Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,453,860 | T→C | intergenic (‑218/‑67) | paaZ ← / → paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,453,860 | 0 | T | C | 100.0% | 283.5 / NA | 80 | intergenic (‑218/‑67) | paaZ/paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (53/27); total (53/27) |
AACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACTTTCATAAAACAATGTGATTCGTGTTTTTAATTAATTCACGAAAACTGGAATCGTAAAGGTGATGACGTGACCCAAGAAGAACGCTTTGAGCAACGGATAGCCCAGGAAACGGCTATCGAGCCACAGGACTGGATG > NC_000913/1453728‑1453995 | aaCTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACCTTCATaa < 1:1559999/140‑1 (MQ=255) tGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACCTTCATAAAACaa > 2:351170/1‑140 (MQ=255) gCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACAGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTGGTGATTTGACTTAACTATTGTGTAACCTTCATAAGACAAt > 2:1467426/1‑140 (MQ=255) tGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACTTAACTATTGTGTAACCTTCATAAAACAATGTGAtt > 2:811965/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |