| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,594,256 | (C)8→9 | pseudogene (3831/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,594,248 | 1 | . | C | 93.9% | 215.2 / 6.3 | 66 | pseudogene (3839/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base C (37/25); total (39/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
AGCGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAG > NC_000913/1594111‑1594377 | aGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑ccc < 2:1084521/140‑1 (MQ=255)aGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑ccc > 2:1150334/1‑140 (MQ=255) cGACACGCAGTG‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑ccccc > 1:584397/1‑140 (MQ=255) acGCAGTG‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑cc < 2:1172796/133‑1 (MQ=255) acGCAGTG‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGACGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑cc > 1:1172796/1‑133 (MQ=255) tgcccccccAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGata > 1:825155/3‑140 (MQ=255) ccccAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCcgt > 1:217752/1‑140 (MQ=255) cccAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCcgtc < 1:56835/140‑1 (MQ=255) ggCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTAc > 2:70712/1‑140 (MQ=255) cGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATa < 1:922102/140‑1 (MQ=255) cGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATa < 1:278129/140‑1 (MQ=255) tCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgc > 2:801653/1‑140 (MQ=255) ccTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAAt > 1:973924/1‑140 (MQ=255) cTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc > 1:596821/1‑140 (MQ=255) tGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg > 1:293395/1‑140 (MQ=255) gtggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgt > 2:1353272/1‑140 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTaa > 2:1224656/1‑140 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTaa > 2:1244607/1‑140 (MQ=255) tgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAag < 1:1074455/140‑1 (MQ=255) gACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAaga > 1:224394/1‑140 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTc > 2:959942/1‑140 (MQ=255) cATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCg < 1:40106/140‑1 (MQ=255) cacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAcc > 1:383740/1‑140 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt > 2:66423/1‑140 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTg > 1:1137036/1‑140 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGt < 2:739453/140‑1 (MQ=255) ggATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcac < 2:596821/140‑1 (MQ=255) atTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCa > 2:352281/1‑140 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 1:1001924/1‑140 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 1:147230/1‑140 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 1:537432/1‑140 (MQ=255) aaTGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg < 1:70712/140‑1 (MQ=255) aTGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 1:1410435/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 1:1237196/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct > 2:455080/1‑140 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 2:147230/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct > 1:463946/1‑140 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 2:463946/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 2:1137036/140‑1 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 2:825155/140‑1 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctacc > 1:198575/1‑140 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 2:741792/139‑1 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac > 1:741792/1‑139 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccg > 1:160293/1‑140 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTCCCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctacc > 2:41776/1‑140 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAGGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccg > 1:1142031/1‑140 (MQ=255) tGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATa < 2:160293/140‑1 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATAc > 1:456619/1‑140 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCCCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATAc > 1:498177/1‑140 (MQ=255) ccATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACt > 1:1331194/1‑140 (MQ=255) ccATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACtg > 1:886792/1‑140 (MQ=255) atatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACtgt > 2:128536/1‑140 (MQ=255) tAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGt < 2:78789/140‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATc > 2:338378/1‑140 (MQ=255) agagTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGcc < 1:352281/140‑1 (MQ=255) gagTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGccc > 1:74830/1‑140 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCa > 1:564810/1‑140 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCa > 2:83322/1‑140 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCa > 1:1174753/1‑140 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCa > 1:1106318/1‑140 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGc > 2:419520/1‑140 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGc > 2:690043/1‑140 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGc < 2:1174753/140‑1 (MQ=255) cGGAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCt < 2:456619/140‑1 (MQ=255) gAACCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTAc < 2:584397/140‑1 (MQ=255) aaCCGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACg < 2:973924/140‑1 (MQ=255) cGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTc < 1:801653/140‑1 (MQ=255) cGAAAGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTc < 1:1224656/140‑1 (MQ=255) aaaGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAg < 1:959942/140‑1 (MQ=255) aaaGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAg < 2:826263/140‑1 (MQ=255) aaaGCAA‑TTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAg < 2:293395/140‑1 (MQ=255) | AGCGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAG > NC_000913/1594111‑1594377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |