Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,043,639 | T→C | D191G (GAC→GGC) | etk ← | protein‑tyrosine kinase Etk |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,043,639 | 0 | T | C | 98.8% | 297.9 / ‑6.1 | 83 | D191G (GAC→GGC) | etk | protein‑tyrosine kinase Etk |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (37/45); total (38/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAGTCATGGTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGTCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGATCCTGACCATT > NC_000913/1043504‑1043772 | ccAGTCATGGTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCcgc > 2:484723/1‑140 (MQ=255) ccAGTCATGGTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCcgc > 2:756421/1‑140 (MQ=255) cAGTCATGGTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCcgcg > 1:1113602/1‑140 (MQ=255) ggTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCa > 1:106790/1‑140 (MQ=255) ggTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCa > 2:586923/1‑140 (MQ=255) aGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAgcgc < 2:582212/140‑1 (MQ=255) gTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCa > 2:862198/1‑140 (MQ=255) ttCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCaa > 1:465142/1‑140 (MQ=255) ttCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCaa > 1:1010881/1‑140 (MQ=255) ccAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACg > 1:84508/1‑140 (MQ=255) cAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGc > 1:879217/1‑140 (MQ=255) gCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCa > 1:934818/1‑140 (MQ=255) tCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCt > 1:205372/1‑140 (MQ=255) ccGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGTCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCttt > 1:489019/1‑140 (MQ=255) tctttACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAg > 2:912017/1‑140 (MQ=255) tctttACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAg > 2:114387/1‑140 (MQ=255) ctttACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGa < 1:858530/140‑1 (MQ=255) tACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGc < 1:672933/140‑1 (MQ=255) gCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGTCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGc < 2:489019/140‑1 (MQ=255) gCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGc < 1:862198/140‑1 (MQ=255) cGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGcc < 2:569212/140‑1 (MQ=255) ttCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCtt > 2:10318/1‑122 (MQ=255) ttCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCtt < 1:10318/122‑1 (MQ=255) ttCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGa > 2:779831/1‑140 (MQ=255) ttCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGa > 1:1063251/1‑140 (MQ=255) cGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGacc < 1:912017/140‑1 (MQ=255) cGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGacc < 2:903669/140‑1 (MQ=255) cGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGacc < 2:934123/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTg < 1:981873/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTg < 2:260991/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTg < 1:156923/140‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACg > 2:1036449/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTTATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGaa > 2:983659/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGacc > 2:331355/1‑123 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGacc < 1:331355/123‑1 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGaa > 2:377552/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGaa > 2:173583/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGaa > 1:364671/1‑140 (MQ=255) tCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGaa > 2:739345/1‑140 (MQ=255) ccTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAAc > 1:240156/1‑140 (MQ=255) cTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAAct < 1:912958/140‑1 (MQ=255) gCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAActct < 2:84508/140‑1 (MQ=255) aTGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCa < 2:364671/140‑1 (MQ=255) aTGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCa < 2:879217/140‑1 (MQ=255) aTGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAACGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCa < 2:1010881/140‑1 (MQ=255) gCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGTACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCAcc < 2:971617/140‑1 (MQ=255) gCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCAcc < 2:719813/140‑1 (MQ=255) gCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCAcc < 2:240156/140‑1 (MQ=255) cGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCt > 2:944198/1‑140 (MQ=255) gTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCtt < 1:377552/140‑1 (MQ=255) gTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCtt < 1:484723/140‑1 (MQ=255) ttAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTc < 2:106790/140‑1 (MQ=255) ttAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTc < 1:173583/140‑1 (MQ=255) ttAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTc < 2:465142/140‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCAcc > 1:235779/1‑130 (MQ=255) cTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCAcc < 2:235779/130‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGta < 1:1036449/140‑1 (MQ=255) ttCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCtt < 1:1080571/131‑1 (MQ=255) ttCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGtat > 2:898315/1‑140 (MQ=255) ttCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGACCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCtt > 2:1080571/1‑131 (MQ=255) gTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGtt > 2:357836/1‑140 (MQ=255) gTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGtt > 2:542470/1‑140 (MQ=255) gTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGtt < 1:739345/140‑1 (MQ=255) cAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAAcc < 2:163727/139‑1 (MQ=255) cAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAAcc > 1:163727/1‑139 (MQ=255) cAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCg < 1:756421/140‑1 (MQ=255) cAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCg > 2:53888/1‑140 (MQ=255) aCAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAg < 1:357836/140‑1 (MQ=255) aCAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAg < 1:542470/140‑1 (MQ=255) cAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAgt < 1:779831/140‑1 (MQ=255) cAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAgt < 2:205372/140‑1 (MQ=255) aCTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTcccc > 1:895156/1‑127 (MQ=255) aCTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTcccc < 2:895156/127‑1 (MQ=255) cTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCTGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCa < 1:1104396/140‑1 (MQ=255) gtTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTg < 2:1127998/140‑1 (MQ=255) gtTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTg < 1:114387/140‑1 (MQ=255) gtTCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTg < 1:3288/140‑1 (MQ=255) ttCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGc > 1:358082/1‑140 (MQ=255) ttCCTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGc < 2:934818/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTg > 2:946100/1‑140 (MQ=255) tGGTTTGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGAt > 1:280940/1‑140 (MQ=255) tttGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGATCCt < 1:944198/140‑1 (MQ=255) tttGGCCTTAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGATCCt < 1:440024/140‑1 (MQ=255) ttAATGCCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGATCCTGACCAtt < 1:289033/140‑1 (MQ=255) | CCAGTCATGGTAAGTTCCAGCATCCCGCTTTCTTTACTGCGTTCGCTAACGGTAAAGGTTTCCTGCAATGCGTTAATCGCTTCCAGTTCGGTACGCTGGCTCAGGACAAACTGTGTTCCTGGTTTGGCCTTAATGTCCGCGATAGTCAGCGCAACGCCATCTTTTTCCAGACGCTGGCCGACCATACCATTGACGGTGAACTCTTCACCTTCCAGTGTATAGTGGCCGTTTTCCCCAACCGTGAGTGTCAGTTGCTGATCCTGACCATT > NC_000913/1043504‑1043772 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |