Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,392,949 | A→G | intergenic (+59/‑278) | pgrR → / → mppA | DNA‑binding transcriptional repressor PgrR/murein tripeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,392,949 | 0 | A | G | 98.6% | 255.9 / ‑4.8 | 72 | intergenic (+59/‑278) | pgrR/mppA | DNA‑binding transcriptional repressor PgrR/murein tripeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (38/33); total (38/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
TCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGGAGACTATTATT > NC_000913/1392818‑1393085 | tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTgg > 2:190590/1‑140 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTgg > 1:607450/1‑140 (MQ=255) cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTc < 1:34806/140‑1 (MQ=255) acCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAtt > 2:944278/1‑140 (MQ=255) cGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAtttt > 2:160537/1‑140 (MQ=255) cGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAtttt > 1:325149/1‑140 (MQ=255) cGTCGACAAGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAtttt > 2:428885/1‑140 (MQ=255) gTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAttttt > 1:88707/1‑140 (MQ=255) tCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCAtttttt < 2:468947/140‑1 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTc > 2:836821/1‑132 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTc < 1:836821/132‑1 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTa > 2:435856/1‑140 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTa > 1:330017/1‑140 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTa > 1:393868/1‑140 (MQ=255) aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 1:160537/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTAttct < 1:435856/140‑1 (MQ=255) tGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGt < 2:88707/140‑1 (MQ=255) ggCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTa > 2:73216/1‑140 (MQ=255) cATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGc < 1:190590/140‑1 (MQ=255) ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATGCATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:778483/140‑1 (MQ=255) ttatttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:428885/140‑1 (MQ=255) tttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTg < 2:393868/140‑1 (MQ=255) atagatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGAtt > 1:680939/1‑140 (MQ=255) ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 1:378731/1‑140 (MQ=255) ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 2:88370/1‑140 (MQ=255) ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 1:815036/1‑140 (MQ=255) gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAcc > 1:621062/1‑140 (MQ=255) aaaGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTa > 2:270673/1‑123 (MQ=255) aaaGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTa < 1:270673/123‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGt > 1:229359/1‑140 (MQ=255) ggTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAATTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGATAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTg < 1:284746/140‑1 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAAc < 1:635165/139‑1 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAAc > 2:635165/1‑139 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 2:762256/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 1:455760/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 2:836176/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 2:177813/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 1:53280/1‑140 (MQ=255) ctactTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGccc < 2:680939/140‑1 (MQ=255) ctTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGaa > 1:295907/1‑140 (MQ=255) ctTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGaa > 2:398348/1‑140 (MQ=255) ctTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGaa > 1:293364/1‑140 (MQ=255) ctTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGaa > 1:320250/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAAc < 2:378731/140‑1 (MQ=255) tGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACg < 1:88370/140‑1 (MQ=255) cTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 2:607450/140‑1 (MQ=255) cTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 2:458785/140‑1 (MQ=255) cTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 1:223637/140‑1 (MQ=255) cTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 1:429871/140‑1 (MQ=255) cTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 1:177813/140‑1 (MQ=255) tGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAg > 2:390084/1‑140 (MQ=255) tACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAgtgt > 1:89934/1‑140 (MQ=255) aTTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCg < 1:390084/140‑1 (MQ=255) taatttaattCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCC‑TTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa < 1:34826/130‑1 (MQ=255) taatttaattCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCC‑TTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTa > 2:34826/1‑130 (MQ=255) taattCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCt < 2:652632/140‑1 (MQ=255) ttcttcTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTAtg > 2:89480/1‑140 (MQ=255) ctctTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCtt > 2:117441/1‑140 (MQ=255) ttAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTAc < 1:356472/140‑1 (MQ=255) tAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTAcc < 2:295907/140‑1 (MQ=255) ctcAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTgg > 2:353689/1‑140 (MQ=255) tcAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGga < 2:293364/140‑1 (MQ=255) tcAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGga < 2:53280/140‑1 (MQ=255) tcAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGga < 2:229359/140‑1 (MQ=255) tcAGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGga < 1:89480/140‑1 (MQ=255) aGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGTTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGgaga > 2:814970/1‑140 (MQ=255) aGTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGgaga < 1:117441/140‑1 (MQ=255) gTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTg < 2:483803/135‑1 (MQ=255) gTTCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTg > 1:483803/1‑135 (MQ=255) ttCCTTTCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGGAGACt < 2:38322/140‑1 (MQ=255) ttCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGGAGACtattat > 2:830186/1‑140 (MQ=255) tCAGCGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGGAGACTattatt < 1:73216/140‑1 (MQ=255) | TCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCGAAGCCCGAACGTAGTGTTCGGAGTTCTATGTGCTTTACCGCATTTTGGAGACTATTATT > NC_000913/1392818‑1393085 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |