| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 149,662 | (G)5→6 | intergenic (‑61/+53) | panB ← / ← yadC | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase/fimbrial tip‑adhesin YadC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 149,657 | 1 | . | G | 98.7% | 260.2 / ‑3.3 | 75 | intergenic (‑56/+58) | panB/yadC | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase/fimbrial tip‑adhesin YadC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (45/29); total (45/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.10e-01 | |||||||||||
AGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑GGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTG > NC_000913/149523‑149786 | aGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggg > 1:18129/1‑140 (MQ=255) cATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggca < 1:433430/140‑4 (MQ=255) cATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTGTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggca < 2:96747/140‑4 (MQ=255) aTAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggcaa > 1:1294789/1‑136 (MQ=255) tAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggcaat > 1:1227609/1‑135 (MQ=255) tAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggcaat > 2:223101/1‑135 (MQ=255) aaGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATg > 1:735319/1‑140 (MQ=255) aaGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATg > 1:809349/1‑140 (MQ=255) aaGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATg > 1:4747/1‑140 (MQ=255) aaGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATg > 1:588017/1‑140 (MQ=255) aGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGa > 2:512259/1‑140 (MQ=255) gCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGAt < 2:321795/140‑1 (MQ=255) gTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTa > 2:521539/1‑140 (MQ=255) gTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTa > 1:1380600/1‑140 (MQ=255) gTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTa > 2:154916/1‑140 (MQ=255) tGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTAt > 2:794708/1‑140 (MQ=255) tGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTAt > 2:161207/1‑140 (MQ=255) tGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTAt > 1:44130/1‑140 (MQ=255) tGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggc > 2:339111/1‑128 (MQ=255) tGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑ggggggc < 1:339111/130‑3 (MQ=255) gATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATc < 1:326220/140‑1 (MQ=255) gcgAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTagca > 2:771962/1‑140 (MQ=255) cgAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTagcag < 2:44130/140‑1 (MQ=255) cgAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTagcag < 1:407853/140‑1 (MQ=255) gAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTagcagc < 2:1294789/140‑1 (MQ=255) gAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTagcagc > 2:714590/1‑140 (MQ=255) ttttttttCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGcc > 2:616165/1‑140 (MQ=255) tttttCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGa < 1:980845/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGa < 1:714590/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACa < 2:1379383/140‑1 (MQ=255) tttGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAg < 1:715524/140‑1 (MQ=255) tGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGtg < 2:18129/140‑1 (MQ=255) tACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGtgct < 2:723276/140‑1 (MQ=255) aCTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGtgctg < 2:1122879/140‑1 (MQ=255) cTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑GGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTgctgct < 1:1121341/140‑1 (MQ=255) cTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTAc > 1:1083940/1‑140 (MQ=255) cTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTACCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTAc > 1:516901/1‑140 (MQ=255) tGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACg < 1:1293342/140‑1 (MQ=255) tGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACg < 2:597791/140‑1 (MQ=255) tGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACg < 2:1344453/140‑1 (MQ=255) cAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGtt > 2:301973/1‑140 (MQ=255) cAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGtt > 1:600443/1‑140 (MQ=255) cAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGtt > 2:1122761/1‑140 (MQ=255) aGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTa < 1:1122761/140‑1 (MQ=255) gTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTAt < 1:512259/140‑1 (MQ=255) gTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTAt < 1:161207/140‑1 (MQ=255) agaTGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGa > 2:163244/1‑140 (MQ=255) agaTGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGa > 2:811357/1‑140 (MQ=255) agaTGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGa > 2:200808/1‑140 (MQ=255) aTGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATa > 1:247640/1‑140 (MQ=255) ggtggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAgg < 1:939235/140‑1 (MQ=255) gtggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGt > 2:1069538/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGt > 1:443187/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGt > 1:311780/1‑140 (MQ=255) tggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGtt < 1:771962/140‑1 (MQ=255) ggtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTa > 2:478385/1‑140 (MQ=255) gtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTAc > 2:1135547/1‑140 (MQ=255) gtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTAc < 2:735319/140‑1 (MQ=255) gtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTAc < 1:811357/140‑1 (MQ=255) gtCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTAc < 2:1227609/140‑1 (MQ=255) tCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTAcc > 1:445339/1‑140 (MQ=255) tCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGaaa > 2:117974/1‑140 (MQ=255) tATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACtggt > 2:279027/1‑140 (MQ=255) tATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACtggt > 1:1324131/1‑140 (MQ=255) ccTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGc > 1:343900/1‑140 (MQ=255) gATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCttt > 2:725199/1‑140 (MQ=255) tgttgtGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGGACTGGTGGCTTTAAATTCGCCg > 1:997702/1‑140 (MQ=255) gttgtGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCg < 2:233841/136‑1 (MQ=255) gttgtGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCg > 1:233841/1‑136 (MQ=255) tgtgCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGt > 1:258135/1‑140 (MQ=255) tgCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTc > 1:1020142/1‑140 (MQ=255) tgCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTc > 2:114397/1‑140 (MQ=255) gCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCg < 1:114397/140‑1 (MQ=255) gCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCg > 1:425746/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAg > 1:1358942/1‑140 (MQ=255) tGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCTAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCa > 1:41921/1‑140 (MQ=255) tGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCa > 2:1195639/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCaa < 1:1242075/140‑1 (MQ=255) tATCAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCAGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTccc > 2:1065347/1‑140 (MQ=255) cAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTc < 2:443187/140‑1 (MQ=255) cAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTc < 1:1195639/140‑1 (MQ=255) cAGTCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTc < 2:1083940/140‑1 (MQ=255) tCACATTGGTGGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTg > 1:186631/1‑140 (MQ=255) | AGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGT‑GGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTG > NC_000913/149523‑149786 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |