| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,251,127 | A→G | E21G (GAG→GGG) | dhaR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator DhaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,251,127 | 0 | A | G | 99.0% | 371.6 / ‑4.4 | 102 | E21G (GAG→GGG) | dhaR | DNA‑binding transcriptional dual regulator DhaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (49/52); total (49/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCATATTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGAGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGA > NC_000913/1250990‑1251262 | ccATATTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGc > 2:491964/1‑140 (MQ=255) cATATTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCg > 2:450594/1‑140 (MQ=255) tatTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGa < 1:316718/139‑1 (MQ=255) tatTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGa > 2:316718/1‑139 (MQ=255) aaaCTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCg < 2:1362232/133‑1 (MQ=255) aaaCTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCg > 1:1362232/1‑133 (MQ=255) aaaCTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGAGCGATGCAAt < 1:965535/140‑1 (MQ=255) tACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCtga < 1:769077/140‑1 (MQ=255) aTTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACg > 1:652623/1‑140 (MQ=255) aTTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGAGAGGCAAAAACCTGAGGAAACg > 2:571789/1‑140 (MQ=255) ttAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACgg < 1:784640/140‑1 (MQ=255) tAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACggg < 1:1195119/140‑1 (MQ=255) cTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACa > 2:525230/1‑140 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg < 2:279576/140‑1 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg < 2:638810/140‑1 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg < 2:1273125/140‑1 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg < 2:1048563/140‑1 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg > 1:687850/1‑140 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATg > 1:1002114/1‑140 (MQ=255) tAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTACCTTAATTGCAACCTCCTGTGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGAAATg > 2:971854/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATgg > 1:1327277/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATgg > 2:1108161/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGATGATGAAACGGGAGACATgg > 2:1228539/1‑140 (MQ=255) aaaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGa < 2:1220727/140‑1 (MQ=255) aaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATggca < 1:1000680/140‑3 (MQ=255) aaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGaa < 2:371267/140‑1 (MQ=255) aaTTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGaa < 1:464133/140‑1 (MQ=255) cGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTAc > 1:883532/1‑140 (MQ=255) gAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACggg > 1:981262/1‑124 (MQ=255) gAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACggg < 2:981262/124‑1 (MQ=255) gAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTAcc > 1:168569/1‑140 (MQ=255) gAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTAcc > 1:72744/1‑140 (MQ=255) aGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGa > 2:274026/1‑132 (MQ=255) aGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGa < 1:274026/132‑1 (MQ=255) cGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACAt < 1:525230/140‑1 (MQ=255) cTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGaa > 2:664738/1‑122 (MQ=255) cTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGaa < 1:664738/122‑1 (MQ=255) cTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCa < 1:1039456/140‑1 (MQ=255) tGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGc < 1:99676/140‑1 (MQ=255) gTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCg < 1:680481/140‑1 (MQ=255) aGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACAt > 2:1254471/1‑140 (MQ=255) gggATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACAtt > 2:1118580/1‑140 (MQ=255) tGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCt > 1:668771/1‑140 (MQ=255) tGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCt > 2:39924/1‑140 (MQ=255) tGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCt > 2:936463/1‑140 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tctcCCTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGc > 2:224665/1‑140 (MQ=255) ccTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATAAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAATAAAGCGATGCTGACGGTCGGGCAGGCTacg > 2:858371/1‑140 (MQ=255) cTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTgcgc < 2:1077864/140‑1 (MQ=255) cTTAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTgcgc < 1:491964/140‑1 (MQ=255) ttAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCt < 1:1291621/135‑1 (MQ=255) ttAATTGCAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCt > 2:1291621/1‑135 (MQ=255) 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(MQ=255) cAACCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGAt > 1:22513/1‑140 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTACGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATg > 1:382144/1‑140 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGa < 1:527357/138‑1 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGa > 2:527357/1‑138 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATg > 2:1363069/1‑140 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATg > 2:1134706/1‑140 (MQ=255) aaCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATg > 2:810/1‑140 (MQ=255) aCCTCCTGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGc < 1:1102549/140‑1 (MQ=255) cctcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGcc > 2:40707/1‑140 (MQ=255) cctcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGcc < 2:694600/140‑1 (MQ=255) cctcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGcc < 2:652623/140‑1 (MQ=255) cctcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGcc < 1:1134706/140‑1 (MQ=255) cctcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATAAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGcc < 1:858371/140‑1 (MQ=255) tcctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTg > 2:1277824/1‑140 (MQ=255) cctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTgg < 2:717349/140‑1 (MQ=255) cctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTgg < 2:74844/140‑1 (MQ=255) cctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTgg < 1:530755/140‑1 (MQ=255) cctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTgg < 2:424487/140‑1 (MQ=255) ctGGGGGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTggg > 1:938079/1‑140 (MQ=255) tGGGAGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGACGTAAGAAAGCGATGCTGACGCCCGGGCAGGCTGCGGTGGAAGATGCCTGGGa < 2:681575/140‑1 (MQ=255) | CCATATTGAAACTTTTACGTGTATTAATACTTAAAATTGCGAGCCGGAACACCTTTTGTCATAAGGGATGCGGGATATGAGTGGCGCTTTTAACAACGATGGTCGGGGCATATCTCCCTTAATTGCAACCTCCTGGGAGCGATGCAATAAGCTGATGAAACGGGAGACATGGAACGTACCACATCAGGCCCAGGGCGTGACATTTGCTTCTATTTATCGGCGTAAGAAAGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGA > NC_000913/1250990‑1251262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |