Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,494,795 | (G)5→6 | coding (785/2544 nt) | nirB → | nitrite reductase catalytic subunit NirB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,494,790 | 1 | . | G | 100.0% | 57.0 / NA | 18 | R260R (CGT→CGG) | nirB | nitrite reductase catalytic subunit NirB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (7/11); total (7/11) |
AGGTGTTGAAGCGCGTAAAACCATGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGT‑GGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTACAAAATGGCGCA > NC_000913/3494658‑3494912 | aGGTGTTGAAGCGCGTAAGACCGTGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCAGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGt < 1:252425/133‑1 (MQ=255) gtgtTGAAGCGCGTAAAACCATGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGT‑gg < 2:283360/133‑1 (MQ=255) tgtTGAAGCGCGTAAAACCATGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGT‑ggg > 1:414776/1‑133 (MQ=255) cgTAAAACCATGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTc < 2:414776/133‑1 (MQ=255) aTGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGAt < 2:274322/133‑1 (MQ=255) gCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCg < 2:479218/133‑1 (MQ=255) gCAGCGAACTCGAAGTCGACTTTATCGTTTTCCCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCg < 2:130906/133‑1 (MQ=255) gAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCg < 1:262925/133‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCgg < 1:266952/133‑1 (MQ=255) cTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCAt < 2:442062/133‑1 (MQ=255) tATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCgg > 2:77381/1‑133 (MQ=255) ttctCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTATGCCATCGGTGAATgc > 2:258581/1‑133 (MQ=255) tACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATgcg < 2:118875/129‑1 (MQ=255) tACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATgcg > 1:118875/1‑129 (MQ=255) ggTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTgg < 2:304326/133‑1 (MQ=255) gTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGa > 1:370388/1‑133 (MQ=255) cccAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTATGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCAc < 1:258581/133‑1 (MQ=255) gtgGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCt > 1:68028/1‑133 (MQ=255) tgGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTa < 1:293315/133‑1 (MQ=255) aCGTTGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTACAAAATgg > 1:17914/1‑133 (MQ=255) tGCTCCGCGTGGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAAACGTGTATTTGGTTTGGAAGCACCTGGCTACCAAATGGCGCa > 2:147509/1‑133 (MQ=255) | AGGTGTTGAAGCGCGTAAAACCATGCGTTTTGCCGACGGCAGCGAACTGGAAGTCGACTTTATCGTCTTCTCTACCGGTATCCGTCCGCGCGATAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGT‑GGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTACAAAATGGCGCA > NC_000913/3494658‑3494912 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |