Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 2,982,381 Δ1 bp intergenic (‑199/+116) araE ← / ← kduD arabinose:H(+) symporter/putative 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate dehydrogenase

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009132,982,3790A.100.0% 191.5 / NA 45intergenic (‑197/+118)araE/kduDarabinose:H(+) symporter/putative 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate dehydrogenase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base . (18/27);  total (18/27)

GGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGC  >  NC_000913/2982247‑2982505
                                                                                                                                    |                                                                                                                              
ggTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATa                                                                                                                                >  1:104358/1‑133 (MQ=255)
    ggAAACAGCATAAATATGTATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATaagtt                                                                                                                            >  2:504199/1‑130 (MQ=255)
    ggAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATaagtt                                                                                                                            >  2:314638/1‑130 (MQ=255)
            cATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGTTAAAATTCATAAGTTCATTAAtt                                                                                                                   >  2:277977/1‑133 (MQ=255)
                 atatGGATTAAATTGCTGGGACTTGTCGTTCTGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGAtaa                                                                                                              <  1:210144/133‑1 (MQ=255)
                  tatGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGAtaat                                                                                                             <  1:482410/133‑1 (MQ=255)
                    tGGATTAAATGGCTGAGACATGTCGTTAAGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGAtaatta                                                                                                           <  2:243961/133‑1 (MQ=255)
                      gATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGAtaattaat                                                                                                         >  2:428254/1‑133 (MQ=255)
                         tAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATg                                                                                                      >  2:501906/1‑133 (MQ=255)
                            aTTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGat                                                                                                   <  1:41602/133‑1 (MQ=255)
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                                ctacGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGat                                                                                                   <  2:503990/126‑1 (MQ=255)
                                ctacGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGat                                                                                                   >  1:503990/4‑129 (MQ=255)
                                 tgcGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAGAATTCATAAGTTCATTGATTGATAACTAATCTGGATTAttt                                                                                              >  2:163668/1‑133 (MQ=255)
                                   cGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCa                                                                                            <  2:104358/133‑1 (MQ=255)
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                                         gTCGTTATGTCATGGCTATTCCAACTTTAAAACTAAGTTGACTTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCa                                                                                      <  2:135724/133‑1 (MQ=255)
                                             ttATGTGATGTATATCCCAATTTTCAAATTAACTTGAATTACTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGat                                                                                  <  2:132483/133‑1 (MQ=255)
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                                             ttATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGat                                                                                  <  2:406924/133‑1 (MQ=255)
                                             ttATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGat                                                                                  <  1:428254/133‑1 (MQ=255)
                                             ttATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGat                                                                                  <  1:501906/133‑1 (MQ=255)
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                                                     tGGATATTACAATTTCCAGATTGAGTTGAAGTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTa                                                                          <  1:237991/133‑1 (MQ=255)
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                                                                                                     accaccTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATaaa                          >  1:64590/1‑133 (MQ=255)
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                                                                                                         ccTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTa                      >  1:262275/1‑133 (MQ=255)
                                                                                                                    agcagATAAAATTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaatgaa           >  1:67949/1‑133 (MQ=255)
                                                                                                                        gagaaaaTTCATAATTTCATCAGTTGATAATTAATATGGATTATTTAATAGACATGTTATAGATTATGATGAACTAAAGATATAAAAAACCTTGTCATGCAGCAAGGTTATAAAAGTTAGAAATATGAAttta       >  2:254024/4‑131 (MQ=255)
                                                                                                                             aaTTCATAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACgcgc  <  1:32104/133‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                    |                                                                                                                              
GGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGC  >  NC_000913/2982247‑2982505

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: