| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 509,462 | +T | coding (1918/2505 nt) | copA ← | Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 509,459 | 1 | . | T | 94.8% | 193.9 / 2.0 | 58 | coding (1921/2505 nt) | copA | Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base T (41/14); total (41/17) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.20e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCTTCTTTGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑TTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGACCT > NC_000913/509320‑509592 | gCTTCTTTGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑c > 2:583375/1‑140 (MQ=255) tttGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑ttttc > 1:421959/1‑138 (MQ=255) tttGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑ttttc > 1:984736/1‑138 (MQ=255) ggggtTGGGTTACCCCCGGTCAACACCCCCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCCCCGCCCCGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAgcagca < 2:1001927/138‑1 (MQ=255) tggtTGGGTTACCCCCGGTCAACATCCCCAGACGATATCCCGCTTTATGCGGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCCCTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CTCGTCAACCGCCAGCAGcac < 2:63029/140‑1 (MQ=255) gtTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAg > 1:311474/1‑140 (MQ=255) ggTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGt > 2:14793/1‑140 (MQ=255) aTCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGcc > 2:820040/1‑140 (MQ=255) aTCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGcc > 1:531619/1‑140 (MQ=255) tCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CTCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGccc > 1:63029/1‑140 (MQ=255) gTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCg > 1:145054/1‑140 (MQ=255) aCATCCCCAGACGATATCCCGTTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACTGATCGCGTACTGCCGGCGGGGCT‑ACCG‑T‑TTTCCCCGGCAGCCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGc < 2:222229/140‑1 (MQ=255) aCATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGctgtct > 1:503623/1‑135 (MQ=255) cATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGcc > 1:505803/1‑140 (MQ=255) cccAGACGATATCCCGTTTTATGCGGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑CCCGTT‑TTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAg < 2:421959/139‑1 (MQ=255) ccAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGc > 1:858469/1‑140 (MQ=255) cAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCa > 1:457835/1‑140 (MQ=255) gACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGt > 1:281889/1‑140 (MQ=255) gACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGt < 2:145054/140‑1 (MQ=255) cGATATCCCGCTTTATGCATGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTaa > 1:1156835/1‑140 (MQ=255) gATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAAt > 1:354499/1‑140 (MQ=255) atatCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑CCCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAAtc < 2:354499/140‑1 (MQ=255) tatCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAAtct > 1:962582/1‑140 (MQ=255) cccGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCTCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCg > 2:352261/1‑140 (MQ=255) ccGTTTTATGGGGGCGTTGCAGCCCCGCCACGCTTTCACTCCGCAACGGATCGCGTCCCGCCAGCAGGGCTCCCCT‑T‑TTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATATCCGc < 2:984736/140‑1 (MQ=255) gCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCtt > 1:410165/1‑140 (MQ=255) tATGCGGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑TTTCCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGAt < 2:771002/140‑1 (MQ=255) tATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGAt > 1:1066762/1‑140 (MQ=255) tATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGAt > 2:366046/1‑140 (MQ=255) tATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGAt > 1:775517/1‑140 (MQ=255) tGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAg > 1:154376/1‑140 (MQ=255) gggCGTTGCGGCCCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCtt < 2:962582/139‑1 (MQ=255) ttGCAGCGCCGCCCCGCTATCCCTCCGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑CCCGTT‑TTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTa < 2:154376/140‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCtt < 2:411411/133‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCtt > 1:411411/1‑133 (MQ=255) gCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTAcc < 2:410165/140‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTAcc > 1:806296/1‑140 (MQ=255) aGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTAcctg > 1:694654/1‑138 (MQ=255) gccccgccACGCTATCACTACGCAACGGACCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCC‑C‑TTTCCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAAc < 1:32771/137‑1 (MQ=255) gccACGCTATCCCTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑TTTCCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGtt < 1:86637/140‑1 (MQ=255) cccACGCTATCACTCCGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑CCCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGtt < 2:505803/139‑1 (MQ=255) cccACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTCCTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGtt < 2:311474/139‑1 (MQ=255) cccACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGtt < 1:462645/139‑1 (MQ=255) ccACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTg > 1:827280/1‑140 (MQ=255) ccACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCACCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTg > 1:126957/1‑140 (MQ=255) ccACGCTACCCCTCCGCACCGGATCGCGTACGGCCAGCGGGGCT‑CCCG‑C‑TTTCCCCGCCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTg < 2:858469/140‑1 (MQ=255) cACGCTATCCCTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGCCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGc < 2:1043787/140‑1 (MQ=255) cACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGc < 2:281889/140‑1 (MQ=255) cagtCACTACGCAGCGGAGCGGGTCCTGCCAGGAGGGCT‑CCCG‑C‑TTTCCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCAt < 2:1114428/137‑1 (MQ=255) cGCAAGGTATCGCTTACCGCCAGATGGCCT‑CCCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAgcg < 2:539549/140‑1 (MQ=255) cGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAgcg > 2:258677/1‑140 (MQ=255) cGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAgcg > 1:127596/1‑140 (MQ=255) aCGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTg > 1:493001/1‑140 (MQ=255) aCGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTg > 2:913681/1‑140 (MQ=255) aCGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTg > 1:931872/1‑140 (MQ=255) cGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGccctg > 1:1114428/1‑137 (MQ=255) aTCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTg > 1:539549/1‑140 (MQ=255) cgcgTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGcc < 1:820040/140‑1 (MQ=255) cgcgTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGcc > 2:1105464/1‑140 (MQ=255) gcgTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGccc < 1:14793/140‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATaa > 1:844007/1‑140 (MQ=255) ccAGCAGGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATaa > 1:602772/1‑140 (MQ=255) agcagGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACg < 1:583375/140‑1 (MQ=255) gcagGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGc > 1:1016699/1‑140 (MQ=255) cagGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCa < 2:1016699/140‑1 (MQ=255) agGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGcc < 1:305974/126‑1 (MQ=255) agGGCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGcc > 2:305974/1‑126 (MQ=255) gCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGAc > 2:488579/1‑140 (MQ=255) gCT‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGAc > 2:1175/1‑140 (MQ=255) t‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGACCt > 1:299994/1‑140 (MQ=255) t‑ACCG‑CTTTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGACCt > 2:868903/1‑140 (MQ=255) | GCTTCTTTGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCT‑ACCG‑C‑TTT‑CCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGACCT > NC_000913/509320‑509592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |