| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,547,614 | C→T | A840V (GCG→GTG) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,547,614 | 0 | C | T | 98.7% | 266.5 / ‑6.0 | 77 | A840V (GCG→GTG) | fimD | type I fimbriae usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (38/38); minor base A (1/0); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACTGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGCGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGCGTGA > NC_000913/4547485‑4547742 | aaCTGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGtt > 2:572334/1‑140 (MQ=255)aaCTGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGAGGGAAAAGtt > 2:597531/1‑140 (MQ=255) tGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAg < 1:30055/140‑1 (MQ=255) tGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAg < 1:717182/140‑1 (MQ=255) gCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAgg > 2:583220/1‑140 (MQ=255) cTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGTGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAggg > 2:813230/1‑139 (MQ=255) gACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAAt > 1:797040/1‑140 (MQ=255) tGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGga < 2:416615/140‑1 (MQ=255) tGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGga < 2:281951/140‑1 (MQ=255) cccACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGagaa > 2:687468/1‑140 (MQ=255) cccACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGagaa < 1:687468/140‑1 (MQ=255) caATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAgg > 2:814985/1‑140 (MQ=255) ataaGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTATTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAAt > 2:93218/1‑140 (MQ=255) gCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTc < 1:156019/140‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCa < 1:583220/140‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCAc < 2:797040/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACtg > 2:866936/1‑140 (MQ=255) cTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACtg > 2:151278/1‑140 (MQ=255) tttGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGc < 1:314395/140‑1 (MQ=255) tttGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGc < 1:866936/140‑1 (MQ=255) aTGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCa > 2:923759/1‑140 (MQ=255) ggTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAAc < 1:814985/140‑1 (MQ=255) ggTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAAc < 2:148555/140‑1 (MQ=255) tGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTg < 1:572334/140‑1 (MQ=255) tGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTg < 1:313695/140‑1 (MQ=255) tCAGAGAGTAGCCAGAGTAGTGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGccacc < 1:803756/140‑1 (MQ=255) agagagTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCag > 1:941916/1‑140 (MQ=255) agagagTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCag > 1:331485/1‑140 (MQ=255) agagTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCagag > 1:247264/1‑140 (MQ=255) agagTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCagag > 1:918806/1‑140 (MQ=255) gTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGt > 1:44194/1‑140 (MQ=255) aGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGcc < 2:619905/128‑1 (MQ=255) aGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGcc > 1:619905/1‑128 (MQ=255) aGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTca > 1:556111/1‑140 (MQ=255) gCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag < 2:941916/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag < 2:758264/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag > 2:821101/1‑140 (MQ=255) gCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag > 1:758264/1‑140 (MQ=255) gCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag < 1:82057/140‑1 (MQ=255) agagTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcag < 1:741730/140‑1 (MQ=255) agagTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcag < 1:373627/140‑1 (MQ=255) agagTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcag > 2:776641/1‑140 (MQ=255) gagTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag < 2:808630/136‑1 (MQ=255) gagTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcag > 1:808630/1‑136 (MQ=255) agTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcagca < 1:151278/140‑1 (MQ=255) agTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcagca > 2:492960/1‑140 (MQ=255) agTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcagca > 1:439966/1‑140 (MQ=255) gTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcagcag > 2:281893/1‑140 (MQ=255) gTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTcagcagcag > 1:507807/1‑140 (MQ=255) aGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGtt < 2:247264/140‑1 (MQ=255) cGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGttat < 1:821101/140‑1 (MQ=255) gCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGttatta < 1:776641/140‑1 (MQ=255) ttgttgCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAAcc < 1:393978/140‑1 (MQ=255) ttgttgCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAAcc > 1:254611/1‑140 (MQ=255) ttgttgCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAAcc < 1:597531/140‑1 (MQ=255) gCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCt < 2:44194/140‑1 (MQ=255) tAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAg < 1:93218/140‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTTACCTCAGCGCAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGttatt < 1:81762/125‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTTACCTCAGCGCAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGttatt > 2:81762/1‑125 (MQ=255) aTGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCt < 2:556111/140‑1 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAAcc > 2:394340/1‑127 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAAcc < 1:394340/127‑1 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGc > 2:708963/1‑131 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGc < 1:708963/131‑1 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTg > 2:700524/1‑140 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTg > 2:323180/1‑140 (MQ=255) tGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTg > 1:670160/1‑140 (MQ=255) gTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGaa < 2:331485/140‑1 (MQ=255) ggTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTc > 2:503760/1‑140 (MQ=255) gCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAAt > 2:735667/1‑126 (MQ=255) gCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAAt < 1:735667/126‑1 (MQ=255) gCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGc > 2:944197/1‑140 (MQ=255) gCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGc > 1:354954/1‑140 (MQ=255) gCGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAACTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGc > 1:933068/1‑140 (MQ=255) cGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGCg < 1:439677/140‑1 (MQ=255) cGGAATGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGCg < 2:254611/140‑1 (MQ=255) aaTGCCTTTAGTGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGCGtga > 2:160954/1‑140 (MQ=255) | AACTGCTCATGACGCTGACCCACAATAATAAGCCGCTGCCGTTTGGGGCGATGGTGACATCAGAGAGTAGCCAGAGTAGCGGCATTGTTGCGGATAATGGTCAGGTTTACCTCAGCGGAATGCCTTTAGCGGGAAAAGTTCAGGTGAAATGGGGAGAAGAGGAAAATGCTCACTGTGTCGCCAATTATCAACTGCCACCAGAGAGTCAGCAGCAGTTATTAACCCAGCTATCAGCTGAATGTCGTTAAGGGGGCGTGA > NC_000913/4547485‑4547742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |