| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,903,091 | A→G | T4A (ACC→GCC) | manY → | mannose‑specific PTS enzyme IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,903,091 | 0 | A | G | 99.1% | 410.9 / ‑4.7 | 116 | T4A (ACC→GCC) | manY | mannose‑specific PTS enzyme IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (60/55); total (61/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAAGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAACCGG > NC_000913/1902959‑1903227 | tAAGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCActct < 2:154889/140‑1 (MQ=255) aGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTc > 1:1052857/1‑140 (MQ=255) aGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTc > 2:1241497/1‑140 (MQ=255) aGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTc > 2:1084167/1‑140 (MQ=255) ttCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGTATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGAACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAAt > 2:1334123/1‑140 (MQ=255) tCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAAtt > 1:877834/1‑140 (MQ=255) tCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAAtt > 2:49861/1‑140 (MQ=255) tCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAAtt > 1:1612682/1‑140 (MQ=255) aCCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATtgtg < 1:1084167/140‑1 (MQ=255) aCCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATtgtg < 2:1553229/140‑1 (MQ=255) ccGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGc < 1:1028014/140‑1 (MQ=255) cGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCt < 1:1066178/140‑1 (MQ=255) gATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTg < 1:247496/140‑1 (MQ=255) aTCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATtgtg > 1:1380557/1‑136 (MQ=255) aTCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATtgtg < 2:1380557/136‑1 (MQ=255) tCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGt > 2:835276/1‑140 (MQ=255) cGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTAt < 2:877834/140‑1 (MQ=255) cGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATAGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGt < 2:577871/138‑1 (MQ=255) cGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATAGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGt > 1:577871/1‑138 (MQ=255) cTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATc < 2:620993/140‑1 (MQ=255) aaaaTGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATc > 1:1338469/1‑137 (MQ=255) aaaaTGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATc < 2:1338469/137‑1 (MQ=255) aaaaTGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTa < 1:1008144/140‑1 (MQ=255) aaaaTGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTa > 1:938325/1‑140 (MQ=255) atgGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGt < 2:1529083/140‑1 (MQ=255) aTCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCg < 1:517909/140‑1 (MQ=255) gATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAgg < 1:835276/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTa > 2:678354/1‑140 (MQ=255) tCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTa < 1:547514/140‑1 (MQ=255) aGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATg < 1:760080/140‑1 (MQ=255) cAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATggg > 1:473390/1‑140 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCg > 2:347525/1‑125 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCg < 1:347525/125‑1 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCaa > 1:952530/1‑140 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCaa > 2:110418/1‑140 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCaa > 2:122486/1‑140 (MQ=255) tCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCaa > 2:1302312/1‑140 (MQ=255) gTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAAt < 1:110418/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGCAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAg > 1:1113943/1‑140 (MQ=255) tgtTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAAt > 2:873658/1‑134 (MQ=255) tgtTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAAt < 1:873658/134‑1 (MQ=255) ctGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGttt > 2:250540/2‑140 (MQ=255) gATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCa > 1:546756/1‑140 (MQ=255) gATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCa > 2:1530145/1‑140 (MQ=255) aTTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCAc > 1:164826/1‑140 (MQ=255) cTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCATTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGc > 1:1289511/1‑140 (MQ=255) cTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGc > 1:930089/1‑140 (MQ=255) cTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGAAAACAGGAAAAGTACAATGAAGATGCCCACTCTTCAAATTGTGTTGGAATTTATCTAAGCCTGAATCGCAGGTATGGAACCAATCCTGGTTGAATTTCAGTTTCACCTTCCGc > 2:1052898/1‑140 (MQ=255) aGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTaa > 1:900735/1‑140 (MQ=255) aGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTaa > 1:1522584/1‑140 (MQ=255) aGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTaa > 2:1403632/1‑140 (MQ=255) gTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAAt < 1:1530145/140‑1 (MQ=255) cacTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATAGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCgtgt < 2:1443606/140‑1 (MQ=255) acTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTa < 2:1538324/140‑1 (MQ=255) acTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTa < 2:1175130/140‑1 (MQ=255) ttAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAcc < 1:1403632/140‑1 (MQ=255) tAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAccc > 2:242843/1‑140 (MQ=255) tAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAccc > 2:764061/1‑140 (MQ=255) tCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCtggt < 2:164826/140‑1 (MQ=255) tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATTGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTggg > 2:80751/1‑140 (MQ=255) tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAcc < 2:10344/132‑1 (MQ=255) tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAcc > 1:10344/1‑132 (MQ=255) tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGAATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTAcc > 1:1408044/1‑132 (MQ=255) cGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTa > 2:373098/1‑128 (MQ=255) cGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTa < 1:373098/128‑1 (MQ=255) cGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTa > 1:102776/1‑140 (MQ=255) cGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTa > 1:468594/1‑140 (MQ=255) gTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTAt < 2:911032/140‑1 (MQ=255) aCAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCtggt < 2:1100382/130‑1 (MQ=255) aCAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCtggt > 1:1100382/1‑130 (MQ=255) aCAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGtt > 1:1318466/1‑140 (MQ=255) aCAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGtt > 1:992585/1‑140 (MQ=255) aCAGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGtt > 1:359727/1‑140 (MQ=255) aGGAGAAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCt < 2:253866/140‑1 (MQ=255) gagaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTg > 1:1099321/1‑140 (MQ=255) gagaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTg > 1:681016/1‑140 (MQ=255) gagaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTg > 2:679960/1‑140 (MQ=255) gagaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGAAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTg > 2:338462/1‑140 (MQ=255) gaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTggg < 1:122486/140‑1 (MQ=255) gaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTggg < 1:768220/140‑1 (MQ=255) gaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTggg < 2:1099321/140‑1 (MQ=255) gaAGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGAGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTggg < 1:678354/140‑1 (MQ=255) aGTACAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGa < 2:546756/140‑1 (MQ=255) cAATGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATg > 2:1201246/1‑140 (MQ=255) aTGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaa < 2:1585919/140‑1 (MQ=255) aTGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaa > 1:1340277/1‑140 (MQ=255) tGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaaa > 2:1055870/1‑140 (MQ=255) tGGAGATTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaaa > 1:1411682/1‑140 (MQ=255) gagaTTGCCATTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 2:1289511/140‑1 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 1:242843/140‑1 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 1:1302312/140‑1 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 1:287158/140‑1 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc > 2:1204213/1‑140 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 1:1052898/140‑1 (MQ=255) gagaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 2:1318466/140‑1 (MQ=255) agaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaaaa > 1:267225/1‑138 (MQ=255) agaTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGaaaa < 2:267225/138‑1 (MQ=255) aTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAAc < 1:1623194/137‑1 (MQ=255) aTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAACCgg > 2:371268/1‑140 (MQ=255) aTTGCCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAACCgg > 2:29285/1‑140 (MQ=255) | TAAGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTTGGGGATATGAAAACCGG > NC_000913/1902959‑1903227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |