| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 565,116 | A→G | V288A (GTC→GCC) | intD ← | DLP12 prophage; putative integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 565,116 | 0 | A | G | 99.2% | 430.4 / ‑7.3 | 123 | V288A (GTC→GCC) | intD | DLP12 prophage; putative integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (54/68); total (54/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CACTGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGACCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAGCGCCACACCAATGG > NC_000913/564980‑565242 | cACTGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCg > 1:911964/1‑140 (MQ=255)cACTGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCg > 2:1500254/1‑140 (MQ=255)cACTGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCg > 1:1258254/1‑140 (MQ=255) tGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCa > 1:882719/1‑139 (MQ=255) tGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAg < 2:905734/140‑1 (MQ=255) tGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAg > 2:1312277/1‑140 (MQ=255) gATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAgg < 1:1312277/140‑1 (MQ=255) tAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCg < 1:1350211/140‑1 (MQ=255) aTGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGtt < 2:390310/140‑1 (MQ=255) tGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTg < 1:63811/140‑1 (MQ=255) tGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTg < 2:563461/140‑1 (MQ=255) gacaccTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATg > 1:194101/5‑140 (MQ=255) gACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATg > 2:620365/1‑140 (MQ=255) aCGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGt > 2:395042/1‑140 (MQ=255) aCGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGt > 2:619460/1‑140 (MQ=255) aCGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGt > 1:1462222/1‑140 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGt > 1:1154515/1‑132 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGt < 2:1154515/132‑1 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTg < 1:1154021/134‑1 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTg > 2:1154021/1‑134 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTc > 2:1150837/1‑140 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTc > 1:649406/1‑140 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTc > 1:595358/1‑140 (MQ=255) gCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTc > 2:1258899/1‑140 (MQ=255) ccTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGtt < 2:537857/132‑1 (MQ=255) ccTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTcc < 1:933136/140‑1 (MQ=255) ccTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTcc < 2:644128/140‑1 (MQ=255) actgaATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCt > 2:117218/1‑140 (MQ=255) ccagcTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAg < 2:788943/140‑1 (MQ=255) ccagcTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAg < 2:1387440/140‑1 (MQ=255) ccagcTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAg > 1:610365/1‑140 (MQ=255) ccagcTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAg < 1:1057150/140‑1 (MQ=255) cagcTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgc < 2:649406/140‑1 (MQ=255) cTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgc > 2:1419211/1‑140 (MQ=255) cTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgc > 1:361593/1‑140 (MQ=255) ttGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgcc < 2:887113/140‑1 (MQ=255) ttGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgcc < 1:734584/140‑1 (MQ=255) ttGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgcc < 1:117218/140‑1 (MQ=255) aggCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGACCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAgccgcc < 2:1300552/138‑1 (MQ=255) tGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCt < 1:1419211/140‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAg > 2:910766/1‑132 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg < 1:891331/140‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg < 2:649903/140‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg > 2:1464833/1‑140 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg < 2:894041/140‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg < 1:648821/140‑1 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg > 1:745519/1‑140 (MQ=255) cccAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTg < 2:866672/140‑1 (MQ=255) cAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGt < 2:1258254/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTa < 1:633968/140‑1 (MQ=255) aGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTa < 1:395042/140‑1 (MQ=255) gtgtgtCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATg > 1:810821/1‑140 (MQ=255) tgtgtCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGt < 2:1271445/140‑1 (MQ=255) tgtCTGAGGTCATGGAAACGAAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTAc > 2:217820/1‑140 (MQ=255) gtCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGGTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACa > 1:1053411/1‑140 (MQ=255) gtCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACa < 1:620365/140‑1 (MQ=255) gtCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACa < 1:1267128/140‑1 (MQ=255) tCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCt > 2:880447/1‑128 (MQ=255) tCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCt < 1:880447/128‑1 (MQ=255) tCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACaa > 2:450962/1‑140 (MQ=255) tCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACaa > 1:1267240/1‑140 (MQ=255) tCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTACTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACaa > 2:776595/1‑140 (MQ=255) gAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAaca < 2:610365/140‑1 (MQ=255) gAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAaca < 1:1303572/140‑1 (MQ=255) gAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAaca < 1:1500254/140‑1 (MQ=255) gAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAaca < 1:619460/140‑1 (MQ=255) ggTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACAcc > 1:843321/1‑140 (MQ=255) gTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACAccc > 2:183710/1‑140 (MQ=255) gTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACAccc > 2:767604/1‑140 (MQ=255) cATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCAt > 2:617349/1‑140 (MQ=255) tGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAaca < 1:436638/133‑1 (MQ=255) gAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGGTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTtgt < 2:1053411/140‑1 (MQ=255) aaCGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGa > 1:267341/1‑140 (MQ=255) aCGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGAt < 1:1155201/140‑1 (MQ=255) cGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATg < 1:450962/140‑1 (MQ=255) ggAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGc < 2:111943/140‑1 (MQ=255) ggAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGc < 2:553126/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCTGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCtt < 1:455780/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCtt > 2:708295/1‑140 (MQ=255) aaaTCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCtt < 2:378018/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCtt < 2:27436/140‑1 (MQ=255) aaTTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTAttt < 2:165286/140‑1 (MQ=255) ttCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGa < 2:355160/140‑1 (MQ=255) tCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGAt < 2:843321/140‑1 (MQ=255) tGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGAt < 2:42186/122‑1 (MQ=255) tGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGAt > 1:42186/1‑122 (MQ=255) gCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACg < 1:217820/140‑1 (MQ=255) gCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACg < 1:106941/140‑1 (MQ=255) cgacgaCAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCaa < 2:709743/140‑1 (MQ=255) cgacAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCaa > 1:1059150/1‑137 (MQ=255) gCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACa > 2:815157/1‑140 (MQ=255) tGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAgg < 1:767604/140‑1 (MQ=255) atgatgTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCACGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTATCCGCCTTGGTATGTACAAGCACCCATTTGTGATGCTTGCCTCTTTGATCACGCAACACTTTACAGGCgggaatc > 2:265344/1‑135 (MQ=255) tgTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCa > 2:1105478/1‑140 (MQ=255) tGTCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAGCGCcaca > 1:909395/1‑140 (MQ=255) tCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAGCGCCACAcc > 2:1482058/1‑140 (MQ=255) tCGATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGGATCGTTTAGGGCCACAcc > 2:534589/1‑140 (MQ=255) gATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAgc > 2:1048179/1‑130 (MQ=255) gATGCGCATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAgc < 1:1048179/130‑1 (MQ=255) gcgcATCTTCCTGGCCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAGCGCCACACCAATgg > 2:679953/1‑140 (MQ=255) | CACTGATAATGGGACGCCTGACTGAATCAGCCAGCTTGCCCAGGTGTGTCTGAGGTCATGGAAACGGAAATCTTCAATTCCTGCACGACGACAAGCTGATAGCCATGATGTCTTGCTGTCGATGCGCATCTTCCTGACCGCAGGCGTTGATGTTCCATCTGCTCGCTTAGCCGCCTTGGTATGTACAAACACCCATTTGTGATGCTTGCCTATTTGATCACGCAACACTTTACAGGCGGTATCGTTCAGCGCCACACCAATGG > NC_000913/564980‑565242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |