| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,545,134 | A→G | T13T (ACA→ACG) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,545,134 | 0 | A | G | 98.9% | 315.4 / ‑4.5 | 88 | T13T (ACA→ACG) | fimD | type I fimbriae usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (43/44); total (43/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 | |||||||||||
TTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATC > NC_000913/4544998‑4545267 | ttACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCaa < 1:680743/140‑1 (MQ=255) cccccAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGc < 1:776153/140‑1 (MQ=255) cccccAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGc < 1:891227/140‑1 (MQ=255) aaaaTGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAGGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCa < 2:701052/140‑1 (MQ=255) aaaaTGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGGGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCa > 2:338503/1‑140 (MQ=255) aaaTGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCa > 1:187476/1‑139 (MQ=255) aaaTGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCa < 2:187476/139‑1 (MQ=255) aaTGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTGCCAGCGAATCACGCAATGCTTGCata < 2:278096/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCg > 1:1111648/1‑140 (MQ=255) gCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAg > 1:1065777/1‑140 (MQ=255) cGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGc > 1:1273248/1‑140 (MQ=255) gTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCa > 1:1004335/1‑140 (MQ=255) tAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCAt > 2:635845/1‑140 (MQ=255) aTAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTgg < 1:1263080/140‑1 (MQ=255) tAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGc < 2:1299855/140‑1 (MQ=255) tAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGc < 2:1065777/140‑1 (MQ=255) tAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGc < 1:50009/140‑1 (MQ=255) aCGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTg < 1:736192/140‑1 (MQ=255) cGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTgg > 1:87248/1‑140 (MQ=255) cGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTgg > 2:1208627/1‑140 (MQ=255) cAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTAGtt > 2:267141/1‑140 (MQ=255) ggggAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGttttt > 2:735847/1‑140 (MQ=255) ggggAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGttttt > 1:49933/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCGCCTGAATTAAAAGAATTTGCTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAAATTCATTTTCTAATTTTAGGCTTTTCCCACCAAACCCCCAATGCCTGGATTTTTGGAAGCATCGGTTGGCTGGTTTTTTTGTc < 2:348956/140‑1 (MQ=255) cGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTc < 2:1004335/140‑1 (MQ=255) gAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGt < 2:1351328/140‑1 (MQ=255) aaTAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTc > 2:867680/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 2:827470/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 1:763593/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 2:358820/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 2:395526/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 1:334334/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 1:605894/1‑140 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 2:296016/1‑140 (MQ=255) ttGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCttt > 2:770769/1‑140 (MQ=255) tGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtttt < 1:827470/140‑1 (MQ=255) gACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTg < 2:1337984/140‑1 (MQ=255) aCTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGc > 2:567974/1‑140 (MQ=255) tGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCg > 1:191506/1‑140 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac > 2:287967/1‑140 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac < 1:635845/140‑1 (MQ=255) gggTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcaca < 1:735847/140‑1 (MQ=255) gggTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcaca < 2:1373347/140‑1 (MQ=255) ggTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAg < 1:296016/140‑1 (MQ=255) gTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAgg < 2:763593/140‑1 (MQ=255) gATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCa < 1:567974/140‑1 (MQ=255) gATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCa < 1:337438/140‑1 (MQ=255) cGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCAt < 2:24703/140‑1 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac < 2:1382072/123‑1 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac > 1:1382072/1‑123 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGca > 1:313076/1‑122 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGca < 2:313076/122‑1 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCt < 1:307284/131‑1 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCt > 2:307284/1‑131 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCt > 1:1360933/1‑140 (MQ=255) gaggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCt > 1:560953/1‑140 (MQ=255) aggaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTg > 2:1277356/1‑140 (MQ=255) gaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGcc < 1:770769/140‑1 (MQ=255) gaATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGcc < 1:395526/140‑1 (MQ=255) aataatGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCg < 2:891440/140‑1 (MQ=255) taatGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGAc < 2:334334/140‑1 (MQ=255) taatGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGAc < 2:1111648/140‑1 (MQ=255) atGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACct < 1:924833/140‑1 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tatCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCg > 1:1376175/1‑130 (MQ=255) tatCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCg < 2:1376175/130‑1 (MQ=255) tGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAAt < 2:412278/140‑1 (MQ=255) tGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAAt > 2:591124/1‑140 (MQ=255) aaTTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAAt < 2:79532/138‑1 (MQ=255) aaTTTAAGACTTTACCAGCGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAAt > 1:79532/1‑138 (MQ=255) 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(MQ=255) cGAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgatga > 2:1015842/1‑140 (MQ=255) gAAACACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCCCCTTTGTCATCTGCCGAGCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgatgat < 2:1142253/140‑1 (MQ=255) aaaCACGCAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATc > 2:121340/1‑140 (MQ=255) | TTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATC > NC_000913/4544998‑4545267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |