| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,420,167 | T→C | K25K (AAA→AAG) | racR ← | Rac prophage; DNA‑binding transcriptional repressor RacR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,420,167 | 0 | T | C | 98.8% | 307.2 / NA | 86 | K25K (AAA→AAG) | racR | Rac prophage; DNA‑binding transcriptional repressor RacR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (37/48); minor base A (1/0); total (38/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAATGCTCTGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGCACA > NC_000913/1420030‑1420303 | cAATGCTCTGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAACCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCtttgactt > 2:435445/1‑140 (MQ=255) tGCTCTGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTttgacttgac < 1:709094/140‑1 (MQ=255) ctGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGAt > 1:887626/1‑140 (MQ=255) tGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATc > 2:38368/1‑140 (MQ=255) tGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTCTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATc > 1:626253/1‑140 (MQ=255) ggACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATcc > 1:934942/1‑140 (MQ=255) gACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATccc > 1:900557/1‑140 (MQ=255) gACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATccc < 2:988665/140‑1 (MQ=255) ccAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGa < 2:988277/140‑1 (MQ=255) acaacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGc > 2:138525/1‑140 (MQ=255) acaacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGc > 1:670034/1‑140 (MQ=255) acaacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGc > 1:315618/1‑140 (MQ=255) acaacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGc > 2:7892/1‑140 (MQ=255) acaacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGc > 2:349333/1‑140 (MQ=255) caacaTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCg > 2:829613/1‑140 (MQ=255) caTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGCTGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGAtt < 2:796220/140‑1 (MQ=255) aTCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGAATTGACGGATCCCGATGCGAttt > 2:853987/1‑140 (MQ=255) cAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGAttttt < 2:943269/140‑1 (MQ=255) agaaaagaaaCGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGAtttttt < 2:900557/140‑1 (MQ=255) cGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGc < 2:901429/140‑1 (MQ=255) gCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGcc < 2:343405/140‑1 (MQ=255) ccATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCt > 1:649974/1‑140 (MQ=255) ggAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGc < 1:829613/140‑1 (MQ=255) gAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCt > 2:1105426/1‑140 (MQ=255) gAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCt < 2:346428/140‑1 (MQ=255) gAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCt < 1:764880/140‑1 (MQ=255) ttATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAGGTGGGGTGGGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGGGTTTTTTTTGTTAATGGCCTGTTCTATCGCTCGGcc > 2:681656/1‑140 (MQ=255) ttATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGcc > 2:623315/1‑140 (MQ=255) ttATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGcc > 2:232565/1‑140 (MQ=255) tATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt < 2:670034/140‑1 (MQ=255) tATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt < 2:315618/140‑1 (MQ=255) tATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt > 2:704235/1‑140 (MQ=255) tATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt < 1:331341/140‑1 (MQ=255) tATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt > 2:966541/1‑140 (MQ=255) aTCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGAT‑CCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTaa < 2:795028/140‑1 (MQ=255) aCTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCtt < 1:704235/140‑1 (MQ=255) aCTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCtt < 1:622616/140‑1 (MQ=255) aCTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCtt > 1:985384/1‑140 (MQ=255) aCTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCtt < 1:877782/140‑1 (MQ=255) ttATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTa < 1:232565/140‑1 (MQ=255) ttATAGAGCCTTTCTTAATCCAATCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTa < 1:681656/140‑1 (MQ=255) ataGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAcc > 1:571580/1‑140 (MQ=255) gagCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACt < 1:396270/140‑1 (MQ=255) ccTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAg > 2:1082992/1‑140 (MQ=255) ccTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAg < 1:38368/140‑1 (MQ=255) tttCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCa < 2:571580/140‑1 (MQ=255) tttCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCa < 2:61085/140‑1 (MQ=255) tttCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCa < 1:750247/140‑1 (MQ=255) tttCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCa > 1:182517/1‑140 (MQ=255) ttCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGGCTTTACCACTAAGCAt > 2:1044403/1‑140 (MQ=255) tCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCAtt > 1:978714/1‑140 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt < 1:349333/140‑1 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt < 2:887626/140‑1 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt < 1:1105513/140‑1 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAat > 1:997607/1‑137 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAat < 2:997607/137‑1 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATAtt > 1:372146/1‑140 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATAtt > 2:236677/1‑140 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATAtt > 2:639485/1‑140 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt > 2:873194/1‑132 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt < 1:873194/132‑1 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATtc > 2:303995/1‑140 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATtc > 1:448946/1‑140 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATtc > 1:878575/1‑140 (MQ=255) tCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATtc > 2:135216/1‑140 (MQ=255) cATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGCCTTTACCACTAAg < 1:1126021/124‑1 (MQ=255) cATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGCCTTTACCACTAAg > 2:1126021/1‑124 (MQ=255) aTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTac < 2:649974/140‑2 (MQ=255) aTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTAt < 1:623315/140‑1 (MQ=255) aTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTAt < 2:576472/140‑1 (MQ=255) tggtggTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca < 1:435445/140‑1 (MQ=255) tggtggTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca < 2:389070/140‑1 (MQ=255) tggtggTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca < 2:448946/140‑1 (MQ=255) tggtggTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca < 1:957909/140‑1 (MQ=255) ggtTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcattac > 2:308412/1‑140 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 1:1082992/140‑1 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 1:966541/140‑1 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 1:649671/140‑1 (MQ=255) tttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCa < 2:626253/140‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCaa > 2:695947/1‑140 (MQ=255) gTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCt < 1:921888/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAc < 2:985384/140‑1 (MQ=255) cGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAccc > 1:271497/1‑140 (MQ=255) cGTGCGACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGACCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAccc > 1:126483/1‑140 (MQ=255) gACCTCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACt < 1:370094/140‑1 (MQ=255) tCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAt < 1:836547/140‑1 (MQ=255) tCCGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAt < 1:138525/140‑1 (MQ=255) ccGCCTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAtt < 2:271497/140‑1 (MQ=255) cTTTGACTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGc < 1:1105426/140‑1 (MQ=255) ttgacttgacGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGcac < 1:236677/140‑1 (MQ=255) ttgacttgacGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGcac < 1:695947/140‑1 (MQ=255) ttgacttgacGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGcac < 1:113126/140‑1 (MQ=255) tgacttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGcaca < 1:167657/140‑1 (MQ=255) tgacttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGcaca < 2:554969/140‑1 (MQ=255) | CAATGCTCTGGACCAACAACATCAGAAAAGAAACGCCATAATTCTGGAAGTTTATCTTTACTTATAGAGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCATTAGGCACA > NC_000913/1420030‑1420303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |