| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,017,429 | (C)6→7 | coding (876/1374 nt) | fliI → | flagellum‑specific ATP synthase FliI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,017,423 | 1 | . | C | 96.9% | 221.1 / ‑0.4 | 64 | coding (870/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase FliI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (34/28); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCG > NC_000913/2017286‑2017550 | cTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑cc < 1:170458/140‑1 (MQ=255) gCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑cccc > 2:2807/1‑140 (MQ=255) aTGCAGGGTGCCACCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑cccccccg < 2:283694/140‑3 (MQ=255) ccgccTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAgg > 1:1038401/1‑140 (MQ=255) ccgccTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAgg < 2:1038401/140‑1 (MQ=255) ccTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGTCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTa > 1:378070/1‑140 (MQ=255) ccTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTa > 1:443456/1‑140 (MQ=255) aTGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATcc > 1:715086/1‑140 (MQ=255) tGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATc > 2:16370/1‑138 (MQ=255) tGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATc < 1:16370/138‑1 (MQ=255) gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCaa > 1:341774/1‑124 (MQ=255) gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCaa < 2:341774/124‑1 (MQ=255) gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGt < 2:491177/138‑1 (MQ=255) gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGt > 1:491177/1‑138 (MQ=255) cgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg > 1:609954/1‑140 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGTCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa < 2:378070/140‑1 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa < 2:609954/140‑1 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa < 2:443456/140‑1 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa < 2:790786/140‑1 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa < 2:715086/140‑1 (MQ=255) aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa > 2:605202/1‑140 (MQ=255) cgcgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCgg < 2:1047558/140‑1 (MQ=255) cgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa < 1:437641/140‑1 (MQ=255) cGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTgg > 1:144134/1‑140 (MQ=255) cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTg > 1:125304/1‑140 (MQ=255) cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTg > 1:374918/1‑140 (MQ=255) aTGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGc < 2:917088/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGc < 2:707979/139‑1 (MQ=255) tgtgTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGc > 1:707979/1‑139 (MQ=255) gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCg > 1:732473/1‑140 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGa > 1:720231/1‑140 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGa > 1:898569/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGaa > 2:945801/1‑140 (MQ=255) gCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAAt > 2:245165/1‑140 (MQ=255) gCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAAt > 2:208916/1‑140 (MQ=255) tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg > 2:611759/1‑140 (MQ=255) aTTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCa > 2:1014103/1‑140 (MQ=255) aCTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcgg > 1:53461/1‑140 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGaa > 2:598245/1‑123 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGaa < 1:598245/123‑1 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAtcggcggc > 1:860609/1‑140 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggc > 2:169674/1‑140 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggc > 2:604894/1‑140 (MQ=255) cTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggcg > 1:533121/1‑140 (MQ=255) tCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGcggcggcgg < 1:939152/140‑1 (MQ=255) cACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCggcggcggc > 2:442810/1‑140 (MQ=255) tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTa > 1:903901/1‑140 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:945801/140‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:53461/140‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:533121/140‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:442810/140‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:420423/140‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:374918/140‑1 (MQ=255) aTGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:54679/135‑1 (MQ=255) aTGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc > 1:54679/1‑135 (MQ=255) aGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTtata < 1:644924/139‑1 (MQ=255) aGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTtata > 2:644924/1‑139 (MQ=255) gCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATAcc < 2:898569/140‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 1:611759/140‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 2:125304/140‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 1:245165/140‑1 (MQ=255) ggAAATGGCGCTGGCGATTGGCGAGC‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 1:47332/139‑1 (MQ=255) aaaTTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCt > 2:733832/1‑140 (MQ=255) aaaTTGCGCTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGGCGGTGTTTGCCAAATTACCGTCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGAGGCTCGATTACCCCGGTTTATACCGtttt > 2:47332/1‑137 (MQ=255) cgcTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 1:404947/132‑1 (MQ=255) cgcTGGCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg > 2:404947/1‑132 (MQ=255) gCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCg < 1:2807/140‑1 (MQ=255) gCGATTGGCGA‑ACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTGTATACCGTGCTCACTGAAGGCg > 1:741556/1‑140 (MQ=255) | CTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGA‑A‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCG > NC_000913/2017286‑2017550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |