Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 704,018 | A→G | A25A (GCA→GCG) | nagE → | N‑acetylglucosamine specific PTS enzyme IIABC component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 704,018 | 0 | A | G | 98.7% | 266.5 / ‑4.8 | 78 | A25A (GCA→GCG) | nagE | N‑acetylglucosamine specific PTS enzyme IIABC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (41/36); total (41/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
TGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGT > NC_000913/703883‑704153 | tGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGt > 2:1116129/1‑140 (MQ=255) agcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTtgc > 2:908438/1‑140 (MQ=255) agcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGGTCTCGCAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTtgc > 2:782947/1‑140 (MQ=255) gcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTtgct < 2:401898/140‑1 (MQ=255) aaataaaaataCGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCg > 2:116859/1‑140 (MQ=255) aataaaaataCGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGa > 2:1221034/1‑140 (MQ=255) aaaataCGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCg < 2:430950/140‑1 (MQ=255) aCGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAg < 2:362371/140‑1 (MQ=255) cTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAg > 1:173263/1‑140 (MQ=255) tGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGAt < 1:1221034/140‑1 (MQ=255) tGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGAt < 2:441833/140‑1 (MQ=255) aGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTa < 2:366095/140‑1 (MQ=255) aaaTAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGt < 1:116859/140‑1 (MQ=255) aaTAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGtt < 2:525805/140‑1 (MQ=255) ctcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTACCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTAtt > 1:241080/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg > 2:742444/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg > 2:329853/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg > 2:210041/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg > 1:172341/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg > 2:1067805/1‑140 (MQ=255) tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTg < 2:173263/140‑1 (MQ=255) gggggAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAg 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atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAtt > 1:580632/1‑140 (MQ=255) atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAtt > 2:1405464/1‑140 (MQ=255) atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAtt > 2:207615/1‑140 (MQ=255) atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAtt > 2:1019849/1‑140 (MQ=255) atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAtt > 2:1007282/1‑140 (MQ=255) tatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAttt > 1:999242/1‑140 (MQ=255) tttAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTg > 1:599854/1‑140 (MQ=255) ttAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTTCAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGa < 2:690808/140‑1 (MQ=255) tAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGAt > 1:135177/1‑140 (MQ=255) gTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAc > 2:805521/1‑140 (MQ=255) gTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAc < 1:329853/140‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAcc < 1:805521/140‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAcc < 2:172341/140‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAcc < 2:580632/140‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTACCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAcc < 2:241080/140‑1 (MQ=255) tttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCt < 1:1028830/140‑1 (MQ=255) tttttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCt < 1:1019849/140‑1 (MQ=255) tttCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCg > 2:368650/1‑140 (MQ=255) gACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc < 1:1007282/140‑1 (MQ=255) cTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCtt < 1:88817/140‑1 (MQ=255) ggTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGc < 2:534944/140‑1 (MQ=255) gTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGcc < 2:731431/140‑1 (MQ=255) gTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGcc < 2:38117/140‑1 (MQ=255) gggCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATc > 2:662117/1‑140 (MQ=255) gggCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATc > 2:589041/1‑140 (MQ=255) cGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgt > 2:231100/1‑140 (MQ=255) cGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgt > 1:1221851/1‑140 (MQ=255) gTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTGATCTTCGCCATCGgtg < 2:135177/140‑1 (MQ=255) gTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtg > 1:1242973/1‑140 (MQ=255) gTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtg < 2:599854/140‑1 (MQ=255) tACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGtgtg > 2:866796/1‑140 (MQ=255) tACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGtgtg > 2:1077751/1‑140 (MQ=255) aCAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTgg > 2:618750/1‑140 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 1:742444/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 1:458158/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 1:231100/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt > 2:1036171/1‑140 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 1:1167470/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 2:443001/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt < 1:1077751/140‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTgg < 2:999242/140‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGt < 1:207615/140‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGCCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGt < 1:1405464/140‑1 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGaaa > 1:1304623/1‑140 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGaaa > 1:101695/1‑140 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCCGTGTGGCATCCAGCTGGTCGaaa > 1:643553/1‑140 (MQ=255) ctgcCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGa < 2:1172579/140‑1 (MQ=255) ctgcCGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGa < 1:866796/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGCGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAg < 2:643553/140‑1 (MQ=255) ggcggcGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAAACAGCGCTg > 1:343462/1‑140 (MQ=255) cggcGCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTAAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGt > 1:492580/1‑140 (MQ=255) | TGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGT > NC_000913/703883‑704153 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |