| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,344 | A→G | V330A (GTG→GCG) | ecpC ← | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,344 | 0 | A | G | 97.5% | 270.2 / ‑2.7 | 79 | V330A (GTG→GCG) | ecpC | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (39/38); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
CGATCCATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCACATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATCACTGGCG > NC_000913/308209‑308479 | cGATCCATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTCCCGCATc > 2:235122/1‑140 (MQ=255) aTCCATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTCCCGCATCGt < 1:235122/140‑1 (MQ=255) ccATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTaa < 1:619193/140‑1 (MQ=255) ccATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTaa < 1:505618/140‑1 (MQ=255) cATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTaaa < 1:769412/140‑1 (MQ=255) tGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATccc < 2:469534/140‑1 (MQ=255) aaaGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGt < 1:800514/140‑1 (MQ=255) aGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCg < 2:940741/137‑1 (MQ=255) aGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCg > 1:940741/1‑137 (MQ=255) cTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACgg > 1:875376/1‑140 (MQ=255) aCCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTa < 1:981810/140‑1 (MQ=255) aCCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTa > 2:981810/1‑140 (MQ=255) aCCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTa > 2:227647/1‑140 (MQ=255) aCCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTa > 2:1042785/1‑140 (MQ=255) aCCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGAACgcaa > 2:287031/1‑137 (MQ=255) gCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAc < 1:227647/140‑1 (MQ=255) gCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAc < 1:605504/140‑1 (MQ=255) cccATCCCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAccc < 2:1081056/140‑1 (MQ=255) cccATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAccc < 2:322453/140‑1 (MQ=255) cccATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAccc < 1:93937/140‑1 (MQ=255) aTACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTACTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCgg < 2:630286/140‑1 (MQ=255) aTACCTGCCACGCCAGTGGTACACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCgg > 1:630286/1‑140 (MQ=255) tGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATc < 1:1042785/140‑1 (MQ=255) gCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATcc > 1:442028/1‑140 (MQ=255) gCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATcc > 2:117530/1‑140 (MQ=255) ccACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCa > 1:817492/1‑140 (MQ=255) ccACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCa > 2:970188/1‑140 (MQ=255) ccACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCa > 2:342153/1‑140 (MQ=255) cACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCAc > 1:626017/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACtt < 1:346671/140‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAc < 2:780175/124‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGAc > 1:780175/1‑124 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACtt > 1:403910/1‑139 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACtt < 2:403910/139‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTc > 1:648999/1‑140 (MQ=255) gCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCACATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTc > 2:435370/1‑140 (MQ=255) ccAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCa > 1:589493/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATg > 1:594826/1‑140 (MQ=255) gtggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGa < 2:431856/140‑1 (MQ=255) tggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGAt > 2:408770/1‑140 (MQ=255) tggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGAt < 2:875376/140‑1 (MQ=255) tggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGAt > 2:270523/1‑140 (MQ=255) tggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGCGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGAt > 2:716029/1‑140 (MQ=255) ggtgCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGAtt < 2:811404/140‑1 (MQ=255) gCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGcc > 1:207339/1‑140 (MQ=255) gCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGcc < 2:817492/140‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGt > 1:158691/1‑140 (MQ=255) cgccgcGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCACATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTg < 1:435370/140‑1 (MQ=255) cccccGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCt < 1:408770/140‑1 (MQ=255) cccccGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCt < 1:716029/140‑1 (MQ=255) ccGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGaa < 2:207339/140‑1 (MQ=255) cGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGaa < 1:577275/139‑1 (MQ=255) cGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGaa > 2:577275/1‑139 (MQ=255) aaCAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGaa < 1:595419/133‑1 (MQ=255) aaCAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGaa > 2:595419/1‑133 (MQ=255) cAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTtagta < 2:893132/140‑1 (MQ=255) gCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAgc < 1:117530/140‑1 (MQ=255) gCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAgc < 2:589493/140‑1 (MQ=255) cTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAgcc > 1:291168/1‑140 (MQ=255) cccGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCGCCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCa < 1:270523/140‑1 (MQ=255) cccGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCa > 1:749069/1‑140 (MQ=255) cccGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCa < 1:137011/140‑1 (MQ=255) cGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACg > 1:917426/1‑140 (MQ=255) gCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACgg < 2:760966/140‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACggg > 1:107636/1‑140 (MQ=255) cTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACggg > 1:249260/1‑140 (MQ=255) tGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGt < 2:648999/140‑1 (MQ=255) tGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGt < 2:303462/140‑1 (MQ=255) tGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGt < 1:342153/140‑1 (MQ=255) cTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTc > 1:161627/1‑140 (MQ=255) gATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTcgc > 2:744445/1‑140 (MQ=255) cgcgACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTcgcccgcc > 2:877300/1‑140 (MQ=255) aCCGTTAACGATCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCccgccgccg > 2:450790/1‑140 (MQ=255) tCACCTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCg > 2:19273/1‑140 (MQ=255) ccTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATc > 2:695664/1‑140 (MQ=255) ccTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATc < 2:442028/140‑1 (MQ=255) ccTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATc > 2:846957/1‑140 (MQ=255) ccTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATc > 2:981149/1‑140 (MQ=255) cTCAACTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATCa > 1:736478/1‑140 (MQ=255) aCTTCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATCACTgg > 1:178547/1‑140 (MQ=255) ttCCGCATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATCACTGGCg < 2:594826/140‑1 (MQ=255) | CGATCCATATGAAAGCTACCGCCCCATACCTGCCACGCCAGTGGTGCACCGACGCCGCGCCCCCGGCTAAACAGCTTATTGACCCGCTGGGTGCGTTTGCTGATCACGCGACCGTTAACGATCACCTCAACTTCCACATCGTAAATCCCGTACGGTAGACCCCGGGTATCCACTTCATGATTGCCCATAGTGAAGTTCTGAACGCTTAGTAGCCGCCCATCACGGGTGAGATGTACTTCGCCCGCCGCCGGTAAAAAGGCGATCACTGGCG > NC_000913/308209‑308479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |