| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,376,094 | (CG)4→3 | coding (1226‑1227/1368 nt) | dcuD → | putative transporter DcuD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,376,088 | 0 | C | . | 100.0% | 372.6 / NA | 87 | coding (1220/1368 nt) | dcuD | putative transporter DcuD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (43/44); total (43/44) | |||||||||||
TTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATGATTGCCACAATCACG > NC_000913/3375950‑3376224 || ttGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAgcg > 1:461966/1‑140 (MQ=255)ttGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAgcg < 1:667833/140‑1 (MQ=255) tGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAgcgc > 1:709338/1‑140 (MQ=255) ttGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAgcgcgcggtt > 1:893482/1‑137 (MQ=255) 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> 1:808846/1‑140 (MQ=255) aTTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCa < 2:630991/140‑1 (MQ=255) aTTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCa < 2:1241655/140‑1 (MQ=255) ttGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGtt < 2:1367601/123‑1 (MQ=255) ttGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGtt > 1:1367601/1‑123 (MQ=255) ttGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAgg > 1:769695/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGc > 1:1067995/1‑140 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2:257661/1‑140 (MQ=255) gCATTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATg > 2:1389268/1‑140 (MQ=255) aTTTTGCCACGACGCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATGAt < 2:250457/140‑1 (MQ=255) cgacgCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATGATTGCCACAAt > 1:1360168/1‑140 (MQ=255) cgacgCTA‑‑GCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATGATTGCCACAAt < 1:902442/140‑1 (MQ=255) caGCGCGCGCGCTTACGCCGATTACCGCGGTGGTGGTCGTTACCTCAATACTTCCAGGCCCTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGTACAGCGATCCCCATGGCATTCGGTTTCGTGGTGAATATGATTGCCACAATCACg < 2:543751/139‑1 (MQ=255) || TTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGAATATGATTGCCACAATCACG > NC_000913/3375950‑3376224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |