| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,592,219 | T→C | E36G (GAA→GGA) | ugpB ← | sn‑glycerol 3‑phosphate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,592,219 | 0 | T | C | 98.0% | 363.2 / ‑2.3 | 102 | E36G (GAA→GGA) | ugpB | sn‑glycerol 3‑phosphate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (49/51); minor base A (1/1); total (50/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGCGTTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTT‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGC > NC_000913/3592083‑3592355 | cgcgTTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTc‑ccc < 2:1006383/140‑1 (MQ=255)cgcgTTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTc‑ccc < 1:207482/140‑1 (MQ=255) gcgTTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑cccc > 2:74135/1‑140 (MQ=255) tGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTcc > 2:19231/1‑140 (MQ=255) gCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCa > 2:1139605/1‑140 (MQ=255) ccGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCAt > 1:1168520/1‑140 (MQ=255) ggTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAg < 1:74135/140‑1 (MQ=255) cGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAAc > 2:311879/1‑140 (MQ=255) ggCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACg > 2:960696/1‑140 (MQ=255) ggCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACg > 1:1339830/1‑140 (MQ=255) ggCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACg > 2:902353/1‑140 (MQ=255) ggCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACg > 2:1078859/1‑140 (MQ=255) tCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATg > 1:992343/1‑140 (MQ=255) tCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATg > 2:1114893/1‑140 (MQ=255) ccccGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg < 1:729814/140‑1 (MQ=255) gcgcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgt < 1:620087/140‑1 (MQ=255) cgcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgtc > 1:784991/1‑140 (MQ=255) cgcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgtc < 2:1339830/140‑1 (MQ=255) gcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCATAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCa < 2:1392939/140‑1 (MQ=255) gcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCa > 1:490625/1‑140 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTCCCCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCa < 2:910927/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCAc < 2:784991/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCAc < 1:902353/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCAc < 2:627194/140‑1 (MQ=255) tAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTg < 1:19231/140‑1 (MQ=255) aaaTTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGc < 1:1169774/140‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg < 1:1296132/122‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg > 2:1296132/1‑122 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAt > 2:1096705/1‑140 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAt > 1:982003/1‑140 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCC‑GGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTATCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAtt > 1:128158/1‑140 (MQ=255) cGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTc > 2:243744/1‑140 (MQ=255) gTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc < 2:1168520/140‑1 (MQ=255) gTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc < 1:192336/140‑1 (MQ=255) tGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCAtt < 1:409884/140‑1 (MQ=255) ccTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc < 2:1119671/133‑1 (MQ=255) ccTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc > 1:1119671/1‑133 (MQ=255) ccTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTaa > 2:133359/1‑140 (MQ=255) ccTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTaa > 2:843565/1‑140 (MQ=255) gTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTcc > 1:98458/1‑140 (MQ=255) cGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGa > 2:1051965/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 1:571790/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 2:1122095/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 1:1129666/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 2:15213/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 2:958968/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTA‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc > 2:454006/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:614914/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:333570/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:432532/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 2:376109/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:803823/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcgc < 2:571790/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcgc > 2:1025089/1‑140 (MQ=255) cAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGcc < 1:1096705/140‑1 (MQ=255) cAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGcc < 1:243744/140‑1 (MQ=255) cAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGcc < 1:15213/140‑1 (MQ=255) cAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTA‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGcc < 1:454006/140‑1 (MQ=255) tttGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTg > 2:760425/1‑140 (MQ=255) ttGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTCCCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 1:925034/140‑1 (MQ=255) ttGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 2:366145/140‑1 (MQ=255) ttGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 1:857493/140‑1 (MQ=255) gTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTg < 2:1238877/140‑1 (MQ=255) gTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTg < 1:1417832/140‑1 (MQ=255) tAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGa < 1:1122095/140‑1 (MQ=255) tAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGa > 2:521846/1‑140 (MQ=255) aaTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGaa < 2:333570/140‑1 (MQ=255) aaTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGaa < 1:1078859/140‑1 (MQ=255) aaTCC‑GGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTATCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 2:128158/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 2:522022/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:1051965/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:290746/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:1025089/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:960696/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:843565/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:52520/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:574673/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:760425/140‑1 (MQ=255) tCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGc > 2:1259295/1‑140 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 1:475055/132‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc > 2:475055/1‑132 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTg > 2:627934/1‑140 (MQ=255) ggTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGta < 2:98458/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGta < 1:311879/140‑1 (MQ=255) aCGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCa < 2:982003/140‑1 (MQ=255) tGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACTCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGt < 2:490625/140‑1 (MQ=255) gggCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGtt < 2:833106/140‑1 (MQ=255) ggCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGttt > 1:173529/1‑140 (MQ=255) ggCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGttt > 1:1212516/1‑140 (MQ=255) ccAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAt < 2:432532/140‑1 (MQ=255) gagaATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc < 1:133359/140‑1 (MQ=255) agaATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctct < 1:677960/140‑1 (MQ=255) gaATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctctc < 1:769103/140‑1 (MQ=255) gaATCCACCTCTTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctctc < 2:1212516/140‑1 (MQ=255) ctctTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGTTCGTCACTGCCTGTGCATGCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTa > 2:1273191/1‑140 (MQ=255) ctctTTACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTa > 2:127403/1‑140 (MQ=255) tttACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCg > 1:988841/1‑140 (MQ=255) tACCCAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGaa > 2:425089/1‑140 (MQ=255) ccAGTC‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATgc > 2:1370655/1‑140 (MQ=255) aGTC‑CCCCTTCCATAGAATGACAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATgcgc > 1:1256662/1‑140 (MQ=255) | CGCGTTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTT‑CCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGC > NC_000913/3592083‑3592355 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |