Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 522,457 | T→G | L681R (CTG→CGG) | ybbP → | putative ABC transporter membrane subunit YbbP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 522,457 | 0 | T | G | 100.0% | 69.0 / NA | 20 | L681R (CTG→CGG) | ybbP | putative ABC transporter membrane subunit YbbP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (12/8); total (12/8) |
TCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCT > NC_000913/522331‑522586 | tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGt < 2:443001/133‑1 (MQ=255) tGGGAGAATGACAACGGCATGTTGTCACTACCCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGAtgg < 2:219410/133‑1 (MQ=255) cGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCAcc < 1:329740/133‑1 (MQ=255) tttgaacacacCTAAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGGTGGTGGTACTGGTCACCGCCTg < 2:157421/128‑1 (MQ=255) ttcgACACAACCCAAGCGCCAGTTCCCGACAATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGc < 1:236512/130‑1 (MQ=255) gTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGc > 2:45608/1‑133 (MQ=255) ttGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCg < 1:516745/133‑1 (MQ=255) tGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCgg < 1:45608/133‑1 (MQ=255) ccAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGttgctgttgctg > 2:323161/1‑133 (MQ=255) ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggcgcaggt > 2:36026/1‑133 (MQ=255) ttAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTCCGGTATGTAGCTGTTGGTGGCACAGGTGCATGTGGGAATgc > 2:240501/1‑133 (MQ=255) atatTGGCGCCATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGAAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtca < 2:188358/133‑1 (MQ=255) gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcgtca > 2:426362/1‑133 (MQ=255) gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcgtca > 1:20351/1‑133 (MQ=255) gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcgtca > 2:88372/1‑133 (MQ=255) ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg > 1:586108/1‑133 (MQ=255) ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGACATCAGGAGCTGgtggtg > 1:257036/1‑133 (MQ=255) gtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGgtgt > 2:582688/1‑133 (MQ=255) gtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCAGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGgcg > 2:102896/1‑133 (MQ=255) gTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCGGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCacac > 2:143127/1‑133 (MQ=255) cgcgGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActgct < 1:582688/133‑1 (MQ=255) | TCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCACCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCT > NC_000913/522331‑522586 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |