| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 989,044 | (G)6→7 | intergenic (‑59/+110) | asnS ← / ← pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 989,038 | 1 | . | G | 96.2% | 182.6 / 0.0 | 52 | intergenic (‑53/+116) | asnS/pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (29/21); total (30/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
CGGGTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑GGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAAT > NC_000913/988900‑989171 | cggGTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑g < 2:344427/140‑1 (MQ=255) gggTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑gg < 1:434647/140‑1 (MQ=255) ggTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggg < 1:118694/140‑1 (MQ=255) ggTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggg < 1:823351/140‑1 (MQ=255) tacgtacCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggggg < 1:1299958/140‑1 (MQ=255) acgtacCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑gggggg < 1:501300/140‑1 (MQ=255) acgtacCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑gggggg < 2:155905/140‑1 (MQ=255) acgtacCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑gggggg < 1:1284328/140‑1 (MQ=255) gtacCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggggggga < 1:1367939/140‑3 (MQ=255) acCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑gggggggata < 2:56486/140‑5 (MQ=255) aTCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTa > 1:1163050/1‑140 (MQ=255) tCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTAt < 1:331772/140‑1 (MQ=255) tCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggggg > 1:497323/1‑130 (MQ=255) tCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑ggggg < 2:497323/130‑1 (MQ=255) ccGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATg > 1:950493/1‑140 (MQ=255) ccGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATg < 1:65460/140‑1 (MQ=255) tGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCa < 1:1308876/140‑1 (MQ=255) gACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCAt < 2:373535/140‑1 (MQ=255) tCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAg > 2:235241/1‑140 (MQ=255) acacGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGa > 1:210709/1‑140 (MQ=255) cccTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGaa < 1:825578/135‑1 (MQ=255) cccTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGaa > 2:825578/1‑135 (MQ=255) 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(MQ=255) cGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑GGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCg > 1:353465/1‑139 (MQ=255) cGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑GGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCg < 2:353465/139‑1 (MQ=255) gCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGTAGCGAAAGa > 1:570056/1‑140 (MQ=255) cAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTc < 2:576191/140‑1 (MQ=255) cAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTc < 2:950493/140‑1 (MQ=255) aGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCg > 1:242574/1‑140 (MQ=255) cTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAgg > 1:864083/1‑140 (MQ=255) atTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTaaaaaaa > 1:479014/1‑140 (MQ=255) tctctcTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAgg < 1:429258/140‑1 (MQ=255) ctctctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAggg > 1:175362/1‑140 (MQ=255) ctctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAg < 2:106812/140‑1 (MQ=255) tctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAg > 1:639918/1‑139 (MQ=255) tctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAg < 2:639918/139‑1 (MQ=255) gTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCAt < 2:216937/61‑1 (MQ=255) gTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCAt > 1:216937/1‑61 (MQ=255) tCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc < 2:829153/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc < 2:210709/140‑1 (MQ=255) tCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc < 2:242574/140‑1 (MQ=255) cGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAg 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2:1234428/1‑140 (MQ=255) gAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCtg > 1:1056271/1‑140 (MQ=255) gAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCtg < 2:1056271/140‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCtga < 1:1251823/140‑1 (MQ=255) cacTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGGATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAAc > 2:1154103/1‑140 (MQ=255) ttGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAGGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTgg > 1:126416/1‑140 (MQ=255) ttGTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTgg < 1:1260659/140‑1 (MQ=255) gTCCACCCGTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCt > 2:403717/1‑140 (MQ=255) gTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTa < 1:129827/138‑1 (MQ=255) gTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTa > 2:129827/1‑138 (MQ=255) gTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAat < 2:494732/140‑1 (MQ=255) gTAAATGGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAat > 2:1156416/1‑140 (MQ=255) | CGGGTACGTACCCATCCGCGCACGGTGACTTCGCTGTCAACGGCTACACGGCCCTGGAGTACGTCGGCTACAGGCACAACGCTCATAATATTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAAT‑GGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAAT > NC_000913/988900‑989171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |