| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 328,751 | T→G | D195A (GAT→GCT) | betI ← | DNA‑binding transcriptional repressor BetI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 328,751 | 0 | T | G | 100.0% | 49.1 / NA | 15 | D195A (GAT→GCT) | betI | DNA‑binding transcriptional repressor BetI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (8/7); total (8/7) | |||||||||||
GCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTC > NC_000913/328627‑328881 | gCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGt < 2:556687/133‑1 (MQ=255) ccGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTg > 1:351051/1‑133 (MQ=255) gTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCg > 2:410690/1‑133 (MQ=255) aaTGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGt < 2:376544/133‑1 (MQ=255) tcGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTTTATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGCCAAGGaa > 1:89146/1‑133 (MQ=255) gTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAgc‑g < 2:351051/133‑1 (MQ=255) tggtggCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCGCGGAATTATC‑GACGGGgtttt > 1:455187/1‑132 (MQ=255) tataAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTGAGGGGAGTAGCGG‑GGGGGTTTTTTCGCCGGTTTG‑CGCTCCGAGgcgcgc > 2:363954/1‑133 (MQ=255) ataAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGTTGCGGGAAATATT‑G‑CGGGGGTTTTTCTGCGGGTTGCCCCCCCGAGCcgcgcg > 2:53174/1‑133 (MQ=255) tgctgTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGTAGGGGGTTAAC‑G‑GGGGGTTTTTTTATCGGGTTGGCGCTCCCAGCCgcgcgcgggccc > 2:554730/1‑127 (MQ=255) tCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAg < 1:470142/133‑1 (MQ=255) aTCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTTTCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGcc < 2:89146/133‑1 (MQ=255) tCACGTCTCCTCGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCa < 1:554730/133‑1 (MQ=255) ctcctcGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTc < 1:539091/133‑1 (MQ=255) ctcGGTTAAGCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGAATAGC‑G‑CGGGGTTTTTTCAACGGGTTTCCGCTCAGAGCCGCGCGCCGCCATAAACCATCAATCAACGCGGCCCGGCCGGAGc > 2:439547/1‑133 (MQ=255) ggTTAAGCGGGGGGTAGATGCTGACTGACAAACTGGCGGGTGAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCg < 2:254140/133‑1 (MQ=255) | GCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGC‑G‑CGGGTTTTATCCAGCGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTC > NC_000913/328627‑328881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |