| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,456,803 | (C)6→7 | coding (427/1953 nt) | gspD → | Type II secretion system protein GspD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,456,797 | 1 | . | C | 96.5% | 376.9 / 5.2 | 113 | coding (421/1953 nt) | gspD | Type II secretion system protein GspD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base C (43/66); total (45/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AATGGTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑CC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTGAT > NC_000913/3456659‑3456931 | aaTGGTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑c > 1:31410/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑cc‑c > 1:1126329/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGCGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑cc‑c > 2:268653/1‑140 (MQ=255) ggTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑cc‑cc > 1:761668/1‑140 (MQ=255) ttCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑cc‑ccccct > 1:373809/1‑138 (MQ=255) tCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑cc‑ccccctg > 1:1174490/1‑137 (MQ=255) aaGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCg < 2:1174490/140‑1 (MQ=255) aaGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCg < 2:47032/140‑1 (MQ=255) aGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGc < 2:269078/140‑1 (MQ=255) aGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGc > 2:936606/1‑140 (MQ=255) aGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGc < 2:1254626/140‑1 (MQ=255) gTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAga > 2:1044394/1‑140 (MQ=255) gCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTACTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAgatgat > 2:429104/1‑140 (MQ=255) cTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGatgatg < 1:1120059/140‑1 (MQ=255) gCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATgatggatg > 1:14591/1‑140 (MQ=255) tAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAg < 2:666637/140‑1 (MQ=255) aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 1:1351546/140‑1 (MQ=255) aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 1:251017/140‑1 (MQ=255) aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 2:1318116/140‑1 (MQ=255) aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 2:460055/140‑1 (MQ=255) aaaaaCATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGc < 1:809482/140‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGt > 1:628802/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTa < 2:1146386/140‑1 (MQ=255) cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTaa > 2:1076784/1‑140 (MQ=255) cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTaa > 1:414024/1‑140 (MQ=255) cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTaa > 2:1152921/1‑140 (MQ=255) cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTaa > 1:1145752/1‑140 (MQ=255) cGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑CC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAt > 1:284250/1‑140 (MQ=255) aGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgtt < 2:357370/140‑1 (MQ=255) ggATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 1:936606/140‑1 (MQ=255) ggATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 2:373809/140‑1 (MQ=255) ggATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 1:863112/140‑1 (MQ=255) ggATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAAtgttgt < 1:1231708/140‑1 (MQ=255) gatgatTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTtgtg < 1:1039621/140‑1 (MQ=255) atgatTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGc > 1:109233/1‑140 (MQ=255) atgatTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGc < 2:290829/140‑1 (MQ=255) atTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCAtt > 2:959486/1‑140 (MQ=255) atTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCAtt > 2:911207/1‑140 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ggTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGa > 1:261348/1‑140 (MQ=255) ggTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGa < 2:761668/140‑1 (MQ=255) gTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa < 1:396933/125‑1 (MQ=255) gTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCaa > 2:396933/1‑125 (MQ=255) atgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑CC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt < 2:284250/140‑1 (MQ=255) tgaGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGt > 1:1000713/1‑140 (MQ=255) 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1:241643/140‑1 (MQ=255) cccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac < 1:1049575/140‑1 (MQ=255) cccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccac < 1:367289/140‑1 (MQ=255) ccGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccacc < 2:1079564/140‑1 (MQ=255) cGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTccacca < 2:628802/140‑1 (MQ=255) aCCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATaaa < 2:1326084/140‑1 (MQ=255) cTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGa > 2:354181/1‑140 (MQ=255) ttGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAt > 1:800127/1‑140 (MQ=255) ttGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAt < 1:626388/140‑1 (MQ=255) tGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAtt > 2:215074/1‑140 (MQ=255) gagaACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTg < 1:40347/140‑1 (MQ=255) gagaACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTg > 2:369402/1‑140 (MQ=255) gaACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAt < 2:895871/136‑1 (MQ=255) gaACGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGAt > 1:895871/1‑136 (MQ=255) cGTTCCTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTc > 1:336485/1‑140 (MQ=255) cTGCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATaaa > 1:859330/1‑140 (MQ=255) gCTCGTGACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAgc > 1:296884/1‑140 (MQ=255) tGACCTGG‑CCGCCCCTGCCCCGCCAGATGATGGATGCGCGTAGCGTCGGTAATGGTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGGCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGGGGGtt > 2:1047512/1‑140 (MQ=255) gACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTg > 2:61985/1‑140 (MQ=255) gACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTg > 1:300889/1‑140 (MQ=255) gACCTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTg > 2:1115970/1‑140 (MQ=255) ccTGGCCC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTGAt < 2:296884/140‑1 (MQ=255) | AATGGTTTTCTGAAAGTGGTTCGCTCAGCTAATGTAAAAACATCGCCAGGGATGATTGCTGACAGTTCTCGTCCAGGCGTAGGTGATGAGTTGGTCACCCGAATTGTACCGCTTGAGAACGTTCCTGCTCGTGACCTGG‑CC‑CCCCTGCTCCGCCAGATGATGGATGCGGGTAGCGTCGGTAATGTTGTGCATTATGAACCCTCCAACGTTCTTATTCTGACCGGTCGTGCCTCCACCATTAATAAACTGATTGAAGTCATAAAGCGCGTTGAT > NC_000913/3456659‑3456931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |