| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,101,728 | (G)7→8 | coding (39/984 nt) | kdgT → | 2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate:H(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,101,721 | 1 | . | G | 95.9% | 250.5 / 3.1 | 73 | coding (32/984 nt) | kdgT | 2‑dehydro‑3‑deoxy‑D‑gluconate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base G (36/34); total (37/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATCACTTTTATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCGGTGTGGTTTTT > NC_000913/4101582‑4101856 | gATCACTTTTATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 1:1146766/1‑140 (MQ=255) aTCACTTTTATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g > 1:1248316/1‑140 (MQ=255) cTTTTATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg > 1:331168/1‑140 (MQ=255) ttttATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑g > 2:172398/1‑140 (MQ=255) aTTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑gggat < 2:390329/140‑4 (MQ=255) tAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCt > 2:134883/1‑140 (MQ=255) tAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCt > 1:301528/1‑140 (MQ=255) tAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCt > 1:269360/1‑140 (MQ=255) tAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggg < 2:1396117/128‑1 (MQ=255) tAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggg > 1:1396117/1‑128 (MQ=255) aatgaatgTCTATCTTCGTTTCCATCAGCACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCAGGGGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCTATTGAGAAAAGCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCg < 2:965089/140‑1 (MQ=255) aatgaatgTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCg < 1:961840/140‑1 (MQ=255) atgaatgTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGt < 2:1146766/140‑1 (MQ=255) tgTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGc > 1:1026630/1‑140 (MQ=255) gTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCt > 1:1115351/1‑140 (MQ=255) aTCTTCGTTTCCATCAACACTGACGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTc > 1:905683/1‑140 (MQ=255) tCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 2:409018/1‑140 (MQ=255) cGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg < 1:573443/140‑1 (MQ=255) tttCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg < 1:172398/140‑1 (MQ=255) tttCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg < 2:1026630/140‑1 (MQ=255) tttCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg > 2:1399584/1‑140 (MQ=255) tCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:989479/1‑140 (MQ=255) tCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 2:303134/140‑1 (MQ=255) tCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 2:1248316/140‑1 (MQ=255) tCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 2:269360/140‑1 (MQ=255) tCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 2:932258/140‑1 (MQ=255) tCCATCAACACTGACGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 2:905683/140‑1 (MQ=255) ccATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc < 2:331168/140‑1 (MQ=255) cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca < 2:1145550/140‑1 (MQ=255) cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca > 1:1145550/1‑140 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCacac > 1:1160596/1‑140 (MQ=255) aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 1:969674/1‑140 (MQ=255) aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 2:1096254/1‑140 (MQ=255) aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 2:1142453/1‑140 (MQ=255) aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 1:612977/1‑140 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt > 2:1294797/1‑126 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt < 1:1294797/126‑1 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCg > 1:491046/1‑140 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGc > 2:210477/1‑140 (MQ=255) ttGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCg > 1:58809/1‑140 (MQ=255) gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACATGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 2:952539/1‑140 (MQ=255) gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 1:1314415/1‑140 (MQ=255) aGGAATTACGCGTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg > 2:109440/1‑140 (MQ=255) aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa > 2:483871/1‑140 (MQ=255) aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa > 2:20159/1‑140 (MQ=255) cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGTGGaa < 2:491046/140‑1 (MQ=255) cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa < 1:1142453/140‑1 (MQ=255) cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa < 2:612977/140‑1 (MQ=255) gCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa < 2:301528/140‑1 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAat > 1:1261149/1‑140 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt < 2:58809/140‑1 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtttt > 2:603689/1‑140 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtttt > 1:276974/1‑140 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 1:908808/140‑1 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGAGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 1:20159/140‑1 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt < 2:1160596/140‑1 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt < 1:134883/140‑1 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt < 2:919383/140‑1 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:994792/1‑140 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc < 1:1392627/140‑1 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:291159/1‑140 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 2:509383/1‑140 (MQ=255) gCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCaa > 2:804060/1‑140 (MQ=255) gCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCaa > 1:662871/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACggg < 2:1102549/140‑1 (MQ=255) cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGga < 1:483871/140‑1 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGgatg < 1:1096254/140‑1 (MQ=255) tGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGgatgat < 1:409018/140‑1 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTAc < 2:46625/140‑1 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTAc > 1:115152/1‑140 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACg < 1:603689/140‑1 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACg < 2:994792/140‑1 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGc > 1:761746/1‑140 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGc < 1:48953/140‑1 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCt < 2:969674/140‑1 (MQ=255) cGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGc > 1:153167/1‑140 (MQ=255) cGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCg > 1:173875/1‑140 (MQ=255) aaTCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCGGTGTGGttt < 2:153167/140‑1 (MQ=255) aTCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCGGTGTGGtttt > 1:408729/1‑140 (MQ=255) aTCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCGGTGTGGttttt < 2:173875/140‑1 (MQ=255) | GATCACTTTTATTGATTAAATGAATGTCTATCTTCGTTTCCATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGATGATTACCGGTACGGTGCCCATTCTGGCGGTGTGGTTTTT > NC_000913/4101582‑4101856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |