| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,805,081 | T→C | G89G (GGT→GGC) | proV → | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,805,081 | 0 | T | C | 98.5% | 225.0 / ‑5.1 | 65 | G89G (GGT→GGC) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (32/32); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
GCCAGTCTGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGTGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGTTCGGTATGGAATTGGCCGG > NC_000913/2804953‑2805218 | gCCAGTCTGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGc > 1:507377/1‑140 (MQ=255) tCTGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCaaaa > 2:442230/1‑140 (MQ=255) cTGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAat > 2:725772/1‑140 (MQ=255) tGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGa < 2:398632/127‑1 (MQ=255) tGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGa > 1:398632/1‑127 (MQ=255) cATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCg < 1:442230/140‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGGCGAGATACTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGCGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGAc < 2:1037096/140‑1 (MQ=255) gaagGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGa < 2:811972/140‑1 (MQ=255) gaTATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTg > 1:12346/1‑140 (MQ=255) tGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATTCGACGCCGAACTCCGTGAGGTgc > 1:294925/1‑140 (MQ=255) atcatGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAg > 1:856863/1‑140 (MQ=255) catGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGaa > 1:903305/1‑140 (MQ=255) catGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGaa > 1:650701/1‑140 (MQ=255) atGGGATTATCCGGCCCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGaaa > 1:1006237/1‑140 (MQ=255) tGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGaaaa > 2:794060/1‑140 (MQ=255) tCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGc > 1:637971/1‑140 (MQ=255) tCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGc > 2:207126/1‑140 (MQ=255) tCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGc > 2:528275/1‑140 (MQ=255) tCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGc < 2:650701/140‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCg > 2:606407/1‑140 (MQ=255) cGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGa < 1:84696/140‑1 (MQ=255) gCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATg < 2:474631/140‑1 (MQ=255) cTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATgg < 1:207126/140‑1 (MQ=255) cTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATgg < 2:527543/140‑1 (MQ=255) tAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTcc < 2:158252/140‑1 (MQ=255) aaaTCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCa < 2:203879/140‑1 (MQ=255) acaATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCtt < 2:856882/140‑1 (MQ=255) acaATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCtt < 2:85783/140‑1 (MQ=255) acaATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCtt < 1:246772/140‑1 (MQ=255) aaTGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTg > 1:599113/1‑140 (MQ=255) aaTGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTg > 1:193693/1‑140 (MQ=255) tACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTa > 1:265274/1‑140 (MQ=255) tACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTa > 1:102870/1‑140 (MQ=255) aCGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTaa < 1:888958/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATg < 2:265274/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATg > 2:965724/1‑140 (MQ=255) gCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATg < 1:880759/140‑1 (MQ=255) cTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGcc > 2:327526/1‑140 (MQ=255) tctcAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGc > 2:20323/1‑140 (MQ=255) tctcAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGc > 1:645726/1‑140 (MQ=255) cAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATg > 1:312614/1‑133 (MQ=255) cAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATg < 2:312614/133‑1 (MQ=255) tCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGa > 2:101824/1‑140 (MQ=255) ccTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCg < 1:526736/140‑1 (MQ=255) cTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGt > 1:369565/1‑140 (MQ=255) tGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTg < 2:507377/140‑1 (MQ=255) tGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTg < 2:586857/140‑1 (MQ=255) tGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTg < 1:725772/140‑1 (MQ=255) tGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTg < 2:193693/140‑1 (MQ=255) gATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGc > 1:1118162/1‑140 (MQ=255) gAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGa < 2:369565/140‑1 (MQ=255) gAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGa < 2:12346/140‑1 (MQ=255) acccacccGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACa > 2:326036/1‑140 (MQ=255) acccGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATAc > 2:301929/1‑140 (MQ=255) cccGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACt > 1:499218/1‑140 (MQ=255) cccGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACt > 2:311962/1‑140 (MQ=255) ccGCGGGCAAGCGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGGGAGGAGCGGAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGGGCTGGTCAATAcgg > 2:776244/1‑138 (MQ=255) gcgGGCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCg < 1:327526/140‑1 (MQ=255) gggCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt < 1:528275/140‑1 (MQ=255) gggCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt < 2:1118162/140‑1 (MQ=255) gggCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt < 2:1006237/140‑1 (MQ=255) gggCAAGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt < 2:856863/140‑1 (MQ=255) aGTGCTGATTGATGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGTTCGGTa < 2:1164830/140‑1 (MQ=255) attgatGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt < 1:403430/128‑1 (MQ=255) attgatGGCGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGtt > 2:403430/1‑128 (MQ=255) ggTGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGTTCGGTATGGAATTGGCCgg > 2:923972/1‑140 (MQ=255) | GCCAGTCTGGCCATTGAAGAAGGCGAGATATTTGTCATCATGGGATTATCCGGCTCGGGTAAATCCACAATGGTACGCCTTCTCAATCGCCTGATTGAACCCACCCGCGGGCAAGTGCTGATTGATGGTGTGGATATTGCCAAAATATCCGACGCCGAACTCCGTGAGGTGCGCAGAAAAAAGATTGCGATGGTCTTCCAGTCCTTTGCCTTAATGCCGCATATGACCGTGCTGGACAATACTGCGTTCGGTATGGAATTGGCCGG > NC_000913/2804953‑2805218 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |