Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 92,197 | C→T | A262V (GCC→GTC) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 92,197 | 0 | C | T | 96.8% | 97.1 / NA | 31 | A262V (GCC→GTC) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (16/14); total (16/15) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACG > NC_000913/92075‑92316 | ttcttcTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCtggtg > 1:354668/1‑133 (MQ=255) ttcttcTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCtggtg > 1:439134/1‑133 (MQ=255) tACTGACAGGGAGGCTGCGCACAACCGGCCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTc < 2:286948/133‑1 (MQ=255) tACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTc > 2:22992/1‑133 (MQ=255) tACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTc < 1:425263/133‑1 (MQ=255) cTGACAGCCAGGCAGCGCACAATCTGGCGCAGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGGGAACTGAACAACGAGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCaa < 1:206313/133‑1 (MQ=255) aCAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAacac > 1:554592/1‑133 (MQ=255) aCAGCCAGCCAGCGCCCACCCTTGCGCTGACTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCTAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAacac < 1:301047/133‑1 (MQ=255) cAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTCGCGTCGTGCTGATGAATGTCAACACCGGTg > 1:298247/1‑133 (MQ=255) ggCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGTGTCGTGCGGGTGGAGGTCAACTCCGGTGaa > 1:166341/1‑133 (MQ=255) cgcACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCt > 1:521942/1‑133 (MQ=255) caACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCg < 2:521942/133‑1 (MQ=255) caACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCg < 1:515685/133‑1 (MQ=255) ggCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCt > 2:62692/1‑133 (MQ=255) aGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGcc > 1:138836/1‑133 (MQ=255) aGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGcc < 2:439134/133‑1 (MQ=255) gatgaACGCACGCAGTCGCTGGTTGAGCGCGATCTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCAt < 2:298247/133‑1 (MQ=255) atgaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATa < 1:4162/133‑1 (MQ=255) tgaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATAc < 2:138836/133‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACaa < 1:22992/133‑1 (MQ=255) cGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAAcc < 1:128093/133‑1 (MQ=255) aaCTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACATTCTGAGCGGGACGCCGaa > 1:302307/1‑133 (MQ=255) aaCTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAAAAGCCCGTCCTACCACCATAACAATCTGAGCGCCACGCCGaa > 2:269932/1‑133 (MQ=255) aacaacGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGTTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAgg > 1:45185/1‑133 (MQ=255) aacaacGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAgg > 2:424017/1‑133 (MQ=255) gTGGCCTTTAGCAAGGCTGAATCTGGTACCGCCGTGCTGGTCGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTa < 2:201480/133‑1 (MQ=255) tGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTaa > 2:575936/1‑133 (MQ=255) ggCTGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTTAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGGGCGGCACGACGAAAGAGGCGATGCGGAACCGTACCATCAcc > 2:171798/1‑133 (MQ=255) tGAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTAGATATCAACACCGGTGCAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGAc < 2:268653/133‑1 (MQ=255) gAATCTGGTATCGTCTTGCTGGTGAATGCCAACACCGGTGACGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACg < 2:166341/133‑1 (MQ=255) gAATCTGGTAGCGTCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACg > 1:599445/1‑133 (MQ=255) | TTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACG > NC_000913/92075‑92316 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |