| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 417,935 | T→C | L16P (CTT→CCT) | phoR → | sensory histidine kinase PhoR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 417,935 | 0 | T | C | 100.0% | 53.4 / NA | 16 | L16P (CTT→CCT) | phoR | sensory histidine kinase PhoR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/6); total (10/6) | |||||||||||
ATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTGCGCCTTTCATGGTGGCTGTGGG > NC_000913/417807‑418063 | atatCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTtgc < 2:566735/133‑1 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGcc > 2:337052/1‑133 (MQ=255) ttCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCg > 1:147692/1‑133 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCt > 1:365905/1‑133 (MQ=255) aCTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGTATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTATGCTAGCATCGGTaa > 2:236162/1‑133 (MQ=255) aCTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTaa < 1:538449/133‑1 (MQ=255) tATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCTCTGGTTTGTGCGGGGATCGGTGACAGGACt > 1:176449/1‑133 (MQ=255) tCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGc > 1:508413/1‑133 (MQ=255) cTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGc < 2:365905/133‑1 (MQ=255) cTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGCGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGc > 2:363422/1‑133 (MQ=255) tGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCa > 1:124393/1‑133 (MQ=255) cTGTCGTGGACAAGGTTGGTGCTGCAGCCGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGa < 2:176449/133‑1 (MQ=255) gAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTg < 2:508413/133‑1 (MQ=255) aGCTGCTACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTGCGCCTTTCATGGTGGCt < 2:147692/133‑1 (MQ=255) tgctACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTGCGCCTTTCATGGTGGCtgtg > 1:512921/1‑133 (MQ=255) ctACCTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTGCGCCTTTCATGGTGGCTgtggg > 1:462030/1‑133 (MQ=255) | ATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTGGCATTTCTGGAATTTATTGCGCCTTTCATGGTGGCTGTGGG > NC_000913/417807‑418063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |