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| MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
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2:421873‑M2/18‑140 (MQ=255) ccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTaaa > 2:1393055‑M2/18‑140 (MQ=255) gacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc > 1:1345473‑M2/15‑140 (MQ=255) gacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc < 2:142989‑M2/126‑1 (MQ=255) cataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAt < 1:547133‑M2/128‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATg < 1:239219‑M2/129‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATg < 1:1101618‑M2/129‑1 (MQ=255) taaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGc < 2:1210133‑M2/130‑1 (MQ=255) taaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGc < 1:123574‑M2/130‑1 (MQ=255) ccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCAt < 1:421873‑M2/133‑1 (MQ=255) ccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCAt > 1:563606‑M2/8‑140 (MQ=255) atgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAggg < 1:118927‑M2/119‑1 (MQ=255) tgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTaca > 2:563608‑M2/3‑140 (MQ=255) | CCGCCGCTACGCAAGTGGATGGTACGCAAATGTCTTTGCTGTCAGTACCAGAAGAAACTTCGCCTGCGGTCGAAGCTCTGGAAAATCTTGATCCGGATTCACTCACCCCGCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACA > NC_000913/2859500‑2859771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |