| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,078,482 | A→G | intergenic (+348/‑93) | yeeW → / → yoeF | CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YeeW/CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YoeF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,078,482 | 0 | A | G | 98.7% | 261.0 / ‑5.2 | 77 | intergenic (+348/‑93) | yeeW/yoeF | CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YeeW/CP4‑44 prophage; putative uncharacterized protein YoeF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (41/35); total (41/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATAATGGAATGGACGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGT > NC_000913/2078345‑2078618 | aataatGGAATGGACGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCtgggtggg > 2:1219111/1‑140 (MQ=255)aataatGGAATGGACGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCtgggtggg > 2:815410/1‑140 (MQ=255) tggaCGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGaaaaa > 1:925995/1‑140 (MQ=255) aCGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCt > 1:1197035/1‑140 (MQ=255) gCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTaa > 1:1256707/1‑140 (MQ=255) cccGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGc < 1:842500/140‑1 (MQ=255) cccGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGc < 1:234129/140‑1 (MQ=255) aTGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGaaa < 1:815410/140‑1 (MQ=255) aTGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGaaa < 1:1416539/140‑1 (MQ=255) tGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGaaaa > 1:380463/1‑140 (MQ=255) tGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGaaaa < 2:380463/140‑1 (MQ=255) aCGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTa < 2:760617/140‑1 (MQ=255) aCGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTa > 2:14611/1‑140 (MQ=255) aGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTa < 2:1174253/140‑1 (MQ=255) ttACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTc > 2:753255/1‑140 (MQ=255) tACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCa > 2:3775/1‑140 (MQ=255) tACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCa > 1:421304/1‑140 (MQ=255) aCTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCaa > 1:1266369/1‑140 (MQ=255) cTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAAc > 2:506826/1‑140 (MQ=255) gATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGt > 1:880678/1‑134 (MQ=255) gATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGt < 2:880678/134‑1 (MQ=255) aTAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGa > 1:351257/1‑140 (MQ=255) aTAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGa > 1:1233782/1‑140 (MQ=255) aTAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGa > 1:923651/1‑140 (MQ=255) tAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg < 2:1164233/140‑1 (MQ=255) tAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg < 1:14611/140‑1 (MQ=255) tAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg > 2:832127/1‑140 (MQ=255) tAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg < 1:50968/140‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGc > 1:619415/1‑140 (MQ=255) aaCCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCa < 2:681814/140‑1 (MQ=255) ccTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCAcc > 2:1209593/1‑140 (MQ=255) tCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTa < 2:619415/140‑1 (MQ=255) gAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg < 1:1303719/126‑1 (MQ=255) gAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg > 2:1303719/1‑126 (MQ=255) gTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg < 2:442675/123‑1 (MQ=255) gTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAg > 1:442675/1‑123 (MQ=255) gTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCtta > 1:440543/1‑140 (MQ=255) gCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatt < 2:165973/140‑1 (MQ=255) gTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttattta < 2:925995/140‑1 (MQ=255) ttATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatttat > 2:638258/1‑140 (MQ=255) ttATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatttat > 1:1229029/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTgg > 1:1119027/1‑140 (MQ=255) ggCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGt < 1:753255/140‑1 (MQ=255) ccGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTga > 2:1374553/1‑140 (MQ=255) tttAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAAc > 1:168606/1‑140 (MQ=255) tAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTa < 1:3775/140‑1 (MQ=255) tAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTa < 2:1197035/140‑1 (MQ=255) aTTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTc < 1:638258/140‑1 (MQ=255) ttAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGAACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTcc > 2:898887/1‑140 (MQ=255) tAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACt < 2:106972/132‑1 (MQ=255) tAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACt > 1:106972/1‑132 (MQ=255) tAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCa < 2:1229029/140‑1 (MQ=255) tAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCa > 2:1087185/1‑140 (MQ=255) aGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTc > 1:615564/1‑137 (MQ=255) aGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTc < 2:615564/137‑1 (MQ=255) gACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAgg > 2:828047/1‑140 (MQ=255) aCCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAACGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGa > 2:767381/1‑140 (MQ=255) ccTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAg < 1:832127/140‑1 (MQ=255) tGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGtt < 1:1087185/140‑1 (MQ=255) aCAAAAAGTGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCg > 2:294929/1‑140 (MQ=255) aCAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCg > 2:461345/1‑140 (MQ=255) aCAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCg > 2:1094042/1‑140 (MQ=255) cAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGt < 2:1256707/140‑1 (MQ=255) cAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGt > 1:1386764/1‑140 (MQ=255) aaaTGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAac > 2:786207/1‑140 (MQ=255) tGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACg < 2:168606/140‑1 (MQ=255) aaTTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAacac > 2:430698/1‑137 (MQ=255) aaTTCCAAATCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAacac < 1:430698/137‑1 (MQ=255) aaaTCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAgg < 1:1310079/140‑1 (MQ=255) aTCCACGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGc < 2:440543/140‑1 (MQ=255) cGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTc > 1:34276/1‑140 (MQ=255) cGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTc > 2:372376/1‑140 (MQ=255) cGGTCTGGGTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGAACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTc > 2:1408208/1‑140 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt < 1:828047/140‑1 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt < 1:233347/140‑1 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt < 2:351257/140‑1 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt < 1:923392/140‑1 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt < 1:1209593/140‑1 (MQ=255) ggTGGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGt > 1:1193542/1‑140 (MQ=255) | AATAATGGAATGGACGCCCCGACCATGAAGCAACGGTAGGATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGT > NC_000913/2078345‑2078618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |