| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,553,560 | (T)6→5 | coding (336/900 nt) | hemF → | coproporphyrinogen III oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,553,555 | 0 | T | . | 98.7% | 314.0 / ‑2.0 | 76 | coding (331/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base . (44/31); minor base G (1/0); total (45/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
AGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTG > NC_000913/2553427‑2553683 | aGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCg > 1:1070438/1‑140 (MQ=255)aGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCg > 2:9999/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGa > 2:562314/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGa > 2:413644/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGa > 1:704911/1‑140 (MQ=255) ggCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGa > 1:793240/1‑140 (MQ=255) gcatcgCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGaa > 1:964196/6‑140 (MQ=255) tGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGtttttat > 2:917288/1‑127 (MQ=255) tGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGtttttat < 1:917288/129‑3 (MQ=255) ccTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCg < 1:9999/140‑1 (MQ=255) tGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCggg > 1:1208663/1‑140 (MQ=255) cTTCCGCCACCGCTCATCGCCCAGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTg < 1:1606295/140‑1 (MQ=255) ccACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATc > 2:664786/1‑140 (MQ=255) ccACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATc < 1:1592248/140‑1 (MQ=255) ccACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATCGCCGAAAAACCGGGTGCCGATc > 1:452972/1‑140 (MQ=255) gCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTc < 2:1208663/140‑1 (MQ=255) cTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCt > 2:1270063/1‑140 (MQ=255) aTCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtggt > 2:1599588/1‑140 (MQ=255) cccGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGtt > 1:1156549/1‑140 (MQ=255) ccGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGttt > 1:694567/1‑140 (MQ=255) aaCTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCg < 1:185404/140‑1 (MQ=255) aaCTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCg < 1:980321/140‑1 (MQ=255) cTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGt > 2:1583193/1‑140 (MQ=255) ccGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCt < 1:317944/140‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCtt < 2:900760/140‑1 (MQ=255) gcgcAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGGATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAAGCGGGTGCAGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGATTCGa > 2:1467498/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGa > 1:1212574/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGa > 2:833749/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGa > 1:1226672/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGAGGCGATGAGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGa > 2:316124/1‑140 (MQ=255) gcAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACt < 2:694567/140‑1 (MQ=255) tttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAc > 2:1559362/1‑140 (MQ=255) ttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAcc < 2:1226672/140‑1 (MQ=255) ttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAcc < 2:704911/140‑1 (MQ=255) ttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAcc < 1:438421/140‑1 (MQ=255) ttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAcc < 1:967995/140‑1 (MQ=255) ttCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAAcc < 1:562314/140‑1 (MQ=255) gAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCa < 2:1223526/140‑1 (MQ=255) gATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTa < 2:1156549/140‑1 (MQ=255) gggCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATgg > 2:135612/1‑140 (MQ=255) gggCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGGGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATgg > 2:1030088/1‑140 (MQ=255) aCTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTgaaga < 1:1599588/140‑1 (MQ=255) aCTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTgaaga < 2:1212574/140‑1 (MQ=255) tGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCTCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGaagaag > 1:978593/1‑140 (MQ=255) tGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTAt > 1:1647488/1‑127 (MQ=255) tGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTAt < 2:1647488/127‑1 (MQ=255) tGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGaagaag < 1:197293/140‑1 (MQ=255) gTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTgaaga < 2:156666/136‑1 (MQ=255) gTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTgaaga > 1:156666/1‑136 (MQ=255) tAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATg < 1:1583193/140‑1 (MQ=255) tAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATg < 2:117966/140‑1 (MQ=255) aGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGc > 1:861693/1‑140 (MQ=255) gTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAagaaga < 1:1520550/136‑1 (MQ=255) gTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAagaaga > 2:1520550/1‑136 (MQ=255) gTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCt > 1:1289186/1‑140 (MQ=255) gTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCt > 2:1124782/1‑140 (MQ=255) tGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACAAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTa > 1:247285/1‑140 (MQ=255) cATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTAtt > 2:1194211/1‑140 (MQ=255) tCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTa > 1:53506/1‑136 (MQ=255) tCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTa < 2:53506/136‑1 (MQ=255) tCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCa > 2:229315/1‑140 (MQ=255) cGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCAc > 2:906940/1‑139 (MQ=255) cGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCAc < 1:906940/139‑1 (MQ=255) cATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTgg > 2:1326674/1‑140 (MQ=255) tAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCa > 2:202679/1‑140 (MQ=255) tAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCa > 2:1008678/1‑140 (MQ=255) gTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc < 2:964196/140‑1 (MQ=255) gTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATCGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc < 2:452972/140‑1 (MQ=255) aTGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTG‑GGGTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTTAAGAAGATGCTATTCACTGGGATCGCAACg > 2:1018157/1‑140 (MQ=255) gTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGcc < 1:1194211/140‑1 (MQ=255) tCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc < 2:491910/134‑1 (MQ=255) tCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc > 1:491910/1‑134 (MQ=255) cccACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc < 2:823747/133‑1 (MQ=255) cccACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCAc > 1:823747/1‑133 (MQ=255) cccACCAGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGt > 2:1258834/1‑140 (MQ=255) ccaccaGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTg > 1:724696/1‑140 (MQ=255) ccaGCCACGCGAATGTGCGG‑TGTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGAcc > 2:1178332/1‑140 (MQ=255) caGCCACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCt < 1:229315/140‑1 (MQ=255) ccACGCGAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCtgtg > 2:872559/1‑140 (MQ=255) gcgAATGTGCGG‑TTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGtgcctg > 1:715545/1‑140 (MQ=255) | AGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTG > NC_000913/2553427‑2553683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |