| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,028,917 | A→G | D685D (GAT→GAC) | fadB ← | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,028,917 | 0 | A | G | 100.0% | 296.2 / NA | 78 | D685D (GAT→GAC) | fadB | dodecenoyl‑CoA delta‑isomerase, enoyl‑CoA hydratase, 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase, 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/36); total (42/36) | |||||||||||
CTTAAGCCGTTTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATATCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAGCGC > NC_000913/4028781‑4029052 | cTTAAGCCGTTTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCg > 2:7871/1‑140 (MQ=255) aaGCCGTTTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAgg > 1:903425/1‑140 (MQ=255) aGCCGTTTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGt > 1:739548/1‑140 (MQ=255) aGCCGTCTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGt > 1:98475/1‑140 (MQ=255) ttCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTgc < 2:637464/140‑1 (MQ=255) ttCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTgc < 2:98475/140‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTgcgc < 1:17007/140‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTgcgc < 1:7871/140‑1 (MQ=255) gTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTAc < 1:762152/140‑1 (MQ=255) gCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGa > 2:386018/1‑140 (MQ=255) ccGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAAcgcg < 2:655161/140‑1 (MQ=255) gaggaTAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGcgccg < 2:312418/140‑1 (MQ=255) gaggaTAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGcgccg < 1:418038/140‑1 (MQ=255) aggaTAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGcgccgc > 1:695362/1‑140 (MQ=255) aGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTgg > 1:560490/1‑140 (MQ=255) tACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGaa < 2:1033557/140‑1 (MQ=255) cGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACg < 1:612707/140‑1 (MQ=255) cGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACg < 2:686797/140‑1 (MQ=255) ttCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAg > 1:1186346/1‑140 (MQ=255) ttCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGAGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAg > 1:1177970/1‑140 (MQ=255) tCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAgg < 2:1186346/140‑1 (MQ=255) gTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGa > 2:560753/1‑140 (MQ=255) tGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGcc < 1:521975/140‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATCTTGCAGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCa < 2:1177970/140‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCa < 2:1182081/140‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCa > 2:323430/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAg > 1:1144763/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAgg < 2:695362/140‑1 (MQ=255) cgcTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCTCAGGc > 1:1007978/1‑140 (MQ=255) cgcTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGc > 1:40801/1‑140 (MQ=255) cgcTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGc > 2:1177781/1‑140 (MQ=255) taCGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGAcc < 1:1177781/140‑1 (MQ=255) aCGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCa < 2:941925/140‑1 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< 1:1013485/140‑1 (MQ=255) aGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGt < 1:1147802/140‑1 (MQ=255) cGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTgg > 1:1200724/1‑140 (MQ=255) gggCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGc > 1:175054/1‑140 (MQ=255) gggCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGc > 2:562382/1‑140 (MQ=255) ggCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCg > 2:631745/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTCCCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCTCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc < 2:1007978/140‑1 (MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc < 1:615860/140‑1 (MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc < 1:246469/140‑1 (MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc < 1:560753/140‑1 (MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc > 1:58312/1‑140 (MQ=255) tGCTGATATTGCTGTGCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGcc < 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tgCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgc > 1:529994/1‑140 (MQ=255) gCCATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgcg > 1:692625/1‑140 (MQ=255) ccATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgcgc > 1:137827/1‑140 (MQ=255) ccATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgcgc > 2:429884/1‑140 (MQ=255) ccATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgcgc > 1:1085385/1‑140 (MQ=255) ccATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAgcgc > 2:1082732/1‑140 (MQ=255) ccATGTCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGAGGCGATAATGCCTTCCTCCCGACAgcgc > 2:324458/1‑140 (MQ=255) | CTTAAGCCGTTTTCAGGTCGCCAACCGGACGGGCTGGCTCAACCGGAGGATAGTACGGTTCGTTATGACGCGCTTTATTACGCAGACCTTCCGGCACTTCATACAGCGGGCCGAGGTGCTGATATTGCTGTGCCATATCGAGGTATTTTGCGCTACCGAGGGTGTCCAGCCAGCGGAACGCGCCGCCGTGGAACGGAGGGAAGCCCAGGCCGTAGACCAGCGCCATATCCGCTTCCGCCGGAGTGGCGATAATGCCTTCCTCCAGACAGCGC > NC_000913/4028781‑4029052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |