 1:842824/140‑1 (MQ=255) gcagcaTGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGc < 1:808748/140‑1 (MQ=255) cagcaTGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCt > 1:28639/1‑140 (MQ=255) ccTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTaa > 1:196757/1‑140 (MQ=255) tGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATg < 2:946856/140‑1 (MQ=255) ttGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTg < 1:545170/140‑1 (MQ=255) tGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTgg > 1:375917/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCa > 2:514285/1‑140 (MQ=255) ttGCCTCGCGGTATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAg > 2:555450/1‑140 (MQ=255) tGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGt > 1:898240/1‑140 (MQ=255) tCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACt > 1:968255/1‑140 (MQ=255) atCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGc < 2:375917/140‑1 (MQ=255) aGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTgg < 1:490476/140‑1 (MQ=255) aTTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGTTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGt > 1:130052/1‑140 (MQ=255) tcctccGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTaa > 1:246307/1‑140 (MQ=255) ccGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAAtgtg > 2:684654/1‑140 (MQ=255) ccGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAAtgtg < 2:28639/140‑1 (MQ=255) aaTGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGt > 1:1017935/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTaa > 2:302075/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTaa > 1:12082/1‑140 (MQ=255) ttttATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTaaaaa > 1:678242/1‑140 (MQ=255) aTCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTa < 1:1037242/140‑1 (MQ=255) aTCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTa < 1:697020/140‑1 (MQ=255) aTCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTa < 1:582543/140‑1 (MQ=255) aTCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTa < 2:196757/140‑1 (MQ=255) cAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACg < 2:678242/140‑1 (MQ=255) gCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGt > 2:598427/1‑140 (MQ=255) cGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTa < 1:598427/140‑1 (MQ=255) cGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTa < 2:968255/140‑1 (MQ=255) aaTGGTACACCTGGCAGTCGTTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTAtt < 2:130052/140‑1 (MQ=255) gTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACtt > 1:118443/1‑140 (MQ=255) ggCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGTCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTgtggt > 1:736183/1‑140 (MQ=255) ggCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACg > 1:103342/1‑123 (MQ=255) ggCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACg < 2:103342/123‑1 (MQ=255) gCAGTCGCTGTTCTAACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTAtt > 1:859814/1‑127 (MQ=255) gCAGTCGCTGTTCTAACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTAtt < 2:859814/127‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTgc > 2:206260/1‑140 (MQ=255) aGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTgcg < 1:302075/140‑1 (MQ=255) aGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTgcg > 2:71293/1‑140 (MQ=255) cGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccg > 1:1004812/1‑140 (MQ=255) cGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccg < 1:192046/140‑1 (MQ=255) cGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccg < 2:1004812/140‑1 (MQ=255) cGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccg < 1:1045093/140‑1 (MQ=255) cGCTGTTCTCACTAAGTCGCGTCGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccg < 1:773898/140‑1 (MQ=255) gCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccgc > 1:284148/1‑140 (MQ=255) gCTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGcgccgc > 2:1039890/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCcgcg > 2:979631/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCcgcg < 2:16127/140‑1 (MQ=255) cTGTTCTCACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCcgcg < 2:12082/140‑1 (MQ=255) tctcACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCgcgc > 1:938107/1‑137 (MQ=255) tctcACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCgcgc < 2:938107/137‑1 (MQ=255) cACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCGTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGTGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTaca < 2:1017935/140‑1 (MQ=255) cACTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTaca < 2:284148/140‑1 (MQ=255) aCTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTacac < 1:71293/140‑1 (MQ=255) aCTAAGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTacac > 1:576272/1‑140 (MQ=255) aaGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCcgcg < 2:268181/129‑1 (MQ=255) aaGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCcgcg > 1:268181/1‑129 (MQ=255) aaGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACg < 2:118443/140‑1 (MQ=255) aaGTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACg > 2:629634/1‑140 (MQ=255) gTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCt > 2:11648/1‑140 (MQ=255) gTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCt > 2:1081794/1‑140 (MQ=255) gTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCt > 2:758022/1‑140 (MQ=255) gTCGCGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCt > 1:527717/1‑140 (MQ=255) | GGGGGCACTAGCGAAACGGATGCCGTGGACAGCCGCAGCATGCCTGATTGGTTGCCTCGCGATATCAGCCATTCCTCCGCTGAATGGTTTTATCAGCGAATGGTACACCTGGCAGTCGCTGTTCTCACTAAGTCGTGTGGAAGCCGTAGCGCTACAACTTGCGGGTCCTATTGCTATGGTAATGCTGGCAGTCACTGGTGGGCTGGCAGTAATGTGCTTCGTAAAAATGTACGGTATTACTTTCTGTGGTGCGCCGCGCAGTACACACGCT > NC_000913/2602939‑2603209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |