| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,453,961 | C→T | A12V (GCC→GTC) | paaA → | phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,453,961 | 0 | C | T | 98.6% | 244.8 / ‑5.2 | 72 | A12V (GCC→GTC) | paaA | phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (32/39); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTCGCGCACC > NC_000913/1453825‑1454096 | aCAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCa > 1:522471/1‑140 (MQ=255) aaaTTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGa < 1:478405/140‑1 (MQ=255) tttACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCg < 1:912185/140‑1 (MQ=255) aCTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGc < 2:666706/140‑1 (MQ=255) tAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACTGCTATCGAGCcac > 1:516883/1‑140 (MQ=255) tgtgTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTg > 1:330751/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTgg < 1:252994/140‑1 (MQ=255) tAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATg > 2:409733/1‑140 (MQ=255) tAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATg > 2:421291/1‑140 (MQ=255) tAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATg > 2:133803/1‑140 (MQ=255) aCTTTCATAATACCATGTGATTCGAGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGCATCGTAAAGGCGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGCGCAACGGCTAGACCAGGAAACGGCAACCGAGCCACAGGACTGGAAGcc > 2:620585/1‑140 (MQ=255) cTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGccc > 1:931932/1‑140 (MQ=255) ttCATAAAACGATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGa < 2:930166/140‑1 (MQ=255) ttCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGcc < 1:97576/137‑1 (MQ=255) ttCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGcc > 2:97576/1‑137 (MQ=255) ttCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGa > 2:323268/1‑140 (MQ=255) cATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAGCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATg < 1:669146/140‑1 (MQ=255) cATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATg < 1:421291/140‑1 (MQ=255) cATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATg < 1:599028/140‑1 (MQ=255) aTAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGc > 2:83174/1‑140 (MQ=255) aaaCAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTa < 2:764445/140‑1 (MQ=255) cAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCg < 2:685756/140‑1 (MQ=255) cAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCg < 2:711495/140‑1 (MQ=255) cAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCg > 1:685756/1‑140 (MQ=255) aTGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGaa < 2:330751/140‑1 (MQ=255) tgtgATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGaaa > 1:734153/1‑140 (MQ=255) tgtgATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGaaa > 1:493978/1‑140 (MQ=255) tgtgATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGaaa > 2:414259/1‑140 (MQ=255) gtgATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAg > 1:360467/1‑140 (MQ=255) gtgATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAg > 1:326901/1‑140 (MQ=255) ttCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAt > 1:732765/1‑140 (MQ=255) ttCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACAt > 2:179255/1‑140 (MQ=255) cGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTg > 2:44463/1‑140 (MQ=255) aattCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTg > 1:12064/1‑140 (MQ=255) ttCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACTGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTggg < 2:516883/140‑1 (MQ=255) tCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGgc < 1:83174/140‑1 (MQ=255) tCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGgc < 2:732765/140‑1 (MQ=255) gAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGgcagca > 2:229239/1‑140 (MQ=255) aCTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATgcg < 1:627352/140‑1 (MQ=255) cTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATgcgc < 1:376385/140‑1 (MQ=255) tGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCa < 2:326901/140‑1 (MQ=255) tGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCa < 2:360467/140‑1 (MQ=255) aTCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTcc > 1:256417/1‑140 (MQ=255) tAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCgaga > 1:780238/1‑140 (MQ=255) tAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCgaga < 2:734153/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAAGACTGGATGCCCGCTGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATAGGGCAGCCTGCGCACTCCgaga > 2:585617/1‑140 (MQ=255) gTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGAttgtt < 1:323268/140‑1 (MQ=255) atgaCGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGt > 1:253092/1‑140 (MQ=255) tgaCGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTa > 2:417439/1‑140 (MQ=255) ccGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATg < 2:787516/139‑1 (MQ=255) aCGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATg < 1:409733/140‑1 (MQ=255) gACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCgag > 1:432366/1‑124 (MQ=255) gACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCgag < 2:432366/124‑1 (MQ=255) gACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGc < 1:871788/140‑1 (MQ=255) gACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGc < 2:253092/140‑1 (MQ=255) cAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGa < 1:229239/140‑1 (MQ=255) aagaagAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGaa < 2:256417/140‑1 (MQ=255) aagaagAACGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGaa < 2:780238/140‑1 (MQ=255) aagaaCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAACGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGt < 2:665438/140‑1 (MQ=255) aagaaCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGt < 2:931932/140‑1 (MQ=255) aagaaCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGt < 2:586236/140‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCt > 2:144141/1‑131 (MQ=255) aaCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCt < 1:144141/131‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACt > 1:522773/1‑140 (MQ=255) cGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTg > 2:951341/1‑140 (MQ=255) cGCTTTGAGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTg > 2:871173/1‑140 (MQ=255) aGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACt < 1:44463/140‑1 (MQ=255) aGCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACt < 1:251349/140‑1 (MQ=255) gCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTc > 1:112267/1‑140 (MQ=255) gCAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTc < 1:871173/140‑1 (MQ=255) cAACGGATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTcg < 2:12064/140‑1 (MQ=255) ggATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACt < 2:50580/134‑1 (MQ=255) ggATAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACt > 1:50580/1‑134 (MQ=255) aTAGTCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTCGCGCAcc > 2:9959/1‑140 (MQ=255) | ACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATGCCCGATGCTTACCGAAAGACATTGATCCGCCAGATTGGGCAGCATGCGCACTCCGAGATTGTTGGTATGTTGCCTGAAGGTAACTGGATCACTCGCGCACC > NC_000913/1453825‑1454096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |