Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,226,250 | C→T | T808M (ACG→ATG) | metH → | cobalamin‑dependent methionine synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,226,250 | 0 | C | T | 98.6% | 250.1 / ‑5.9 | 71 | T808M (ACG→ATG) | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (37/33); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCGGCCC > NC_000913/4226114‑4226385 | aaaaaTATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGcc < 2:1047999/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTgg > 1:372323/1‑140 (MQ=255) gTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGa > 2:1113084/1‑140 (MQ=255) tggtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACg < 2:372323/140‑1 (MQ=255) ggtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACga < 1:247301/140‑1 (MQ=255) gtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGc > 1:326136/1‑126 (MQ=255) gtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACgag < 2:365868/140‑1 (MQ=255) gtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACgag > 2:1012462/1‑140 (MQ=255) gtgtggtgCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACgag > 1:294272/1‑140 (MQ=255) ctgcAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTaa > 1:778469/1‑140 (MQ=255) cAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACg > 2:373775/1‑139 (MQ=255) cAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACg < 1:373775/139‑1 (MQ=255) cAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGt > 2:481168/1‑140 (MQ=255) aaTGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTg < 1:481168/140‑1 (MQ=255) gTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCg > 2:161561/1‑140 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAAc > 1:220796/1‑133 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAAc < 2:220796/133‑1 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGc < 2:608119/138‑1 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGc > 1:608119/1‑138 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGa > 2:575222/1‑140 (MQ=255) tAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGa < 2:659569/140‑1 (MQ=255) aacaacTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGaa < 2:631351/140‑1 (MQ=255) acaacTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGaaa < 1:724402/140‑1 (MQ=255) acTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGTCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAagag > 1:51232/1‑140 (MQ=255) acTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAagag > 2:939479/1‑140 (MQ=255) aCGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATg < 1:1113084/140‑1 (MQ=255) aCGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATg > 2:427542/1‑140 (MQ=255) aCGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATg > 2:734967/1‑140 (MQ=255) aCGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATg > 2:511142/1‑140 (MQ=255) ttGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGt < 1:1012462/140‑1 (MQ=255) gTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCa > 1:951942/1‑140 (MQ=255) gATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAggg < 1:427542/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCa < 1:575222/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCa > 1:297995/1‑140 (MQ=255) ggCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCAc < 1:939479/140‑1 (MQ=255) cGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTCTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAggg > 2:377235/1‑132 (MQ=255) cGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTCTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAggg < 1:377235/132‑1 (MQ=255) ttATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTAtt < 1:586239/140‑1 (MQ=255) ttATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTAtt < 2:135583/140‑1 (MQ=255) tATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTc < 1:604471/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTAtt < 1:501518/134‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTAtt > 2:501518/1‑134 (MQ=255) tGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTGAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGa > 1:1102972/1‑140 (MQ=255) tGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGa > 2:403545/1‑140 (MQ=255) tGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGa > 1:141342/1‑140 (MQ=255) gCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTTACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGAt > 1:6020/1‑140 (MQ=255) aaaaaaTTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTggc < 1:161561/140‑1 (MQ=255) ctcCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGcgac < 2:1120928/140‑1 (MQ=255) ccGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTTACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCa < 2:6020/140‑1 (MQ=255) cTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTGAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCaaaa < 2:1102972/140‑1 (MQ=255) agTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGcaca < 2:778469/140‑1 (MQ=255) gTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCacac > 2:728082/1‑140 (MQ=255) gTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCacac > 2:1045142/1‑140 (MQ=255) gAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACAcgg > 1:643186/1‑140 (MQ=255) atctgatTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGaaa > 2:1071700/1‑140 (MQ=255) tgatTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATc > 1:808547/1‑140 (MQ=255) tgatTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATc > 1:164473/1‑140 (MQ=255) gatTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCg < 2:761735/140‑1 (MQ=255) atTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGa > 2:929751/1‑140 (MQ=255) atTGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGa > 2:89722/1‑140 (MQ=255) ttGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAg < 1:1045142/140‑1 (MQ=255) ttGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAg < 2:141342/140‑1 (MQ=255) ttGGCCTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAg < 2:919806/140‑1 (MQ=255) ccTTTCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGa > 1:220891/1‑140 (MQ=255) tttCGGGGCTTATCATGCCGTCGCTAGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAAc < 2:246908/140‑1 (MQ=255) cGGGGCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTAc > 2:167946/1‑140 (MQ=255) gCTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCg < 1:734967/140‑1 (MQ=255) cTTATCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCgg > 2:378989/1‑140 (MQ=255) aTCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCGGccc > 1:513770/1‑140 (MQ=255) aTCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCGGccc > 1:1089077/1‑140 (MQ=255) aTCATGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCGGccc < 2:297995/140‑1 (MQ=255) | AAAAATATCGTTGGTGTGGTGCTGCAATGTAACAACTACGAAATTGTCGATCTCGGCGTTATGGTGCCTGCGGAAAAAATTCTCCGTACCGCTAAAGAAGTGAATGCTGATCTGATTGGCCTTTCGGGGCTTATCACGCCGTCGCTGGACGAGATGGTTAACGTGGCGAAAGAGATGGAGCGTCAGGGCTTCACTATTCCGTTACTGATTGGCGGCGCGACGACCTCAAAAGCGCACACGGCGGTGAAAATCGAGCAGAACTACAGCGGCCC > NC_000913/4226114‑4226385 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |