| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,379,266 | (C)7→8 | coding (732/1128 nt) | zapE ← | cell division factor ZapE with ATPase activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,379,259 | 1 | . | C | 89.2% | 238.7 / 20.1 | 74 | coding (739/1128 nt) | zapE | cell division factor ZapE with ATPase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/6); new base C (30/36); total (32/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
AGAGCGCAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGTTCATTACATCA > NC_000913/3379124‑3379392 | agagCGCAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑cc‑cc > 2:273830/1‑140 (MQ=255) gcAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGtt‑t < 2:646300/131‑1 (MQ=255) gcAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGtt‑t > 1:646300/1‑131 (MQ=255) gcAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑cc‑ccccccc > 1:508180/1‑138 (MQ=255) atatAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑cc‑ccccccgcca < 1:488399/140‑6 (MQ=255) taGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAgcg < 2:436453/140‑1 (MQ=255) taGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAgcg < 1:554589/140‑1 (MQ=255) aTGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAAc < 1:486811/140‑1 (MQ=255) tGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAAcc > 2:600460/1‑140 (MQ=255) tGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAAcc > 2:577122/1‑140 (MQ=255) tGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAAcc > 1:584621/1‑140 (MQ=255) tGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACACCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAAcc < 2:905605/140‑1 (MQ=255) gCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGAGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCa < 2:580766/140‑1 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 1:326927/1‑140 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 1:642644/1‑140 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 1:296462/1‑140 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 1:588563/1‑140 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 2:884824/1‑140 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑cc‑ccc < 2:62211/122‑1 (MQ=255) cTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑cc‑ccc > 1:62211/1‑122 (MQ=255) ggggCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTAt < 1:577122/139‑1 (MQ=255) cGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTAt > 2:175202/1‑140 (MQ=255) ggCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAgcg > 2:540845/1‑123 (MQ=255) ggCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAgcg < 1:540845/123‑1 (MQ=255) tCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAt < 2:673259/138‑1 (MQ=255) tCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAt > 1:673259/1‑138 (MQ=255) aGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCggg > 1:446818/1‑140 (MQ=255) aaGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTg < 1:884824/140‑1 (MQ=255) gagaCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGaa > 1:838575/1‑140 (MQ=255) gaCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGt > 1:158157/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 1:74217/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 2:363195/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 1:170275/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑CCGCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 1:540496/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTATCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 2:677772/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTAGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTg > 1:491198/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGc > 1:245558/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGc > 1:704949/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCACCGCCAACCATAGTTTTTCCTTTTGCGCCCGGGTTTCATCGTAAAggggg > 1:774822/1‑139 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCg < 1:617030/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCg < 2:257809/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCg < 2:245558/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCg < 1:334475/140‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCg < 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gggttGGTTCTAGGCCCCGATTGTTGCTAATGGCGGATGTTTTATTTTAAACGCCGGGGAATTTTCTCGTTGC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGc < 2:642644/136‑1 (MQ=255) gTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑CCGCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGcc < 2:540496/140‑1 (MQ=255) tGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCcaca > 1:363725/1‑140 (MQ=255) ttCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGAt < 1:499931/140‑1 (MQ=255) ttCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGAt < 1:677772/140‑1 (MQ=255) cGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATgcgc < 2:584621/140‑1 (MQ=255) gcGCCCATTGTTGGTAATGGCCGATGGTTGATTTTTAACGGTGGTTAATTTTTCCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCt < 2:774822/139‑1 (MQ=255) cccATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag < 2:158157/140‑1 (MQ=255) cccATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag > 1:169269/1‑140 (MQ=255) cccATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag < 1:734043/140‑1 (MQ=255) cccATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag < 2:170275/140‑1 (MQ=255) cccATTGTTCCTATTGGCCGTTGGTTGATTTCTAACGTGGGGGAGTTTTCTGGTTCC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag < 2:827994/140‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagt > 2:573282/1‑140 (MQ=255) caaTTGTTGCTATTGGCCGAGGGTTGATTTCTAACGGCGGTGATTTTTCTGGTTCC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagt < 2:455495/138‑1 (MQ=255) tgCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag > 1:665080/1‑132 (MQ=255) tgCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgag < 2:665080/132‑1 (MQ=255) cTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACg > 1:60269/1‑140 (MQ=255) cTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACg < 1:573282/140‑1 (MQ=255) aaTGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCa < 1:75146/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGAc > 2:589136/1‑140 (MQ=255) ccGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGa < 1:363195/140‑1 (MQ=255) aTTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAacac < 1:744993/140‑1 (MQ=255) cTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGc > 1:779457/1‑140 (MQ=255) cGTCGGTGAATTTTCTCGTTCC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTcc < 2:838575/140‑1 (MQ=255) tCGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCAc > 2:820420/1‑140 (MQ=255) gggTGAATTTTCTCTTTCC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACg < 2:629689/139‑1 (MQ=255) cGGTGATTTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACg < 1:111106/140‑1 (MQ=255) cGGTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACg < 2:74217/140‑1 (MQ=255) ggTGAATTTTCTCGTT‑T‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGtt > 1:848007/1‑140 (MQ=255) gTGAATTTTCTCGTTCC‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGtt < 2:169269/140‑1 (MQ=255) gTGAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGtt < 1:589136/140‑1 (MQ=255) gAATTTTCTCGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGTTCa < 2:296462/140‑1 (MQ=255) tcGTT‑TCCC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGTTCATTACATca < 1:157835/140‑1 (MQ=255) | AGAGCGCAATATAGTCATGCTGACTGCGGGCGTCGACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑CC‑CCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCAGACGATAATCAACACCAGCGTCCACGTTCATTACATCA > NC_000913/3379124‑3379392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |