Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,476,531 | T→C | intergenic (‑91/+76) | yheO ← / ← fkpA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YheO/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase FkpA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,476,531 | 0 | T | C | 100.0% | 100.5 / NA | 28 | intergenic (‑91/+76) | yheO/fkpA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YheO/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase FkpA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (14/14); total (14/14) |
GTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGC > NC_000913/3476395‑3476667 | gTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTcc > 1:1132763/1‑140 (MQ=255) tAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCg < 2:201591/140‑1 (MQ=255) tCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCttt > 2:756683/1‑140 (MQ=255) cAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTcc < 2:851673/140‑1 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCg < 1:444285/130‑1 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCg > 2:444285/1‑130 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCa > 2:719182/1‑140 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCa < 1:806699/140‑1 (MQ=255) aCTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACt > 2:513369/1‑140 (MQ=255) ggTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAAt < 2:356937/140‑1 (MQ=255) ggTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAAt < 2:338581/140‑1 (MQ=255) gTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGc < 1:149064/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAccgccg < 1:30058/140‑1 (MQ=255) cTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAccgccg < 2:902884/129‑1 (MQ=255) cTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAccgccg > 1:902884/1‑129 (MQ=255) ccTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAggcgg < 1:513369/140‑1 (MQ=255) gAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTa < 2:1132763/140‑1 (MQ=255) gAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTa < 1:1120698/140‑1 (MQ=255) cGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCt > 2:1084485/1‑140 (MQ=255) cGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCt > 1:176599/1‑140 (MQ=255) cGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCt > 2:896829/1‑140 (MQ=255) aTACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCa > 1:272259/1‑140 (MQ=255) tACAGCGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAg > 1:31586/1‑140 (MQ=255) gCGGAGGCTCCGCTGTCAAGCACTAATAATATCCGGCCTGGAATAAAAAAACCGCCGCAAGGTCAGGAGGCGGTGCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCGTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCta > 2:418797/1‑139 (MQ=255) cGGAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTc > 2:775216/1‑140 (MQ=255) ggAGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCg > 1:149941/1‑140 (MQ=255) aGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGgc < 1:896829/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGgc < 1:756683/140‑1 (MQ=255) | GTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGCCTTCGGC > NC_000913/3476395‑3476667 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |