Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,220,971 | G→A | pseudogene (1371/2648 nt) | ycgH → | putative transporter component, N‑terminal fragment |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,220,971 | 0 | G | A | 100.0% | 372.5 / NA | 103 | pseudogene (1371/2648 nt) | ycgH | putative transporter component, N‑terminal fragment |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (63/40); total (63/40) |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCA > NC_000913/1220840‑1221106 | gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 1:984601/140‑1 (MQ=255) gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 2:1161897/140‑1 (MQ=255) gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 2:1412217/140‑1 (MQ=255) gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 2:197060/140‑1 (MQ=255) gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 1:1362822/140‑1 (MQ=255) gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 1:211614/140‑1 (MQ=255) tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 1:693254/1‑140 (MQ=255) tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 1:562873/1‑140 (MQ=255) tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 2:1124903/1‑140 (MQ=255) tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 2:232587/1‑140 (MQ=255) tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGGAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 2:1447868/1‑140 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:972228/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:198823/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:719484/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt > 1:21008/1‑140 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:46195/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt > 2:506035/1‑140 (MQ=255) aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGGAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 1:1447868/140‑1 (MQ=255) cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 2:1512499/1‑140 (MQ=255) cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 2:387920/1‑140 (MQ=255) cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:796459/1‑140 (MQ=255) cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:20923/1‑140 (MQ=255) cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:977294/1‑140 (MQ=255) cGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGACAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGt < 1:951682/140‑1 (MQ=255) tATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTaa < 1:1124903/140‑1 (MQ=255) atgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg < 1:515838/140‑1 (MQ=255) tgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCgg > 2:682900/1‑140 (MQ=255) gTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg < 2:105443/137‑1 (MQ=255) gTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg > 1:105443/1‑137 (MQ=255) gTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGt > 2:975249/1‑140 (MQ=255) tCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGtt < 1:682900/140‑1 (MQ=255) tCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGtt < 1:1512499/140‑1 (MQ=255) tCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGtt < 2:1056206/140‑1 (MQ=255) aaCATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCaa > 2:281122/1‑140 (MQ=255) tACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTAc > 1:1324462/1‑138 (MQ=255) tACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCg > 2:1024347/1‑140 (MQ=255) tACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGATAATACTTCGGGTTCAACTAc < 2:1324462/138‑1 (MQ=255) tACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGCCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCg > 1:455768/1‑140 (MQ=255) ggAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTGATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTAtgt > 2:1042036/1‑140 (MQ=255) ggAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTAtgt > 2:207588/1‑140 (MQ=255) aCCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGaa > 2:868957/1‑131 (MQ=255) aCCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGaa < 1:868957/131‑1 (MQ=255) tAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTggagga > 1:644590/1‑140 (MQ=255) aaaaGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGaa < 1:1024347/140‑1 (MQ=255) tAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcg > 2:351136/1‑140 (MQ=255) aTTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAGAATGCTGGAGGAAgcggcgcg > 1:769097/1‑140 (MQ=255) tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcggc < 1:482997/136‑1 (MQ=255) tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcggc > 2:482997/1‑136 (MQ=255) tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACg > 1:594651/1‑140 (MQ=255) tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACg < 2:644590/140‑1 (MQ=255) tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACg > 2:1144351/1‑140 (MQ=255) gTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATc > 2:685725/1‑140 (MQ=255) gTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATc < 2:339892/140‑1 (MQ=255) tCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCg < 2:1086348/140‑1 (MQ=255) cAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGa > 2:1401298/1‑140 (MQ=255) cAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGa > 2:1398710/1‑140 (MQ=255) cAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGa > 2:1282520/1‑140 (MQ=255) gCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAAc > 2:622229/1‑140 (MQ=255) cTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAGAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACt > 2:722580/1‑140 (MQ=255) cTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACt > 2:956858/1‑140 (MQ=255) cTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACt > 2:234139/1‑140 (MQ=255) cTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACt > 2:1481829/1‑140 (MQ=255) tAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCa < 1:249404/140‑1 (MQ=255) atatCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATa < 1:387920/140‑1 (MQ=255) tCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACt < 2:594651/140‑1 (MQ=255) gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATc < 1:619902/125‑1 (MQ=255) gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATc > 2:619902/1‑125 (MQ=255) gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 1:575691/1‑140 (MQ=255) gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 2:903727/1‑140 (MQ=255) gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 2:1387613/1‑140 (MQ=255) cACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGa > 2:1175698/1‑140 (MQ=255) cGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATg > 1:895314/1‑140 (MQ=255) tATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGc > 2:717849/1‑140 (MQ=255) tAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGAt > 2:38996/1‑140 (MQ=255) ggTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGa < 2:455768/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGa < 1:1401298/140‑1 (MQ=255) gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAGCTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 1:1063486/1‑140 (MQ=255) gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 1:775961/1‑140 (MQ=255) gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc < 2:575691/140‑1 (MQ=255) gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 1:496382/1‑140 (MQ=255) atgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtct > 2:796521/1‑140 (MQ=255) atgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtct > 2:27764/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGAt > 2:898260/1‑133 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGAt < 1:898260/133‑1 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGa > 1:566051/1‑135 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGa < 2:566051/135‑1 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 2:618899/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc < 1:1161304/140‑1 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:1210512/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:1433342/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:640386/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 2:783696/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:319370/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:761341/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:477496/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 2:1161304/1‑140 (MQ=255) tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc < 1:717849/140‑1 (MQ=255) tAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCcag < 1:975249/140‑1 (MQ=255) aaaTCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCcagc > 1:738308/1‑140 (MQ=255) aaTCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCcagca > 2:81706/1‑140 (MQ=255) | GACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCA > NC_000913/1220840‑1221106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |